IIS在控制面板->添加或删除程序 ->添加/删除Windows组件 ->Internet信息服务(IIS)添加;
2、cache(Ensemble)安装步骤总共十二步
3.安装完成后 shutdown数据库。
4.拷贝原库Cache.cpf到EnsembleSys根目录下,cpf中主要配置数据库存放路径,根据事情情况可以自己修改cpf文件,或者在System management Portal->Local Databases->Home->Configuration->Local Databases->Edit
5.拷贝Cache.key到EnsembleSys\Mgr根目录下;
核酸序列数据库(genbank)和基因组数据库(ensemble)的区别:1、GenBank
是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。
2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来,便于查询。Ensemble可从药品专利开始,再通过其临床前和临床研究资料,直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次,每年增加约10,000
种新化合物。
Ensembl
http://www.ensembl.org/index.html
1.选择物种,搜索基因。
2.点击进入基因的summary页面。
3.点击左侧sequence,得到序列信息。
4.橘色背景红色字体序列为exon区域,第一个外显子前边的序列即为promoter序列,默认设置为600bp。
5.若想获取更长的promoter序列,点击左侧“Configure this page”重新配置。
6.修改5' Flanking sequence (upstream),例如修改为1000,保存并关闭,即可得到更新后1000bp的promoter序列。
7.在UCSC中核实(Ensembl和UCSC注释之间就TSS的识别可能存在差异)。复制启动子序列,在UCSC进行blat,点击第一条的browser进入基因组浏览界面,zoom out 3X,查看页面确保启动子序列符合UCSC注释(输入的序列在目标基因的第一个exon之前,序列区域内有CpG岛)。
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