R语言读数据

杀杀

记录一些R语言读入数据的方法还有可能遇到的问题~

读入数据时，需要先了解数据文件的类型（也就是看后缀）。一般就能够知道数据的类型和分隔符等信息。

另外，如果能够用excel预览一下数据的话，可以先看看数据是否有行列名。有些数据会有两列的行名，如基因名-基因id-表达值······，特殊的数据需要额外的处理。

还需要注意一下matrix和data.frame的数据结构，matrix中只能有一种数据类型，这意味着如果在读入数据时不进行合适的处理，R会将数值强行读成字符型，造成读数据的错误。

当用excel存储过之后，再用R处理时，会提示你行名重复，其实根本没有重复。因此建议不要用excel保存这种数据，一定要编辑可以使用notepad++或者ultra edit等软件。

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read.xx的函数是R的内置函数，可以直接读取，并且设置一些参数

这些函数读取后都默认为data.frame，如果需要矩阵请使用as.matrix转换。

一定要赋值，不然R语言会把大大的矩阵print出来。

如果是没怎么见过的类型：

这个函数会自动识别你的分隔符，并且把第一行设为列名，但是没办法指定行名，需要读入以后自己设置

跟read.delim类似，可以读各种类型的文件以及非常大的文件：

读取后默认是一种data.table的数据类型，需要通过as.matrix/as.data.frame转换后使用。

像perl语言一样，逐行读取数据具有很大的优势

（万一文件超多行对吧）对于那种几个G的文件，全部读进来可能会导致你的电脑死机，所以我们可以先读几百行进来看看，或者分批读取，这样不会占用电脑太大内存，读取方法和上文的一次性读入有所不同-随便找个文件举例：

接下来继续读入数据，比如说我现在想读4行，因为文件是txt类型，所以分隔设为\t

第一种：把excel中所有sheet的表格读入为data.frame，并分别命名为每个sheet的名称

---请忽略硬核打码

第二种：把excel中所有sheet的表格读入为矩阵，并放进一个list中

R语言批量读文件

批量读excel的xlsx文件原理是和读其它文件一样的。

学到了新的会持续更新哟~

R语言可以使用read.xlsx()函数来读取excel数据文件，也可以使用read.csv()函数来读取csv格式的数据文件。此外，还可以使用R包RODBC来连接数据库，从而将数据文件存储在数据库中，便于管理和 *** 作。另外，还可以使用R语言的XML包来解析XML格式的数据文件，从而将其导入R语言中进行处理分析。

在R语言里面，有很多读取数据的方法。R能读文本文件，csv格式文件，通过RODBC包读取数据库数据等等。下面我介绍几种最基本的读取数据的方法！

工具/原料

RStudio

方法

不管是读取数据还是写入，R都是在工作路径中完成的。所以首先我们要知道我们的R所在的工作路径是在哪里。使用getwd()函数来获取我们的工作路径。

下面查看工作路径里面有哪些文件，使用dir()函数

如果你所想导入的数据并不在你当前的工作路径中，有两种方法可以解决。第一种就是把数据文件放到工作路径中，第二种方法就是更改工作路径。更改工作路径使用setwd()函数。比如你想要把工作路径设置成桌面

现在我读取我工作路径中，名字为hw1_data.csv的文件。使用read.csv()函数

也可以使用read.table()函数来读取csv格式的文件。由于csv文件的分隔符是“，”所以我们在用read.table()函数的时候，sep参数，我们要设定为sep=“，”

发现read.table()读出来的数据，列名并不是我们文件中的列名，而是V1，V2。。。我们需要加上header这个参数来修改这个问题

另外在read.table()函数族中还有很多参数，对我们读取数据都有帮助，大家可以去了解下。使用？read.table()进行了解

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