你说的这三类都是非编码RNA,不编码蛋白质 smallRNA一般指用来描述细菌中发现的那些微小RNA,不过也被用于描述其他物种的非编码RNA,比如microRNA,siRNA,snoRNA等等,一般长度在20-30个核苷酸microRNA属于smallRNA的一种,长度在22个核苷酸左右,通过靶向靶基因的3‘UTR抑制或者降解靶基因的表达,从而达到调控基因表达的目的lncRNA是最近才火起来一类非编码RNA,长度大于200个核苷酸,作用机制尚不太十分明确 目前已经有很多成熟的数据库来存储这些非编码RNA,比如mirbase,tarbase,lncRNAdb,lncipedia等等,你可以去这些数据库查找你想要的信息
希望能帮到你
嘿嘿,这个很简单,我来告诉你:你首先登入mirbase数据库,进入到download页面,其实就是这个网址:>
如果是生物专业背景,那么将来大部分的工作将会是使用专门的生物信息学分析软件。所以难度会降低。自学的话,主要学几下几点就好:
1、一门脚本语言,个人推荐Python(Perl也可以,各有利弊,Python更新兴一些)。
2、Linux系统。这个也不是百分百要求,但是专业的生信人,都是用Linux的,而且很多软件都是不支持Windows的。
3、常用的生物信息学数据库,这里列出几个,NCBI,Ensembl,EBI,GENEbank等等,这些数据库下面还分子数据库,像GEO,GWAS catalog等。当然,还有方向更细的,像miRBase(miRNA数据库)等。
4、R,这也是一种编程语言,但更加侧重结果的展示,实际上也就是画图。
5、常用生信分析软件,这个没必要专门去学,需要用到他们的时候再学也不晚,都是很简单的东西。
如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,RNA22,mirbase,PITA,microcosom等等
以上就是关于lncRNA和microRNA、smallRNA的关系 从定义,特别是长度、作用、产物来说明~全部的内容,包括:lncRNA和microRNA、smallRNA的关系 从定义,特别是长度、作用、产物来说明~、如何下载TSA数据库中序列的信息、生物专业怎么开始生物信息学等相关内容解答,如果想了解更多相关内容,可以关注我们,你们的支持是我们更新的动力!
欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出
评论列表(0条)