酶的命名
①习惯(_xi2 guan4)命名法
多年来普遍使用的酶的习惯名称是根据以下三种原则来命名的:一是根据酶作用的性质,例如水解酶、氧化酶、转移酶等;二是根据作用的底物并兼顾作用的性质,例如淀粉酶、脂肪酶和蛋白酶等;三是拮合以上两种情况并根据酶的来源而命名,例如胃蛋白酶、胰蛋白酶等
习惯命名法一般采用底物加反应类型而命名,如蛋白水解酶、乳酸脱氢酶、磷酸己糖异构酶等对水解酶类,只要底物名称即可,如蔗糖酶、胆碱酯酶、蛋白酶等有时在底物名称前冠以酶的来源,如血清谷氨酸-丙酮酸转氨酶、拓液淀粉酶等 习惯命名法简单,应用历史长,但缺乏系统性,有时出现曰酶数名或一名数酶的现象
②系统命名法
鉴于新酶的不断发现和过去文献中对酶命名的混乱,国际酶学委员会规定了一套系统的命名法,使一种酶只有一种名称系统命名法以4个阿拉伯数字来代表一种酶例如α-淀粉酶(习惯命名)的系统命名为α - l4 - 葡萄糖-4葡萄糖水解酶,标示为:EC 3211EC代表国际酶学委员会,其中的第一个数字分别代表酶的大类,以1,2,3,4,5,6来分别代表,1为氧化还原酶类,3为水解酶类,其余(wei4 shui3 jie3 mei2 lei4 _qi2 yu2)类推(见酶的分类)第二个数字为酶的亚类,酶的每一大类下有若干个亚类:如在氧化还原酶中的亚类按供电子体的基团分类,如以CH-OH为电子供体标为1,醛基为电子供体标为2,余类推;转移酶中以转移的基团为亚类;水解酶中以水解键连接的形式为亚类;裂肉酶中以裂肉键的形式为亚类;亚类一般较多,达数十个标示中的第三个数字是属酶的次亚类,是在亚类的基础上再细分的类型,该次亚类中,氧化还原酶按电子受体基团分类,如都以CH-OH为电子供体的反应,可以有不同的电子受体,如以NAD+或NADP+为受体标为1,余类推;转移酶的次亚类也按接受基团分类,如以-OH接受转移基团,该次亚类标为1总之,酶的系统名称中前三个数字表示酶作用的方式第四个数字则表示对相同作用的酶的流水编号
又如对催化下列反应酶的命名(you4 ru2 dui4 cui1 hua4 xia4 lie4 fan3 ying1 mei2 de0 ming4 ming2 _)
ATP+D—葡萄糖→ADP+D—葡萄糖-6-磷酸
该酶的正式系统命名是:ATP:葡萄糖磷酸转移酶,表示该酶催化从ATP中转移一个磷酸到葡萄糖分子上的反应它系统命名是:EC2711,第1个数字“2”代表酶的分类名称(转移酶类),第2个数字“7”代表亚类(转移磷酸基),第3个数字“1”代表次亚类(以羟基作为受体的磷酸转移酶类),第4个数字“1”代表该酶在次亚类中第号(D-葡萄糖作为磷酸基的受体) 健康名言:身体在健康在很大程度上取决于精神的健康(约翰·格雷) 7242 核酶的分类自1982年以来,被发现的核酸类酶磷酸转移酶类),第4个数字“1”代表该酶在次亚类中第号(D-葡萄糖作为磷酸基的受体)
核酶的分类
自1982年以来,被发现的核酸类酶(R-酶)越来越多,对它的研究也越来越深入和普遍但是由于历史不长,对于其分类和命名还没有统一的原则和规定但根据酶催化反应的类型,区分为分子内催化R-酶和分子间催化R-酶,根据作用方(mei _gen ju zuo yong fang)式将R-酶分为3类:剪切酶、剪接酶和多功能酶现将R-酶的初步分类简介如下:
(1)分子内催化R-酶 分子内催化的R-酶是指催化本身RNA分子进行反应的一类核酸类酶这类酶是最早发现的R-酶该大类酶均为RNA前体由于这类酶是催化本身RNA分子反应,所以冠以“自我”(self)根据酶所(gen1 ju4 mei2 suo3)催化的反应类型,可以将该大类酶分为自我剪切和自我剪接两个亚类
①自我剪切酶(self-cleavage ribozyme) 自我剪切酶是指催化本身RNA进行剪切反应(jin xing jian qie fan ying)的R-酶具有自我剪切功能的R-酶是RNA的前体它可以在一定条件下催化本身RNA进行剪切反应,使RNA前体生成成熟的RNA分子和另一个RNA片段②自我剪接酶(self-splicing ribozyme) 自我剪接酶是在一定条件下催化本身RNA分子同时进行剪切和连接反应的R-酶自我剪接酶都是RNA前体它可以同时(qian ti _ta ke yi tong shi)催化RNA前体本身的剪切和连接两种类型的反应根据其拮构特点和催化特性的不同,该亚类分为两个小类,即含Ⅰ型间隔序列(intervening sequence IVS)的R-酶和含Ⅱ型 IVS的R-酶(2)分子间催化R-酶 分子间催化R-酶是催化其他分子进行反应的核酸类酶根据所作用的底物分子的不同,可以分为若干亚类①作用于其他RNA分子的R-酶 该亚类的酶可催化其他RNA分子进行反应根据反应的类型不同,可以分为若干小类,如RNA剪切酶、多功能R-酶等②多功能R-酶 多功能R-酶是指能够催化其他RNA分子进行多种反应的核酸类酶 例如,1986年,切克等人发现四膜虫26 S RNA前体通过自我剪接作用,切下的间隔序列(IVS)经过自身环化作用,最后得到一个在其5′-末端失去19个核苷酸的线状RNA分子,称为L-19 IVS它是一种多功能R-酶,能够催化其他RNA分子进行多种类型的反应③作用于DNA的R-酶 该亚类的酶是催化DNA分子进行反应的R-酶1990年,发现核酸类酶除了以RNA为底物外,有些R-酶还可以DNA为底物,在一定条件下催化DNA分子进行剪切反应据目前所知的资料,该亚类R-酶只有DNA剪切酶一个小类④作用于多糖的R-酶 该亚类的酶是能够催化多糖分子进行反应的核酸类酶兔肌14-A-D-葡聚糖分支酶 [EC 2 4118]是一种催化直链葡聚糖转化为支链葡聚糖的糖链转移酶,分子中含有蛋白质和RNA其RNA组分由31个核苷酸组成,单独具有分支酶的催化功能,即该RNA可以催化糖链的剪切和连接反应,属于多糖剪接酶⑤作用于氨基酸酯的R-酶 1992年,发现了以催化氨基酸酯为底物的核酸类酶该酶同时具有氨基酸酯的剪切作用、氨酰基-tRNA的连接作用和多肽的剪接作用等功能由于蛋白类酶和核酸类酶的组成和拮构不同,命名和分类原则有所区别为了便于区分两大类别的酶,有时催化的反应相同,在蛋白类酶和核酸类酶中的命名却有所不同例如,催化大分子水解生成较小分子的酶,在核酸类由于蛋白类酶和核酸类酶的组成和拮构不同,命名和分类原则有所区别为了便于区分两大类别的酶,有时催化的反应相同,在蛋白类酶和核酸类酶中的命名却有所不同例如,催化大分子水解生成较小分子的酶,在核酸类酶中的称为剪切酶,在蛋白类酶中则称为水解酶;在核酸类酶中的剪接酶,与蛋白类酶中的转移酶亦催化相似的反应等
酶的分类机体细胞中的酶,按其所参加酶促反应的性质,分为六大类。(1)氧化还原酶类氧化还原酶类催化氧化还原反应。常见的氧化还原酶有酚酶、脂肪氧合酶和过氧化物酶等。其中,酚酶可以氧化酚类和醇类化合物,生成醌或酮,脂肪氧合酶可以使不饱和脂肪产生过敏化物的臭味;过氧化物酶则可以催化分解过氧化氢和其他有机过氧化物。(2)转换酶类转换酶类主要催化功能基团的转移反应。例如在蛋白质代谢过程中,具有重要作用的转氨酶,就是一种氨基转换酶类。(3)水解酶类水解酶类主要催化水解反应。重要的水解酶有淀粉酶、脂酶、蛋白酶和核酸酶等。其中,淀粉酶可以使淀粉水解,变成糊精、麦芽糖和葡萄糖;脂酶可以使脂肪水解,产生甘油二酯、甘油一酯、甘油以及脂肪酸;蛋白酶可以使蛋白质发生水解,主要生成肽类以及氨基酸;核酸酶则可以使核苷酸消化水解为核苷酸、核苷和碱基。(4)裂合酶类裂合酶类又称为脱加酶类,它主要催化从底物上移去一个基团而留下双键的反应或其逆反应。重要的裂合酶有醛缩酶、水化酶及脱羧酶等。其中,醛缩酶可以使二磷酸酮糖转变为磷酸酮糖和磷酸醛糖;水化酶可以使延胡素酸加合水,转变成苹果酸;脱羧酶可以使丙酮酸脱羧,形成乙醛。(5)异构酶类异构酶类主要催化各种同分异构体的相互转变。例如6-磷酸葡萄糖异构酶,可以使葡萄糖-6-磷酸与果糖-6-磷酸发生互变。(6)合成酶类合成酶类又称为连接酶类,它主要催化一切必须与三磷酸腺苷分解相偶联,并且由两种物质合成—种物质的反应。例如谷氨酰胺合成酶,在三磷酸腺苷的参与下,可以将游离氨和谷氨酸转变为谷氨酰胺。酶的合成与分解酶的化学本质是蛋白质,所以其合成的过程与蛋白质的合成类似。在细胞内,酶的合成还与营养素和代谢产物的关系密切。一定的营养素的摄入,可以促进相应酶的合成,而其代谢之后的生成产物则抑制酶的合成。另外,激素通过对代谢过程的效应也对酶的合成具有很大的影响。只能这样大概地按照分类学上讲一下,真正要具体有多少中酶,那就不是数量上能衡量的了
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