各种酶命名有什么规律

各种酶命名有什么规律,第1张

早期,酶的名称多数是由酶发现者根据酶所催化的底物、反应的类型或酶的来源命名一习惯名称。如催化淀粉水解的称为淀粉酶;催化底物分子水解的称水解酶;按酶来源的如胃蛋白酶……缺乏系统的规则,不能说明酶促反应的本质,常会出现混乱。1961年国际生物化学和分子生物学学会(IUBMB)根据酶的分类为依据,提出系统命名法,规定每一个酶有一个系统名称(systematic name),它标明酶的所有底物和反应性质。各底物名称之间用“:”分开。如草酸氧化酶,因为有草酸和氧两个底物,应用“:”隔开,又因是氧化反应,所以其系统命名为:草酸:氧氧化酶;如有水作为底物,则水可以不写。有时底物名称太长,为了使用方便,国际酶学学会从每种酶的习惯名称中,选定一个简便和实用的作为推荐名称(recommended name)。可从手册和数据库中检索。

国际系统分类法按酶促反应类型,将酶分成六个大类:

1. 氧化还原酶类(oxidoreductases):催化底物进行氧化还原反应的酶类。包括电子或氢的转移以及分子氧参加的反应。常见的有脱氢酶、氧化酶、还原酶和过氧化物酶等。

2. 转移酶类(transferases):催化底物进行某些基团转移或交换的酶类,如甲基转移酶、氨基转移酶、转硫酶等。

3. 水解酶类(hydrolases):催化底物进行水解反应的酶类。如淀粉酶、粮糖苷酶、蛋白酶等。

4. 裂解酶类(lyases)或裂合酶类(synthases):催化底物通过非水解途径移去一个基团形成双键或其逆反应的酶类,如脱水酶、脱羧酸酶、醛缩酶等。如果催化底物进行逆反应,使其中一底物失去双键,两底物间形成新的化学键,此时为裂合酶类。

5. 异构酶类(isomerases)催化各种同分异构体、几何异构体或光学异构体间相互转换的酶类。如异构酶、消旋酶等。

6. 连接酶类(ligases)或合成酶类(synthetases):催化两分子底物连接成一个分子化合物的酶类。

上述六大类酶用EC(enzyme commission)加1.2.3.4.5.6编号表示,再按酶所催化的化学键和参加反应的基团,将大类再进一步分成亚类和亚亚类,最后为该酶在这亚亚类中的排序。如α淀粉酶的国际系统分类编号为:EC3.2.1.1

EC3——Hydrolases 水解酶类

EC3.2——Glycosylases 转葡糖基酶亚类

EC3.2.1——Glycosidases 糖苷酶亚亚类i.e.enzymes hydmlyzing O-and S-glycosyl compound即能水解O-和S-糖基化合物

EC3.2.1.1 Alpha-amylase α-淀粉酶

很难碰到这么对口的问题,着实兴奋了一把。回答如下:

真菌的纤维素降解酶系是以游离酶为基础的,基本上可以分为三大类,外切纤维素酶(又叫纤维二糖水解酶,即CBH),内切纤维素酶(EG),外切酶分为两种,一种是从纤维素的还原端开始水解的,外切纤维素酶I,即CBHI,另一种是从纤维素的非还原端降解的,外切纤维素酶II,即CBHII。内切酶有EGI,EGII,EGIII,EGIV等,根据物种的不同会有不同的种类,一般的,EGII指的是这种微生物分泌的内切纤维素酶中第二个被发现的。但是,正是由于这种纤维素酶分类的命名的局限性,现在结合糖苷水解酶数据库(CAZY)的命名比较常见。

同学是做纤维素酶的吗?欢迎交流,哈哈。

酶的分类�

国际酶学委员会(I.E.C)规定,按酶促反应的性质,可把酶分成六大类:�

1.氧化还原酶类(oxidoreductases)指催化底物进行氧化还原反应的酶类。例如,乳酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶、细胞色素氧化酶、过氧化氢酶等。�

2.转移酶类(transferases)指催化底物之间进行某些基团的转移或交换的酶类。如转甲基酶、转氨酸、己糖激酶、磷酸化酶等。�

3.水解酶类(hydrolases)指催化底物发生水解反应的酶类。例如、淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、磷酸酶等。�

4.裂解酶类(lyases)指催化一个底物分解为两个化合物或两个化合物合成为一个化合物的酶类。例如柠檬酸合成酶、醛缩酶等。�

5.异构酶类(isomerases)指催化各种同分异构体之间相互转化的酶类。例如,磷酸丙糖异构酶、消旋酶等。�

6.合成酶类(连接酶类,ligases)指催化两分子底物合成为一分子化合物,同时还必须偶联有ATP的磷酸键断裂的酶类。例如,谷氨酰胺合成酶、氨基酸:tRNA连接酶等。�

二、酶的命名�

>(一)习惯命名法�

1.一般采用底物加反应类型而命名,如蛋白水解酶、乳酸脱氢酶、磷酸己糖异构酶等。�

2.对水解酶类,只要底物名称即可,如蔗糖酶、胆碱酯酶、蛋白酶等。�

3.有时在底物名称前冠以酶的来源,如血清谷氨酸-丙酮酸转氨酶、唾液淀粉酶等

习惯命名法简单,应用历史长,但缺乏系统性,有时出现一酶数名或一名数酶的现象。�

二)系统命名法�

鉴于新酶的不断发展和过去文献中对酶命名的混乱,国际酶学委员会规定了一套系统的命名法,使一种酶只有一种名称。它包括酶的系统命名和4个数字分类的酶编号。例如对催化下列反应酶的命名。�

ATP+D—葡萄糖→ADP+D—葡萄糖-6-磷酸 该酶的正式系统命名是:ATP:葡萄糖磷酸转移酶,表示该酶催化从ATP中转移一个磷酸到葡萄糖分子上的反应。它的分类数字是:E.C.2.7.1.1,E.C代表按国际酶学委员会规定的命名,第1个数字(2)代表酶的分类名称(转移酶类),第2个数字(7)代表亚类(磷酸转移酶类),第3个数字(1)代表亚亚类(以羟基作为受体的磷酸转移酶类),第4个数字(1)代表该酶在亚-亚类中的排号(D葡萄糖作为磷酸基的受体

回答者: 中国北京


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