为什么之前在HMDB数据库搜到的数据找不到了

为什么之前在HMDB数据库搜到的数据找不到了,第1张

你好,这个可能是sql服务没开启导致在HMDB的数据库中搜不到数据了。 所以建议先进服务,开启该服务。 如果还是无法开启,就将把系统时间往前退几天,再启动服务试试。人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布,被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源,包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度、疾病相关性、化学反应、代谢途径和参考光谱的综合信息。HMDB包含114222个代谢物条目,包括水溶性和脂溶性代谢物以及被视为丰富(>1μm)或相对罕见(<1nm)的代谢物。

1、仿真机器人

无论机器人从外部特征如何近似人类,如何将机器人打开,其中一堆复杂的连线则与人体内部有着天壤之别。来自欧洲的研究小组目前着眼于缩小机器人与人类之间的差别,意味着未来的机器人将赋予更多的人性化特征。他们研制的新型机器人的“骨骼”是由热塑性聚合物和促动器构成的,响应每一块肌肉和类似筋腱的线路的运动。他们的目标是建立更接近人类的机器人,能够像人类一样与所处环境作出交互反应。

2、“直接性碳燃料电池”

传统观念认为,煤是一种较脏的燃料,而同时氢燃料电池却是一种较清洁的能源。目前新一代“直接性碳燃料电池”将向传统观念发起挑战。该燃料电池并不依赖于难以生产的氢,而是通过氧气和煤粉(或者其它碳来源)之间的电化学反应获得能量。直接性碳燃料电池的优势在于该碳基础能源生产并不需要燃烧,但其效率可达到普通燃煤发电站的两倍。

美国加利福尼亚州直接性碳技术公司预计2010年将研制生物基础的10千瓦的直接性碳燃料电池原型,俄亥俄州一家名为Contained Energy的公司希望不久应用直接性碳燃料电池为较小功率的电灯泡提供电能。最终,该公司希望生产可以建造在新型小规模发电站或者在现有发电站上添加清洁功能的模块化燃料电池。

3、“人体代谢组计划”

在过去5年里,加拿大埃德蒙顿市艾伯特大学科学家一直致力于研究“人体代谢组计划”,该计划包含了8000个天然产生的代谢物数据库(人体内参与化学反应的小分子)、1450种药物、1900种食物添加剂和在尿检和血液检测中的出现的2900种毒素。

基于这些信息,研究人员能够分析出患者体内新陈代谢的特征,从而使他们通过血液或者尿液检测查明是否患有危及生命的疾病。现今,进行这些检测需要数百万美元的仪器装置,而这些仪器仅存在在于实验研究机构。“人体代谢组计划”数据库首次发布于2007年,目前该数据库已应用于药物研制和疾病诊断等领域,能够快速、容易地进行个体健康和医学指导测试。

4、DNA折纸技术

在过去几年,美国加利福尼亚理工学院的科学家在显微镜下将DNA折叠成有趣的外型。2009年夏季,这种“DNA折纸”技术获得了新的突破,可以用于建造超小型计算机芯片。

目前,美国加利福尼亚理工学院和IBM公司研究人员协作一起研究“DNA折纸技术”,比如:他们研制出用于微芯片的三角形状的硅晶体。可使研究人员利用DNA串像锚定点一样用于微型计算机芯片元件,这些芯片直径仅有6纳米,但与当前的45纳米标准相比是显著的提高。

5、压电显示屏

长期以来科学家一直对压电材料的性质产生浓厚兴趣,这些材料可以将电能转化成为物理压力,反之亦然。但如果利用该特性建造电子显示屏,可研制出能改变形状或者质感的显示屏。

今年,这项技术有望应用于主流消费制造领域,可潜在用于制造移动手机的屏幕,当关机时屏幕能够变硬起到一定的保护作用,开机时形成一种可按电式触摸屏。

6、假肢骨整合技术

最理想的假肢设计就是像人体自然生长出来的一样,骨整合技术使得假肢能够与患者的骨骼整合在一起,这种使用金属钛与骨骼细胞结合的技术并不产生人体排斥性。目前,这种最新骨整合技术已用于小型牙齿和面部植入手术应用,研究人员目前已研制出全比例假肢。2008年,一只名叫“卡西迪”的德国牧羊犬成功地安装了骨整合假肢。2010年,美国北卡罗莱纳州立大学兽医外科医生使用骨整合技术,已对被截肢狗进行了6次假肢安装手术,现在他正考虑对北卡罗莱纳州公园一只截肢虎猫安装假肢,但目前将该技术成功地应用于人体假肢安装领域仍有很大的挑战。

7、水平钻探井

据勘测统计,美国地面11000英尺以下蕴藏着数万亿立方英尺的天然气资源,然而通过普通的钻探技术无法获得大多数的天然气,密集的岩石层使天然气流动非常缓慢。目前,科学家提出了解决方案——先垂直钻探至页岩床位置,然而以90度水平地页岩沉积层。

这种解决方案并不是最新的,在更高的能源价格和更好的技术下,水平钻探技术有了新的突破。2008年,美国切萨皮克能源公司研制14个水平钻探井,应用于南部海纳斯维勒页岩天然气田,预计2010年末将部署40个水平钻探井。

8、动能水力发电

传统水力发电需要建造大坝,然而大坝的建造是一项浩大工程,将改变本地的地貌和生态系统。科学家提出了一种对环境影响甚微的解决方案——动能水力发电,利用河流和潮汐的自然流动驱动水下涡轮机。自2006年开始,美国绿色动力公司便在纽约东河测试6个水下涡轮,来证实动能水力发电的潜力。2010年,绿色动力公司期望获得建造河流中建造30个水下涡轮机的审批,这些水下涡轮机可提供1兆瓦电能。目前,全球范围内类似其它的项目也将在不久后测试并投入全面运行,其中包括在世界最大潮汐落差的加拿大芬迪湾安装3个水下涡轮机。

9、纳米纱线

自1991年碳纳米管出现之后,纳米管技术被便称为技术研究领域的一项重大突破。碳纳米管在强度和导热、导电性能方面具有优异性能,它们的强度是钢材的100倍。但直到目前碳纳米管仍不具备大批量生产的能力。目前,美国新罕布什尔州Nanocomp科技公司所制造的纺纱长度的纳米管已投入商业应用。近期,该公司建造完成10公里长的纳米纱线,并交付至一个大型航空制造公司。去年春季,纳米纱线成功地进行了防d测试,该测试令美国五角大楼欣喜不已,纳米纱线比凯夫拉尔纤维更轻、更细,可用来制造新一代防d衣。

10、超级电容

电动汽车最大的问题就是能量存储,目前的电池性能虽然有显著提升,但价格仍十分昂贵,充电速度较慢,并且使用寿命有限。科学家提出了一种解决方案——超级电容。它们所存储的能量不及电池(但至少达到了当前的技术标准),但没有像电池所具有的缺陷。这意味着超级电容的使用寿命会更长,没有化学反应所带来的麻烦和以及电池记忆问题,却具有更大的耐用性。

多年以来,研究人员一直致力于将超级电容技术更加完美。目前,美国麻省理工学院正在研制纳米管基础的超级电容,而阿尔贡国家实验室正在开发一种混合型“超级电容”。取得最大突破的是德克萨斯州的EEStor公司,2009年4月,该公司宣布所研制的“超级电容”已通过了关键性测试。EEStor公司的合作方——加拿大ZENN汽车公司宣称,2010年“超级电容”动力汽车将问世。

手动通过输入提问谱图中一定数目的质谱峰数据(质荷比、丰度),在数据库中进行匹配,获得与提问谱相似的谱图。

搜索

打开App

植物代谢组 | 一文了解用于质谱定性的代谢物数据库

4 个月前 · 来自专栏 代谢组及多组学技术

迈维代谢MetWare

迈维代谢MetWare

​关注

上期我们整体看了一下公共/自建数据库的类型,我们也能很清楚的发现,对于不同的数据库有着不同的用途,本期我们就具体来讲讲用于质谱数据匹配的数据库。(点此阅读原文)

1.NIST(National Institute of Standards and Technology):包含气质平台30万+代谢物

NIST数据库是由美国国家标准技术研究院出版,一般与GC-MS平台配套使用。对于该数据库目前没有开放使用,但是网页版本的数据库开放使用,网页版本的可以看作是NIST的标准参考数据库Standard ReferenceData中一部分与化学有关的数据库的Web版本,可通过分子式检索、化学名检索、CAS登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法,得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vi色谱、振动及电子色谱等。

网页链接:https://webbook.nist.gov/chemistry/

2. MassBank:包含来自气质液质不同平台不同模式共15055种物质

MassBank是一个高质量的质谱数据库,旨在公开分享从代谢物的化学标准品得到的质谱图以方便用户进行代谢物的鉴定,包含了代谢物的质谱信息以及采集情况,这些信息来自于不同的质谱仪设置,包括不同的电离技术,例如ESI、EI、 CI、APCI以及MALDI。

MassBank有三个不同的数据库:MassBank of North America (MoNa) 、the European MassBank 、the Japanese MSSJ MassBank,其中MoNa整合了更多来源的数据,因此相比其他两个更加受到科研工作者群体的偏好。

但是对于鉴定植物中的代谢物而言,MassBank中所包含的数据库是有限的,尤其是以质谱平台进行了限制,用于检测植物的主要是液相质谱平台,其中使用较多的是以ESI离子源为主要类型,所有包含ESI离子源这种类型的数目加起来是11592个物质。

METLIN数据库中的质谱图可以与一些不同的质谱仪产生的谱图进行很好的匹配,包括了其中包括AB公司的 Triple TOF 5600,安捷伦的 6460 Triple Quad,Thermo的 Q-Exactive和 LTQ Orbitrap Velos(使用任何一种CID 或HCD碰撞形式)。该数据库的不足在于所有的数据不支持下载,必须在线查看,这也使得研究者不能使用这些二级碎片信息来开发新的检索工具或者应用工具。虽然如果实验室拥有安捷伦公司生产的质谱仪器,用户可以向生产商购买METLIN的数据库,但是购买的数据库的并不能跟网络数据库同步更新。安捷伦的METLIN个人数据库中(personalmetabolite database,PMD)中包含有9083个化合物,其中4165个为代谢物,其他的为二肽或者三肽。


欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出

原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/6778777.html

(0)
打赏 微信扫一扫 微信扫一扫 支付宝扫一扫 支付宝扫一扫
上一篇 2023-03-28
下一篇 2023-03-28

发表评论

登录后才能评论

评论列表(0条)

保存