登陆ncbi主页,选择Gene数据库(不建议选All database),在搜索栏中输入“Sus scrofa domesticus mitochondrion”,单击搜索即可。你可以看一下截图。
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方法/步骤
首先打开KEGG搜索界面。
Search against输入"hsa",PrimaryID 类型选择“NCBI-GeneID”,在“Enter objects one per line followed by bgcolor, fgcolor”下方文本框中输入要查询的基因名“GPX1”。
在“Examples”下方选择“人”的通路。
点击“Exec”,d出查询到的通路。
点击其中任何一个通路,d出通路图界面。
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其中的红色块即为该基因或该基因相关的基因。点击红色块,d出界面可以查看详细的信息。
在GENE数据库上查找你的c-met的序列,分别比较人和鼠的相似性,有相关网站可以做,如SWISS等,根据相似比例判断同源性
同源性(homology)这个概念不能量化,“两条序列具有同源性”或者“不具有同源性”而相似性(similarity)和一致性(identity)可以看做是从不同的角度对同源性的量化指标,
建议你从NCBI的gene数据库入手
首先,因为TNRC9是TOX3基因以前的别称,所以用"TOX3"很容易就可以找到人类的TOX3基因(GeneID:27324)
ncbinlmnihgov/sites/entrezDb=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27324&ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2PEntrezGeneGene_ResultsPanelGene_RVDocSum
然后,您可以在此记录中找到NM_0010804302登录号,点击进入就是您要找的基因序列
这个基因一共有七个外显子,最常的有1000多个bp,测序的难度大一些
通常设计引物是针对外显子进行的,需要取得外显子及其上下游一小段序列cxbmh朋友的建议不错,你可以自己试试
设计的引物一般会有许多对设计好后,你可以把引物和序列丢给 primer blast看看引物在基因组上是否有多个靶点,以增加引物设计的成功率
引物,10,引物设计:
《引物设计流程》,在网上搜一下下,或许能找到的
它会详细教你怎样弄的,2,如何查找乳腺癌突变基因TNRC9的基因序列如何设计引物
NCBI里列出好多带编号的条目,哪个才是呢?
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