谁用过NCBI的CDD数据库

谁用过NCBI的CDD数据库,第1张

NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展,高通量数据急速产生,而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生,起初它主要任务是数据的存储和查询。只不过其存储的数据大多以高通量数据为主,例如基因测序,基因组,SNP, 基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等。这些数据的共享,极大地促进了生物信息学发展。

按照数据->样式->知识->智慧的发展模式,NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色。不过,NCBI目前也不断地在调整自己的角色。例如,生物医学文献。NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础,提供以PMC数据库为核心的全文文献服务。PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库。NCBI最近对pubmed的改版,虽然没有实质性的改变,但其按照用户体验进行的修改,足见其对该数据库的重视。

另外,NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制。以dbSNP为例,其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联。

总得来讲,NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关,它以经不在局限于提供数据存储与查询,其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库。到那时NCBI会不会免费,就要另当别论了。很显然没有人会将自己的手稿拱手让人。如果真有那么一天,不知道从中会产生多少专利和知识产权。

CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-Intron Database,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段


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