随着高通量测序的发展,海量的数据源源不断的产生,以至于美国国家生物技术信息中心(NCBI)都受不了了,由于经费不足,于2011年2月关闭了Sequence Read Archive(SRA)数据库,停止接受用户提交的下一代测序数据。
近日,Google和TPG Biotech联合1500万美元致力于打造DNA云数据库,Google将和DNAnexus一起接管NCBI的海量数据库,继续为科研人员提供的DNA数据信息。
一般上传数据到NCBI SRA的过程需要6步:
1、Create a BioProject for this research
2、Create a BioSample submission for your biological sample(s)
3、Gather Sequence Data Files
4、Enter Metadata on SRA website
a、Create SRA submission
b、Create Experiment(s) and link to BioProject and BioSample
c、Create Run(s)
5、Transfer Data files to SRA
6、Update Submission with PubMed links, Release Date, or Metadata Changes
需要注意的一点是,上传的过程中很多地方一旦保存或提交就不可以修改,尤其是各处的Alias。但是,可以联系NCBI的工作人员修改内容。NCBI的工作效率是很高的,一般不超过48小时,就可以得到确认,并拿到登录号。
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