在genebank数据库里面怎么找到候选靶基因的引物序列

在genebank数据库里面怎么找到候选靶基因的引物序列,第1张

在Genbank里输入你要找的物种或基因名,最好是查找该物种全序列,然后把你要扩增的序列复制导入primer premier进行引物设计,设计好的引物再在Blast里比对一下,看看有没有和其他物种或序列相同,如有相同,则说明这个引物特异性不高,不能用。

如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,RNA22,mirbase,PITA,microcosom等等

靶向药物(也称作靶向制剂)是指被赋予了靶向(Targeting)能力的药物或其制剂。其目的是使药物或其载体能瞄准特定的病变部位,并在目标部位蓄积或释放有效成分。靶向制剂可以使药物在目标局部形成相对较高的浓度,从而在提高药效的同时抑制毒副作用,减少对正常组织、细胞的伤害。

根据标靶的不同,药物靶向可分为几个层次:

1、组织器官水平

使药物选择性的蓄积在肿瘤组织、炎症部位、或心肝脾肺等特定器官内,从而减少全身性的不良反应。目前针对肿瘤组织的靶向化疗药物是研究的一大热点,如针对肿瘤缺氧、低pH、新生血管密集等特定环境设计的靶向药物能够提高肿瘤组织内的药物浓度,显著改善肿瘤化疗的效果。

2、细胞水平

利用病变细胞表面的某些特定受体,在药物或其载体表面修饰与该受体特异性结合的配体(如抗体、多肽、糖链、核酸适配体、或其他小分子等),使药物能够精确地定位到病变细胞并将其杀伤,而对正常细胞则不产生明显的毒害作用。

3、亚细胞水平

很多药物(如核酸药物、大多数蛋白药物、及部分小分子药物)需要进入细胞内部,或者在特定细胞器(如线粒体、细胞核)内才能发挥作用。穿膜肽、核定位序列(Nuclear localization sequence)等是目前研究较多的靶向组件。

靶向治疗用于干扰正常细胞癌变的过程。这些药物把细胞变化和维持肿瘤发展及不断增长所需信号的某一环节,作为靶点。靶向药物只会特异性地针对肿瘤细胞,对正常细胞不会有影响。

医生通常根据这些药物的作用原理,以及作用于细胞的具体部位来将它们分类。

1 酶抑制剂:

一些靶向治疗可阻断某些作为癌症细胞生长信号的蛋白质或酶。阻止这些信号,可以防止肿瘤越来越大,并阻止其蔓延。因此,即使不能使肿瘤越来越小,也可以改变其不受控的生长模式。这可能会使常规化疗有更好的效果。即使不使用其他药物,仅仅改变肿瘤不受控制的生长模式,还可以帮助人们延年益寿。

酶抑制剂可分为:酪氨酸激酶抑制剂、mTOR 抑制剂、蛋白酶体抑制剂、生长因子抑制剂或信号转导抑制剂。如果一种药物有许多不同的靶点,它有时也被称为多靶点激酶(或者多激酶)抑制剂。

2 细胞凋亡诱导药物:

一些靶向治疗可以改变癌细胞内的蛋白质,从而导致细胞死亡。这些被称为凋亡诱导药物(凋亡是细胞死亡的医学用语,这些药物可引起或诱导细胞死亡)。许多癌症的治疗(包括放疗和化疗)都可以引起细胞变化,从而导致细胞凋亡。但只有靶向治疗药物直接作用于控制细胞生存和死亡的部位。

3 血管生成抑制剂:

血管生成是新血管形成的过程。在大多数情况下,这是一个正常、健康的过程。由于人体的生长发育,需要生成新的血管使得所有细胞都得到血液和营养。作为成年人,我们不太需要生成新的血管,但有时血管生成仍然是很重要的。新生血管可以帮助伤口愈合和修复损伤的身体。

但是对于癌症病人来说,同样的血管新生过程,也会给肿瘤提供血液,并允许其生长和扩散。血管生成抑制剂可瞄准并停止(或抑制)这个过程——它们阻止肿瘤内部形成新的血管。这有助于切断肿瘤的血液供应。没有血液供应,肿瘤就不能生长。

这类药物中,有很多是通过阻断血管内皮生长因子(VEGF)来发挥作用的。VEGF 是由肿瘤产生的蛋白质生长因子家族。这些 VEGF 蛋白质能够附着到血管细胞的血管内皮生长因子受体上,诱导新血管形成并包围肿瘤。阻止这一过程可防止供应肿瘤生长的血管生成。

希望能解答你的疑问!

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