扩展名为pks的是什么文件

PKS可以全布线设计在处理的串扰问题，如增加合适的缓冲(buffer)，进行宽范围的布线(wide space routing)，掩模布线(shielded routing)等。PKS与RC寄生提取工具(如Cadence Hyperextract)和串扰分析仪(如Crosstalk Magnitude Calculator - XMC 或CADMOS Celtic)进行了集成。 1、PKS进行物理综合、布局并产生全局布线数据库。 2、根据全局布线数据库，Silicon Ensemble完成细节布线，Hyperextract完成RC提取。 3、通过PKS XMC指令或CADMOS Celtic进行串扰分析。 4、产生一个渐进式SDF和一个修复文件。渐进式SDF文件包含串扰延迟效应。修复文件包含因为串扰引发逻辑问题而需修复的网表，并包含修复方法。在这些文件基础上，PKS进行时序优化和串扰修复。

该分析模块是对基因组预测编码基因后的基因本体功能分析。主要内容包括（1）通过NCBI NR, NT, Ensemble GO 等国际权威数据库识别新基因的功能。（2）结合其他NSAM方案，如比较基因组学的诸多分析方案，获得近源物种的同源基因，得到该当前物种的特有基因和可能参与的新功能，新代谢通路和信号转导通路。如果配合SNP和进化分析，可以获得基因的选择压和进化距离，进而分析该物种的进化起源。（3）比较多物种基因组中基因成分在gene和gene cluster层面上比较多物种基因成分的共性和差异性获得该未知物种不同条件下的转录组数据，分析转录组数据中基因的功能本体。

生物通报道：长非编码RNA（lncRNA）长达两百个核苷酸以上的转录本，但并不编码任何蛋白质。尽管如此，长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA（也称lincRNA）位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，有的位于基因间或者内含子中。

为何细胞不惜耗费能量对这些非编码RNA的表达和定位进行严格调控呢？这些RNA分子究竟有何功能？RNA测序技术的发展使人们得以初窥这一神秘的分子，现在lncRNA的许多相关信息都可以在新数据库中查到，例如Broad研究所、哈佛大学和麻省理工共同开发的Human Body Map lincRNAs catalog。不过现在人们了解到的lncRNA只是冰山一角，还有大量lncRNA的功能有待科学家们去探寻。

lncRNA研究工具

现在lncRNA研究面临的一个主要挑战是，研究工具还在不断开发和改进中，其中包括设计带有不同lncRNA检测探针的芯片。安捷伦公司的SurePrint G3 Gene Expression v2 microarray就是其中之一，该芯片的探针设计不仅参照主要公共数据库中的mRNA，还参照了Broad研究所开发的lincRNA和TUCP（transcripts of uncertain coding potential）数据库，可以同时检测编码RNA和非编码RNA。据安捷伦公司基因表达产品经理Corinna Nunn介绍，lncRNA的表达水平比编码RNA低，“因此芯片的动态范围宽很重要，这样才能够保证检测到表达水平较低的基因。”

Affymetrix也推出了新版人类全转录本表达谱芯片GeneChip® Gene 20 ST Arrays，能够在一张芯片上同时检测mRNA和lincRNA。该芯片的设计结合了多个数据库资源，包括RefSeq、Ensemble、Broad研究所的Human Body Map lincRNAs和TUCP catalog。 “我们的超高密度芯片具有独特的探针，能够检测每个转录本各外显子上的多个位点，确保最大程度的捕捉相关生物学信息，” Affymetrix公司的Tsetska Takova说。生物通 >

全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是：

AUniProtKB

BPDB

CKEGG

DOMIM

EPfam

FCATH

GEnsemble

H、DDBJ

正确答案：PDB

pks文件怎么打开

pks是独立软件辅助加密数据文件，可以用PKS PKPM广联达的预算软件或Oracle Package Spec File 打开。

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