蛋白质的结构层次

蛋白质的结构可划分为4个层次,即一级结构、二级结构、三级结构、四级结构.

其中,一级结构即基本结构,

二级、三级、四级属于空间结构.

维持的力：

一级：主要是肽键,还有二硫键；

二级：是氢键 ；

三级：是次级键,包括：二硫键、氢键、盐键、范德华力、疏水作用（主要）；

四级：是非共价键,包括：氢键、盐键、范德华力、疏水作用.

扩展资料：

蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。蛋白质主要由碳、氢、氧、氮等化学元素组成，是一类重要的生物大分子，所有蛋白质都是由20种不同氨基酸连接形成的多聚体，在形成蛋白质后，这些氨基酸又被称为残基。

作用

1.构成生物体内基本物质，为生长及维持生命所必需；

2.部分蛋白质可作为生物催化剂，即酶和激素；

3.生物的免疫作用所必需的物资；

4.有些蛋白质会导致食物过敏。

化学组成

（1）单纯蛋白质：仅含有AAs

（2）结合蛋白质：由AAs和其他非蛋白质化合物所组成

（3）衍生蛋白质：用化学或酶学方法得到的化合物

分子组成

基本单位：氨基酸 有不同的AAs通过肽键相互连接而成

蛋白质→眎→胨→多肽→二肽→多肽→氨基酸

元素组成：由碳，氢，氧，氮，硫，磷，碘，铁，锌等元素组成。

功能分类

（1）结构蛋白质：角蛋白，胶原蛋白，d性蛋白

（2）有生物活性的蛋白质：酶，激素，免疫球蛋白

（3）食品蛋白质：凡可供食用，易消化，无毒和可供人类利用的蛋白质

对蛋白质结构进行分类的方法有多种，有多个结构数据库（包括SCOP、CATH和FSSP）分别采用不同的方法进行结构分类。存放蛋白质结构的PDB数据库中就引用了SCOP的分类。对于大多数已分类的蛋白质结构来说，SCOP、CATH和FSSP的分类是相同的，但在一些结构中还有所区别。

PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维（以二维的形式表示三维的数据）结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。随着晶体衍射技术的不断改进,结构测定的速度和精度也逐步提高。90年代以来,随着多维核磁共振溶液构象测定方法的成熟,使那些难以结晶的蛋白质分子的结构测定成为可能。蛋白质分子结构数据库的数据量迅速上升。据2000年5月统计，PDB数据库中已经存放了1万2千多套原子坐标,其中大部分为蛋白质，包括多肽和病毒。此外,还有核酸、蛋白和核酸复合物以及少量多糖分子。核酸三维结构测定进展迅速。PDB数据库中已经收集了800多套核酸结构数据。

PDB数据库允许用户用各种方式以及布尔逻辑组合(AND、OR和NOT)进行检索，可检索的字段包括功能类别、PDB代码、名称、作者、空间群、分辨率、来源、入库时间、分子式、参考文献、生物来源等项。用户不仅可以得到生物大分子的各种注释、坐标、三维图形、VAML等,并能从一系列指针连接到与PDB有关的数据库，包括SCOP、CATH、Medline、ENZYME、SWISS-3DIMAGE等。可通过FTP下载PDB数据。所有的PDB文件均有压缩和非压缩版以适应用户传输需要。PDB的电子公告版BBS和电子邮件兴趣小组(Mailing List)为用户提供了交流经验和发布新闻的空间。在PDB的服务器上还提供与结构生物学相关的多种免费软件如Rasmol、Mage、PDBBrowser、3DB Brower等。

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