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GOKEGG自定义通路的富集方法
目录 前言 一、数据背景 二、使用步骤 1.加载所需的R包 2.读入数据与处理表格 3.enrichGO函数进行GOKEGG自定义通路的富集 4.简单的可视化 三、结论前言 clusterProfiler 是业界大神Y叔写的
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单细胞测序流程(八)单细胞的marker基因转化和GO富集分析
系列文章目录 单细胞测序流程(一)简介与数据下载 单细胞测序流程(二)数据整理 单细胞测序流程(三)质控和数
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给定基因集gene list后,R语言GO、KEGG分析
一.把准备好的gene名字复制到txt文件中(此时是symbol格式的gene名,如下,得到gene.txt二.安装所需包 if (!requireNamespace("BiocMa
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富集分析GO KEGG GSEA的区别
GO和KEGG是基于不同的分类思想而储存的基因相关功能的数据库,富集分析就是一个把这些功能进行进行整合计算的算法,GO富集,就是研究基因的本质的,从三个层面ÿ
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富集分析GO KEGG GSEA的区别
GO和KEGG是基于不同的分类思想而储存的基因相关功能的数据库,富集分析就是一个把这些功能进行进行整合计算的算法,GO富集,就是研究基因的本质的,从三个层面ÿ