linux常用的批处理

基本语法：

for i in

do；

done

1、处理文件夹下的所有文件：

for i in $(ls /public/home/fengting/demo/pan69/sort_bam)

2、简单的for循环：

for ((i=1i<=33i++))

do  ngmlr -t 10 -r /public/home/fengting/database/reference/rice/IRGSP-1.0_genome.fasta -q /public/home/fengting/data/hhz/H7L$i.arrow.polish.fasta -o /public/home/fengting/data/rihhz/H7L$i.sam

不可以，这个格式是微软专有的。LINUX下的批处理文件一般是.SH格式的。

批处理(Batch)，也称为批处理脚本。顾名思义，批处理就是对某对象进行批量的处理，通常被认为是一种简化的脚本语言，它应用于DOS和Windows系统中。批处理文件的扩展名为bat 。

这个写成脚本就可以实现了，你说的: goto是一个循环，在shell里构建循环，例如

（linux执行不了windows的程序，内核不同，如果你要运行exe，需要装wine，我就用linux的程序来执行了）

datetime=$(date +%H%M%S) (这里设定的是时间，你可以选择参数，我是时分秒）

loop （）｛

diff qsot.txt xuanpai.txt

｝

sh zhushuju.sh

if [ $? -eq 0 ]then

echo “$datetime”

else

return （返回）

fi

sleep 10

sh qsort.sh >qsort.txt （执行后输出到qsort.txt）

if [ $? -eq 0 ]then

echo "$datetime"

else

return

fi

sleep 10

sh xuanpai.sh >xuanpai.txt

sleep 5

loop

read -p "end"

可能有什么错误，呵呵。

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