github地址 https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)
需要安装LASTAL和jcvi python包
输入数据只有两类cds和bed文件
可以自动从phytozome，这点十分方便
以水稻和拟南芥为例
其中gff3文件不需要解压 一键转换成bed格式
cds解压后需要去掉|分隔符 b并要修改id 以基因而不是转录本命名
如果是其他物种或者自己组装的基因组数据，记得基因id需要遵循在染色体上的位置从大到小排序的命名原则，否则软件会在gff3转bed的时候自动命名，务必要和cds里的id对应。
分析过程很快，结果包括.anchors文件，点阵图，如果遇到报错，多半是要安装python包，更新Latex。结果文件的含义“The .last file is raw LAST output, .last.filtered is filtered LAST output, .anchors is the seed synteny blocks (high quality), .lifted.anchors recruits additional anchors to form the final synteny blocks.”
重头戏来了
首先生成.simple文件
再编辑两个配置文件seqids和layout
接下来就是见证奇迹的时刻
突出显示
亲测点阵图是自动出来的，当然也可以用命令行
查看synteny depth分布
anyway，先介绍到这里啦
更多请参考
基因组共线性工具MCScanX使用说明
基因组间共线性分析想学吗?
无限个！物种共线性分析结果可视化
Build Your First network提供了一个 fabric 的示例网络。该示例网络中由两个组织构成，每个组织维护两个 peer 节点，演示了基于链码查询2个账户余额与转账 *** 作。
first-network 中有一个启动脚本 byfn.sh，利用构建的 Docker 镜像快速启动网络。该脚本会启动一个 orderer 节点和四个归属两个不同组织的 peer 节点，还将启动一个cli运行脚本，它将 peer 节点加入通道（Channel）、部署和实例化链码，并根据已部署的链码驱动交易执行，以下是byfn.sh的帮助文档。
执行./byfn.sh up -o etcdraft启动脚本，指定使用raft共识算法
通过cryptogen工具生成组织成员关系和身份z书、密钥等文件。调用configtxgen工具生成节点与通道配置文件，包括Orderer节点上系统通道的创世区块文件genesis.block，新建应用通道的配置交易文件channel.tx、组织锚节点配置更新交易文件Org1MSPanchors.tx与Org2MSPanchors.tx等。
用户执行network_setup.sh脚本启动Fabric网络，该脚本调用networkUp函数，该命令会检查网络实体的证书是否生成，如果没有则首先生成相关证书目录。
generateCerts主要执行了cryptogen generate --config=./crypto-config.yaml
根据crypto-config.yaml生成网络成员组织结构和对应的身份z书、签名私钥等文件，并保存到默认的crypto-config目录，身份z书等文件在对应的目录msp/ 中，TLS证书与密钥文件保存到tls/ 中。
crypto-config.yaml主要包含的fabric排序节点证书配置以及fabric组织证书配置。
Template 模板定义节点的配置模式
Specs 另外一种配置模式
Count 节点总数
Hostname 全限定域名 命名格式
Domain 域名
Users 添加到管理员的用户帐户数
采用Specs模式配置了5个排序节点
采用Template模式配置了两个组织，每个组织2套公私钥和证书，包含普通User数量为1
ordererOrganizations目录 ：包含Orderer组织类型的身份z书.pem文件、签名私钥文件 _sk文件、TLS证书（证书.crt文件和密钥.key文件）
peerOrganizations目录 ：包含Peer组织类型的身份z书.pem文件、签名私钥文件 _sk文件、TLS证书（证书.crt文件和密钥.key文件）
这些文件通过docker-compose工具，基于docker-compose-cil.yaml、docker-compose-base.yaml等配置文件，将目录作为挂载卷到容器的指定目录。
调用replacePrivateKey基于docker-compose-e2e-template.yaml文件创建新的配置文件docker-compose-e2e.yaml。进入Org1组织的CA目录，获取私钥文件名作为PRIV_KEY，替换docker-compose-e2e.yaml文件的CA1_PRIVATE_KEY。同理替换CA2_PRIVATE_KEY。
执行generateChannelArtifacts函数，使用configtxgen工具基于configtx.yaml创建节点与通道配置文件，包括Orderer通道的创世区块，应用通道配置配置交易文件channel.tx，锚节点配置更新交易文件Org1MSPanchors.tx和Org2MSPanchors.tx
Orderer系统通道的创世区块
执行configtxgen命令，创建Orderer创世区块文件genesis.block
新建应用通道的配置交易文件
执行configtxgen命令，创建应用通道的配置交易文件channel.tx，后续执行peer channel create读取文件。
锚节点配置更新交易文件
执行configtxgen命令，创建锚节点配置更新交易文件Org1MSPanchors.tx和Org2MSPanchors.tx，后续执行peer channel update进行更新。
返回到network_setup.sh脚本，判断是否启用了CouchDB标志位（默认关闭），使用docker-Compose工具执行docker-Compose-cil.yaml文件，启动Fabric网络。
继续分析network_setup.sh脚本，默认COMPOSE_FILES是docker-compose-cli.yaml文件，当设置了kafka共识或者raft共识，则使用对应的yaml文件。
Orderer节点继承了docker-compose-base.yaml中的orderer.example.com配置属性，Orderer节点容器启动时执行如下命令
docker-compose-cil.yaml文件
继续追踪base/docker-compose-base.yaml，找到orderer.example.com服务，挂载目录和暴露7050端口。
orderer的配置还是引入peer-base.yaml中的orderer-base服务
4个Peer节点继承了docker-compose-base.yaml中对应容器名称的配置属性，Peer节点容器启动时执行如下命令
docker-compose-cil.yaml文件中Peer节点配置。
docker-compose-base.yaml文件中Peer节点的配置。
引入peer-base.yaml中的peer-base服务
docker-compose-cil.yaml文件中CLI客户端配置。启动完 orderer 节点、peer 节点和 CLI 容器之后，实际是调用 script.sh 脚本，该脚本是在 CLI 容器中执行，CLI 容器其实就是用户客户端，只不过是命令行客户端，运行在容器中。默认情况下CLI 的身份是 admin.org1，连接 peer0.org1 节点，执行 script.sh 脚本
script.sh脚本顺序执行默认的测试流程，包括创建新的应用通道、添加节点、更新锚节点、安装链码、实例化链码、调用链码、查询链码等 *** 作。
Fabric要求创建、加入与更新通道的权限必须具有通道组织的管理员身份。调用setGlobals设置全局环境变量，CLI客户端能够灵活切换指定容器的管理员角色，可以直接连接并 *** 作指定的Peer节点，先切换到Peer0/Org1节点。
接着采用Org1管理员身份执行peer指令，将通道配置文件Channel.tx发送给Orderer节点，创建mychananel的应用通道。如果创建成功，则返回一个创世区块block，它会存储在 peer 节点的文件系统中，包含 channel.tx 指定的通道配置信息。
遍历所有节点，调用setGlobals切换指定节点，执行peer指令，将Org1组织包含的Peer0/Org1和Peer1/Org1节点加入mychananel应用通道，将创世区块mychananel.block设置成命令行参数。Org2组织类似。
joinChannelWithRetry 函数中的 setGlobals 是设置 CLI 容器的环境变量的函数。例如：setGlobals 1 2 设置 CLI 的身份为 admin.org2，连接 peer1.org2 节点。
使用 peer channel join 命令让节点加入通道，$CHANNEL_NAME.block 就是前面创建通道成功时返回的区块，该区块在上面 org1.peer0 创建通道时保持在 CLI 容器内，所以能直接使用。节点成功加入通道后会创建 CHANNEL_NAME.block 开头的链。
一个组织只能有一个锚节点，节点加入通道后才能进行更新，连续两次调用updateAnchorPeers，更新两个组织的锚节点配置，用Org1管理身份更新Peer0/Org1的配置，并指定锚节点配置更新文件Org1MSPanchors.tx，Org2组织同理。
连续两次调用installChaincode分别在Peer0/Org1和Peer2/Org2中安装chaincode_example02链码，并将链码命名为“mycc”且版本1.0，如果链码安装成功，在指定安装目录/var/hyperledger/production/chaincodes下存在name.version的链码文件。
实例化链码必须在安装过链码的节点上进行，同一个通道内所有节点上相同的实例化数据在通道账本中是共享的，用户只需要在任意一个Peer节点上成功执行一次实例化链码 *** 作，并通过排序打包后将实例化数据广播到其他节点上，通道内所有合法节点都可以访问该链码的实例化数据。
实例化将链码添加到通道上，启动目标节点的容器，初始化与链码相关的初始值，这里的初始值为 ["a","100","b","200"]。”实例化“ 过程会产生链码的容器，例如： dev-peer0-org1.example.com-mycc-1.0 。实例化过程需要指定背书策略，通过 -P 参数设置，这里的策略定义为 AND ('Org1MSP.peer','Org2MSP.peer') ，表示任何交易必须要有 org1 和 org2 节点的共同背书。
Peer0/Org1上调用链码查询函数chaincodeQuery和链码调用函数chaincodeQuery。查看A的余额，并从账户A中向账户B中转账10元。
Peer3/Org2上安装链码，执行查询A的余额，检查余额是否为90元，如果是说明转账成功。
float，css的一种属性，主要属性值为：left（左浮动）、none（不浮动）、right（右浮动）、inherit（继承父元素浮动），多用于网页排版。
float属性定义元素在哪个方向浮动。以往这个属性总应用于图像，使文本围绕在图像周围，不过在 CSS 中，任何元素都可以浮动。浮动元素会生成一个块级框，而不论它本身是何种元素。
扩展资料
CSS属性
1、整数和实数
在CSS中只能使用浮点小数，而不能像其他编程语言那样使用科学记数法表示实数，即1.2E3在CSS中将是不合法的。下面是几个正确的例子，整数：128、-313，实数：12.20、1415、-12.03。
2、长度量
相对长度单位有：em——当前字体的高度，也就是font.size属性的值；ex——当前字体中小写字母x的高度；Dx——一个像素的长度，其实际的长度由显示器的设置决定，比如在800木600的设置下，一个像素的长度就等于屏幕的宽度除以800。
3、百分数量（percentages）
百分数量就是数字加上百分号。显然，百分数量总是相对的，所以和相对长度量一样，百分数量不被子级元素继承。
参考资料来源：百度百科-CSS
参考资料来源：百度百科-FLOAT
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