老大们请问下编译mpi的问题

1、icc

Intel C/C++编译器接受遵守ANSI C/C++ , ISO C/C++ standards,GNU inline ASM for IA-32 architecture标准的输入。与linux下常用的gcc兼容并支持更大的C语言扩展，包括源文件、命令行参数、目标文件。不支持gcc的inline方式的汇编。例，f.c

#include

int main(int argc, char* argv[]){

printf("Hello\n")

return 0

}

编译：icc -c f.cpp -o f.o

链接：icc f.o -o f

运行：./f

注意，编译与链接都由icc来完成，icc常用命令行参数：

-o 输出文件命名

-I include路径

-L lib路径

-l 包含的lib名

-c 仅生成目标文件(*.o),不链接

-On n=0,1,2,3 编译器优化选项，n=0关闭编译器优化，n=3使用最激进的优化

-c99[-] 打开/关闭 c99规范的支持

详细的请参照icc的manpage.

2、ifort

Intel Fortran编译器支持F77/90/95标准并与CFV(Compaq Visual Fortran)兼容。例，f.f90

program f

print *, "Hello"

stop

end

编译：ifort -c f.f90 -o f.o

链接：ifort f.o -o f

运行：./f

编译与连接同样由ifort来完成，ifort常用命令行参数：

-o 输出文件命名

-I include路径

-L lib路径

-l 包含的lib名

-c 仅生成目标文件(*.o),不链接

-On n=0,1,2,3 编译器优化选项，n=0关闭编译器优化，n=3使用最激进的优化

-std90 使用F90标准编译

-std95 使用F 95标准编译

-f77rtl 编译使用F77运行方式的代码（用于解决特殊问题）

These options optimize application performance for a particular Intel? processor or family of processors. The compiler generates code that takes advantage of features of the specified processor.

Option

Description

tpp5 or G5 Optimizes for Intel? Pentium? and Pentium? with MMX? technology processors.

tpp6 or G6 Optimizes for Intel? Pentium? Pro, Pentium? II and Pentium? III processors.

tpp7 or G7 Optimizes for Intel? Pentium? 4, Intel? Xeon?, Intel? Pentium? M processors, and Intel? Pentium? 4 processors with Streaming SIMD Extensions 3 (SSE3) instruction support.

On Intel? EM64T systems, only option tpp7 (Linux) or G7 (Windows) is valid.

About tpp:

Intel Fortran Compiler Options:

Intel(R) Fortran Compiler Options:

ifort编译器提供了非常多的优化参数

$ ifort --help | more 查看就可以

也可以定位到某个参数

$ifort --help | grep -5 '-mkl'

-5表示显示查找到的行及下面5行的内容。

3、Intel MKL数学库针对Intel系列处理器进行了专门的优化，主要包含的库有：

基本线形代数运算(BLAS)

向量与向量、向量与矩阵、矩阵与矩阵的运算

稀疏线形代数运算

快速傅立叶变换(单精度/双精度)

LAPACK(求解线形方程组、最小方差、特征值、Sylvester方程等)

向量数学库(VML)

向量统计学库(VSL)

高级离散傅立叶变换

编译:

icc multi.c -I/opt/intel/mkl/include –L/intel/mkl/lib –lmpi_ipf –o multi

4、MPI程序编译

消息传递接口(MPI)并行程序设计模型程序的编译命令。例，f.c

include

#include

main(argc,argv)

int argc

char *argv[]

{

char name[BUFSIZ]

int length

MPI_Init(&argc,&argv)

MPI_Get_processor_name(name, &length)

printf("%s: hello world\n", name)

MPI_Finalize()

}

编译与连接均使用mpicc,参数与mpicc中定义的编译器相同，这里与icc相同。

mpicc –c hello.c –o hello.o

mpicc hello.o –o hello

运行使用mpirun 命令，将运行需要的节点定义在文件中并在-machinfile中制定。

文件: nodelist

node1

node1

node2

node3

运行：

$mpirun –machefile nodelist –np 4 ./hello

node1: hello world

node1: hello world

node2: hello world

node3: hello world

5、32位向64位的移植

32位程序到64位移植中应注意的常见问题：

数据截断：

由于long类型变量的运算（赋值、比较、移位等）产生。long定义在x86上为32bits,而在ia64上为64bits.容易在与int型变量运算时出现异常。

处理方法：尽量避免不同类型变量间的运算,避免将长度较长的变量赋值到较短的变量中，统一变量长度可以解决这个问题。简单的对于32位转移到64位可以将所有long定义转换为int定义。

要使用 OMPT，需要在系统上安装和运行 Oracle Solaris 11。除了安装过程中使用的 root 权限之外，运行任何 OMPT 实用程序通常无需任何其他特殊权限。

如果您想编译 MPI 程序，则需要安装 Oracle Solaris Studio 12.1 或更高版本。在运行 MPI 程序的节点集群上，可以在其中一个节点上安装 Oracle Solaris Studio 并仅在该节点上编译 openmpi-15 程序包，但在所有节点上都安装该程序包。

要获取 OMPT，请安装 openmpi-15 程序包，该程序包由一个映像包管理系统 (IPS) 信息库托管，您的系统上应配置有该信息库。要验证是否配置了 IPS 信息库，请运行 pkg publisher 命令。

如果尚未 配置 IPS 信息库，请在尝试添加 openmpi-15 程序包之前配置它。否则，程序包添加将失败。

系统应配置了网络访问（如果是通过网络访问 IPS 信息库）或本地配置的从同一系统提供服务的 IPS 信息库。

本文示例使用了本地配置的 IPS 信息库，如 pkg publisher 命令的以下输出所示，该输出指示 IPS 信息库通过 HTTP 托管在 localhost 上。

root@solarix:/usr/share/distro_const# pkg publisher

PUBLISHER TYPE STATUS URI

solaris origin online http://localhost/

验证配置了信息库之后，以 root 身份运行 pkg install openmpi-15 命令添加该分发构造器程序包。然后从 IPS 信息库下载 openmpi-15 程序包并立即安装。

pkg install openmpi-15 命令显示进程的状态，如清单 1 所示，这样便于观察进度。

清单 1：pkg install openmpi-15 命令的输出

root@solarix:~# pkg install openmpi-15

Creating Plan

Packages to install: 2

Create boot environment: No

DOWNLOAD PKGS FILESXFER (MB)

service/picl 0/2 0/1430 0.0/11.9[K

developer/openmpi-15 1/2 1430/143011.9/11.9[K

Completed 2/2 1430/143011.9/11.9[K

PHASEACTIONS

Install Phase 1639/1639

PHASE ITEMS

Package State Update Phase 1/2

Package State Update Phase 2/2

Image State Update Phase 1/2

Image State Update Phase 2/2

PHASE ITEMS

Reading Existing Index 1/8

Reading Existing Index 5/8

Reading Existing Index 8/8

Indexing Packages2/2

安装完 openmpi-15 程序包之后，只需在 PATH 变量中包括 /usr/openmpi/ompi-15/bin，然后就一切准备妥当。

使用 OMPT 编译 MPI 程序

使用 OMPT 编译 MPI 程序有两种方式。您可以使用程序包中包含的编译器包装器（mpicc、mpiCC、mpif77 和 mpif90）或者直接调用编译器。

因为需要包含的 include、library 和 run 路径，建议采用第一种方法。包装器将其不了解的所有选项都传给 Oracle Solaris Studio 编译器，因此您应能够使用包装器实用程序替换 makefile 中编译器的所有实例。

以清单 2 作为示例 MPI 程序，可以使用一行命令编译程序：

mpicc hello.c -o hello.x

清单 2：示例 hello.c 程序

#include <stdio.h>

#include <mpi.h>

int main(int argc, char **argv) {

int np, me

MPI_Init(&argc,&argv)

MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&np)

MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&me)

printf("hello from %d of %d\n", me, np)

MPI_Finalize()

return 0

}

还可以执行两阶段的编译和链接：

mpicc -c hello.c

mpicc hello.o -o hello.x

如果要直接执行编译器而不使用包装器，可以通过向包装器提供 -showme 选项来确定包装器使用的选项：

mpicc -showme hello.c -o hello.x

使用 OMPT 运行 MPI 程序

编译完可执行文件并与 OMPT 库链接之后，可以单独运行该程序或使用并行作业启动器实用程序 mpirun 来运行。

要单独运行程序，只需运行该可执行文件，就跟普通非并行可执行文件一样。但是，随后将由该程序来负责调用相应的 MPI API（如 MPI_Comm_spawn 或 MPI_Comm_spawn_multiple）来生成 MPI 作业的其他进程。

要一开始就创建运行多个进程的 MPI 作业，请使用 mpirun 实用程序。例如，如果您要使用总共 8 个进程在 2 个节点上运行我们的示例 MPI 程序，可以使用以下命令：

mpirun -np 8 -host hostname1,hostname2 hello.x

有几个选项可以与 mpirun 一起用来控制绑定、布局、输出重定向等等。通过执行 mpirun -h 或 man mpirun 可以获取有关这些选项的更多信息。

缺少了库文件。

在链接选项中增加mpi相对应的库文件，或者在代码中增加

#pragma comment (lib, "yourmpi.lib")

就可以了。

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