想实现一个MPI并行计算的程序的话,只要掌握MPI的工作机理和6个简单的MPI函数便可以了,本文介绍4个简单MPI函数:MPI_INIT、MPI_COMM_RANK、MPI_COMM_SIZE和MPI_FINALIZE。
注意:以下调用格式为Fortran格式,大部分教程都是C语言的MPI介绍,这里以及以后的文章都是以Fortran为基础,尤其要注意Fortran不分大小写。
先给出一个最简单的Hello_world的Fortran + MPI的程序,在此基础上来分析MPI的4个最简单的函数——MPI_INIT、MPI_COMM_RANK、MPI_COMM_SIZE和MPI_FINALIZE。
MPI_Init用来初始化MPI执行环境,建立多个MPI进程之间的联系,为后续通信做准备。
MPI_Finalize则是结束MPI执行环境。
MPI_Comm_rank就是来标识各个MPI进程的,告诉调用该函数的进程“我是谁?”。
MPI_COMM_SIZE用来标识相应进程组中有多少个进程。
2.1. 将以上内容保存为hello_world.f90,上传到服务器的文件夹/home/xldeng/mpi里面:
2.2. 编译hello_world.f90为hello_world,并用ls查看内容:
2.3. 使用服务器里面的命令来调用不同的节点上面的核来计算:
3.1 . 注意程序中的一个小细节:
含义为调用mpi的库函数,因为使用的是Intel MPI + Fortran90,所以调用的方式为:use mpi。Fortran77可能需要 include "mpif.h"。
3.2 . 在2.2节中的mpiifort是ifort的并行使用方法,检验mpiifort的用法:which mpiifort或者是mpiifort -v。
3.3 . 在2.3节中的说明:本程序的运行平台为服务器上,所以使用的是 MPI使用指南 | 武汉大学超算中心 中提供的提交方法。如果在单台服务器上面,可以使用如下命令:
来运行程序。
首先,工欲善其事必先利其器——搭建Fortran的MPI并行的环境。
因为是使用的是学校服务器—— MPI使用指南 | 武汉大学超算中心 。
选用的是Intel提供的MPI服务。
1、修改环境变量:
注意 :在单个服务器上面的环境变量修改,记得按照默认的路径按照:
2、检验是否成功。
和
最后是调试时候能够正常使用。 MPI使用指南 | 武汉大学超算中心 提供的是C语言版本的使用方法,并且使用slurm调度系统进行提交。以后的文章会根据这上面的内容来调试相关的学习内容。
有以下可能:1、mpif.h没有找到,这种情况编译器应该提示的。
2、mpif.h格式不正确
3、没有设置好链接库。
都志辉有一本MPI的书,他的主页上可以下载(自己搜索一下),然后看看怎么设置。
欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出
评论列表(0条)