当使用spatstat包时,首先需要安装和加载,并建立点集,这个过程用spatstat包中的ppp()函数将已有数据封装为特定格式。包括数据的x、y坐标,观察窗口也就是分析窗口的大小。ppp()函数允许建立矩形、多边形等不同形状的观察窗口。
描述空间点模式的方法可分为 :事件间的绝对位置具有决定性作用, :事件间的相对位置和距离具有决定性作用,即空间相互作用。其中又分为多种方法进行空间分布的判定和检测。
一阶效应方法。假设图1左为正在考察的空间点分布,可利用以下三个步骤进行分析。
样方分析不仅依赖于样方也就是观测窗口的大小,且密度起到了决定性因素,而不能判别点与点之间的相互关系,也就是相对距离,当网格内手旁点的数量相等但分布不同时,这种方法完全无法分辨。如图2所示,左右两个点分布得到的点个数完全相同但有着完全不同的分布。
即 指数 ,测量每个点与其最近点中心之间的距离,计算所有这些最近邻距离的平均值。如果该平均距离小于假设随机分布中的平均距离,则认为该分布为聚类分布。反之如果该平均距离大于假设随机分布中的平均距离,则为均匀分布。
上式中 为柏松分布也就是普通随机分布时计算得到的平均距离,则 , 为点的个数, 为面积。 为检测数据计算得到的平均距离。
这个公式的本质是将柏松随机分布作为参考标准,计算柏松随机分布时各个点到最近点的距离的平均值 ,并以同样方法计算待考察的分布格局各个点到最近点的距离( ),并将两个数值进行比较。因此当待考察格局同样为随机分布时,两种格局没有差异, 。当待考察格局为聚集分布时,则大部分点距离其最近点的距离更近,则 ,反之,当待考察格局为均匀分布时, 。
clarkevans()函数可以计算ppp数据形式的 。该函数将给出3个数值,分别是无边缘培薯枯矫正和使用不同边缘矫正方法得到的结果。
clarkevans.test()函数用来执行点模式的假设检验,其空假设为模式是完全的空间随机性,即均匀Poisson过程。边缘矫正方法可选。
函数
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