touch down PCR的程序是怎么样的?

touch down PCR的程序是怎么样的?,第1张

就是在设置退火那一步时,大部分脊改机器都自带一个程序,你可以每个循环降低或增加多少银圆度,樱搏判例如你设置的是每循环减少0.5度,起始退火温度是60度,那么第二个循环就是59.5度,第三个循环就是59度,依次递减,增加也可以

标准的PCR反应体系:10×扩增缓冲液

10ul

4种dNTP混合物

各200umol/L

引物

各10~100pmol

模板DNA

0.2ug

Taq

DNA聚合酶

2.5u

Mg2+

1.5mmol/L

加双或三蒸水至

100ul

PCR反应五要素:参加困迅PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+

引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR

产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度.理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增.设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右.②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段.③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少汪物此扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条蚂州带.ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列.④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带.⑤引物3’端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败.⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处.⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性

希望有所帮助


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