学校Linux服务器上如何跑R脚本

只需要在R脚本首行，加入下图中的代码即可：

R --no-save <mergefiles.r

 

nohup R [options] [<infile] [>outfile]

nohup 后台运行程序

options：

--version 查看R版本；

--slave 只打印R脚本的输出，而不显示脚本具体执行情况； 

--vanilla是 --no-save, --no-restore, --no-site-file, --no-init-file 和 --no-environ的综合；

--args 后面是需要传递的参数。

注意：options必须选择--save，--no-save, --vanilla三个中的一个。

比如编辑一个mergefiles.r文件如下：

R --slave --vanilla <mergefiles.r

linux下，没有文件扩展名的区分，任何扩展名的文件可能是一个shell，要在后台运行，有以下几种情况：

1.在命令后面加上&，就可以使该命令在后台进行工作，这样做最大的好处就是不怕被ctrl+c这个中断指令所中断。

2. 在后台执行的程序怎么使它恢复到前台来运行呢？很简单，只用执行fg这个命令，就可以了。

3.已经在前台运行的命令，我能把它放到后台去运行么？当然可以了，只要执行ctrl+z就可以做到了。

4.如果我有多个进程在后台运行，那如何恢复到前台来执行呢？这时候就要用到jobs这个命令了，通过jobs这个命令，能够列出所有在后台执行的进程，那个中括号（[ ]）里面的数字就是 jobs 的代号啰 ，通过fg %number 就可以恢复指定的后台进程.

5.另外，screen可以实现类似后台运行的交互 *** 作。

背景 ：工作需要，需要远程控制主机使其断开Xshell后也能一直运行。

关键字 ：& ，nohup，脚本挂起。

在应用Unix/Linux时，我们一般想让某个程序在后台运行，于是我们将常会用 &在程序结尾来让程序自动运行。

键入Ctrl + C，发出SIGINT信号，程序会继续运行

方法一、输入命令：jobs

方法二：输入命令：ps

fg、bg、jobs、&、nohup、ctrl+z、ctrl+c 命令

加在一个命令的最后，可以把这个命令放到后台执行，如

可以将一个正在前台执行的命令放到后台，并且处于暂停状态。

查看当前有多少在后台运行的命令

jobs -l选项可显示所有任务的PID，jobs的状态可以是running, stopped, Terminated。但是如果任务被终止了（kill），shell 从当前的shell环境已知的列表中删除任务的进程标识。

将后台中的命令调至前台继续运行。如果后台中有多个命令，可以用fg %jobnumber（是命令编号，不是进程号）将选中的命令调出。

将一个在后台暂停的命令，变成在后台继续执行。如果后台中有多个命令，可以用bg %jobnumber将选中的命令调出。

法子1：通过jobs命令查看job号（假设为num），然后执行kill %num

法子2：通过ps命令查看job的进程号（PID，假设为pid），然后执行kill pid

前台进程的终止：Ctrl+c

如果让程序始终在后台执行，即使关闭当前的终端也执行（之前的&做不到），这时候需要nohup。该命令可以在你退出帐户/关闭终端之后继续运行相应的进程。

关闭中断后，在另一个终端jobs已经无法看到后台跑得程序了，此时利用ps（进程查看命令）

如上所示：

nohup 和 & 组合了后台运行程序。

可以输出到 out.log保存程序输出，也可以输出到/dev/null 即空设备，不保存输出。

上面三种方式无论在nohup.out 或test.out都看不到数据结果，这是因为python执行有缓存输出

解决

新的接口接入查看程序

使用&后台运行程序：

结果会输出到终端

使用Ctrl + C发送SIGINT信号， 程序免疫

关闭session发送SIGHUP信号， 程序关闭

使用nohup运行程序：

结果默认会输出到nohup.out

使用Ctrl + C发送SIGINT信号， 程序关闭

关闭session发送SIGHUP信号， 程序免疫

平日线上经常使用nohup和&配合来启动程序：

同时免疫SIGINT和SIGHUP信号

同时，还有一个最佳实践：

不要将信息输出到终端标准输出，标准错误输出，而要用日志组件将信息记录到日志里

nohup和&究竟有啥区别

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