设置k:选中区域-设置单元格格式-数字-自定义-类型框-输入(清除预设内容):000, "K"(小数位自己调整,现为2位)-确定
设置M:选中区域-设置单元格格式-数字-自定义-类型框输入(清除预设内容):000,, "M"(小数位自己调整,现为2位)-确定
如图:
根据检测结果上的参数查看。
基于种内多态和种间分歧度的检测是否符合中性进化模型的方法,MK检验的原理是:在无选择作用的中性条件下,所研究基因的种内的同义、非同义突变应与种间同义、非同义突变成正比。反之,则推翻零假设,即基因不同物种中受到了选择的作用。MK检验思路简洁,计算简单,但在检验中性假说方面却很有说服力。而且该检验与以上提到的检验相比,不需要很多假设限制,重组和种群大小的动态对检验结果没有影响。
McDonald和Kreitman(1991)对所研究的DNA序列的位点首先进行分类,以区分种内差异和种间差异。将种内个体间无硷基差异而种间有明显硷基差异的位点,定义为固定位点(fixedsite),作为种间差异的标_。将种内个体间有硷基差异的位点,定义为多态性位点(polymorphicsite),作为种内多态性的标_。分辨出样本的多态位点和固定位点之后,将各位点上的突变再按同义突变位点和错义突变位点加以区分。
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