根据检测结果上的参数查看。
基于种内多态和种间分歧度的检测是否符合中性进化模型的方法,MK检验的原理是:在无选择作用的中性条件下,所研究基因的种内的同义、非同义突变应与种间同义、非同义突变成正比。反之,则推翻零假设,即基因不同物种中受到了选择的作用。MK检验思路简洁,计算简单,但在检验中性假说方面却很有说服力。而且该检验与以上提到的检验相比,不需要很多假设限制,重组和种群大小的动态对检验结果没有影响。
McDonald和Kreitman(1991)对所研究的DNA序列的位点首先进行分类,以区分种内差异和种间差异。将种内个体间无硷基差异而种间有明显硷基差异的位点,定义为固定位点(fixedsite),作为种间差异的标_。将种内个体间有硷基差异的位点,定义为多态性位点(polymorphicsite),作为种内多态性的标_。分辨出样本的多态位点和固定位点之后,将各位点上的突变再按同义突变位点和错义突变位点加以区分。
Fortran多princeado(站内联系TA)M-K检验是做趋势分析还是突变检验,我编了相关的程序,不是很长的,用R语言编的,不过DPS系统也可以做M-K检验,如果有你可以试一下guoguo1983(站内联系TA)要是用MK做趋势检验,用那个软件呀princeado(站内联系TA)做趋势分析的话可以用R语言来做,有个包可以做,另外我编了一段的程序,不是很长,DPS系统也可以做,很方便。shzrzheng(站内联系TA)知道原理后,自己编编程序做shhongyuan6331(站内联系TA)DPS:tiger28:leehui789(站内联系TA)现代气候统计诊断与预测技术 气象出版社挺方便的gishuazi(站内联系TA)建议看看陈彦光的书wuyang2468(站内联系TA)用R或者Matlab吧,发文章的话,R的公信度还是比较高的。erqie(站内联系TA)借地问一句,R语言是什么呀?horseechen(站内联系TA)我不是搞地学水文研究的,不过处理离散数据序列时检测突变点也想用这个检验方法,发现网上多数是中国人写的文章,而且错误百出。不这我发现这个方法太受秩序列长度的限制了,对于同样一组数据,整体趋势分析的结果跟分段分析的结果,在突变点检测上几乎没有一致的精度。lijun2011(站内联系TA)R也是一个统计软件,代码公开,不收费的软件,国外用的人多,国内不怎么用geonuist(站内联系TA)EXCEL编个宏,可以看看陈彦光写的《基于EXCEL的地理数据分析》,里面有介绍儿时梦想尚未成(站内联系TA)最近刚刚发现有个EXCEL插件很好用,XLSTATE2013,网上可以下载:victory:geonuist(站内联系TA)EXCEL就可以做,详见本论坛中陈彦光编写的《基于EXCEL的地理数据分析》
在进行mk趋势检验时,设置005置信水平,出图显示001,可以用来查看更多细节,以便更准确地检测趋势。图中的每一点都表示一个特定的置信水平,通过比较每个点的值,可以更好地判断是否存在趋势。
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