RNA是单连的,单独复制时没有检查程序,变DNA不但可以检查还可以加速复制,还有一点,就是在有DNA的细胞中 RNA无法复制RNA,只有 DNA可以生产RNA
RNA自我复制只能自带酶 很麻烦,还慢,所以绕个弯
1、PCR引物设计
PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。
引物设计的基本原则:引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。
引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3 ′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。
引物3′端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,最佳选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。
2、模板的制备
PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、真菌等。也可以是病理生理标本如细胞、血液、羊水细胞等。法医学标本有血斑、精斑、毛发等。
标本处理的基本要求是除去杂质,并部分纯化标本中的核酸。多数样品需要经过SDS和蛋白酶K处理。难以破碎的细菌,可用溶菌酶加EDTA处理。所得到的粗制DNA,经酚、氯仿抽提纯化,再用乙醇沉淀后用作PCR反应模板。
(一) Sanger双脱氧链终止法(酶法)测序程序 *** 作程序是按DNA复制和RNA反转录的原理设计的。
1分离待测核酸模板,模板可以是DNA,也可以是RNA,可以是双链,也可以是单链。
2在4只试管中加入适当的引物、模板、4种dNTP(包括放射性标记的ddNTP,例如32P ddNTP和DNA聚合酶(如以RNA为模板,则用反转录酶),再在上述4只管中分别加入一种一定浓度的ddNTP(双脱氧核苷酸)。
3与单链模板(如以双链作模板,要作变性处理)结合的引物,在DNA聚合酶作用下从5’端向3’端进行延伸反应,32P随着引物延长掺入到新合成链中。当ddNTP掺入时,由于它在3’位置没有羟基,故不与下一个dNTP结合,从而使链延伸终止。ddNTP在不同位置掺入,因而产生一系列不同长度的新的DNA链。
4用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳同时分离4只反应管中的反应产物,由于每一反应管中只加一种ddNTP(如ddATP),则该管中各种长度的DNA都终止于该种碱基(如A)处。所以凝胶电泳中该泳道不同带的DNA 3’ 末端都为同一种双脱氧碱基。
5放射自显影。根据四泳道的编号和每个泳道中DNA带的位置直接从自显影图谱上读出与模板链互补的新链序列。
探索验证与发育相关的基因,比方说,控制开花的基因我们假设是一个。
1、用某种方法把它敲除,即基因敲除,植物不开花了,那我们就可以说,这是控制开花的基因;
2、用反义RNA进行抑制,基因不表达了,也可以确定;
3、把这个基因克隆出来,转到另外一种生物上面,这种转基因生物能开花了,呵呵,就可以验证了。
很简单吧?其实很难,确定一个基因要好多年。。。
不可以,建议不要隔天做。
反转录得到的cDNA用途广泛,经后续实验可用于检测细胞/组织中基因表达水平,分析细胞中RNA病毒的含量,合成cDNA探针,直接克隆特定基因的cDNA序列,构建cDNA文库等研究。
对于反转录实验,反转录酶的选择至关重要,热稳定性高、聚合能力强、灵敏度高、特异性高的反转录酶将会使反转录实验事半功倍。
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