massbank网站可以导入原始数据

massbank网站可以导入原始数据。用户通过HTTP协议提交请求并携带原始数据创建导入，MassBank是一个网络开放的数据库，旨在公开分享从，代谢物的化学标准品得到的质谱图，以方便用户进行代谢物的鉴定。

手动通过输入提问谱图中一定数目的质谱峰数据（质荷比、丰度），在数据库中进行匹配，获得与提问谱相似的谱图。

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植物代谢组 | 一文了解用于质谱定性的代谢物数据库

4 个月前 · 来自专栏 代谢组及多组学技术

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上期我们整体看了一下公共/自建数据库的类型，我们也能很清楚的发现，对于不同的数据库有着不同的用途，本期我们就具体来讲讲用于质谱数据匹配的数据库。(点此阅读原文）

1.NIST（National Institute of Standards and Technology）：包含气质平台30万+代谢物

NIST数据库是由美国国家标准技术研究院出版，一般与GC-MS平台配套使用。对于该数据库目前没有开放使用，但是网页版本的数据库开放使用，网页版本的可以看作是NIST的标准参考数据库Standard ReferenceData中一部分与化学有关的数据库的Web版本，可通过分子式检索、化学名检索、CAS登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法，得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vi色谱、振动及电子色谱等。

网页链接：https://webbook.nist.gov/chemistry/

2. MassBank：包含来自气质液质不同平台不同模式共15055种物质

MassBank是一个高质量的质谱数据库，旨在公开分享从代谢物的化学标准品得到的质谱图以方便用户进行代谢物的鉴定，包含了代谢物的质谱信息以及采集情况，这些信息来自于不同的质谱仪设置，包括不同的电离技术，例如ESI、EI、 CI、APCI以及MALDI。

MassBank有三个不同的数据库：MassBank of North America (MoNa) 、the European MassBank 、the Japanese MSSJ MassBank，其中MoNa整合了更多来源的数据，因此相比其他两个更加受到科研工作者群体的偏好。

但是对于鉴定植物中的代谢物而言，MassBank中所包含的数据库是有限的，尤其是以质谱平台进行了限制，用于检测植物的主要是液相质谱平台，其中使用较多的是以ESI离子源为主要类型，所有包含ESI离子源这种类型的数目加起来是11592个物质。

METLIN数据库中的质谱图可以与一些不同的质谱仪产生的谱图进行很好的匹配，包括了其中包括AB公司的 Triple TOF 5600，安捷伦的 6460 Triple Quad，Thermo的 Q-Exactive和 LTQ Orbitrap Velos（使用任何一种CID 或HCD碰撞形式）。该数据库的不足在于所有的数据不支持下载，必须在线查看，这也使得研究者不能使用这些二级碎片信息来开发新的检索工具或者应用工具。虽然如果实验室拥有安捷伦公司生产的质谱仪器，用户可以向生产商购买METLIN的数据库，但是购买的数据库的并不能跟网络数据库同步更新。安捷伦的METLIN个人数据库中（personalmetabolite database，PMD）中包含有9083个化合物，其中4165个为代谢物，其他的为二肽或者三肽。

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