请教千人基因组数据库中的一些问题~~~~~求前辈详细指教

请教千人基因组数据库中的一些问题~~~~~求前辈详细指教,第1张

vega:vertebrate genome annotation database

HUGO:Human Genome Organization

HGNC:The HUGO Gene Nomenclature Committee

ENSEMBL:http://baike.baidu.com/view/2028023.htm

CCDS:The consensus coding sequence

括号里注明的是基因诠释的来源----不同的数据库。

图中最左边的是Y染色体,右面的三列应该是做的统计。

第一列,genes和known genes表示在Y染色体对应的位置基因的数量,已知基因用红色柱,所有基因用空心柱,红色柱越长表示该区域的基因我们了解的越精细。

第二列,是统计DNA的GC含量和重复序列的比例,各有符号表示,根据颜色可辨别。

第三列,是统计突变位点,柱的长短代表了该区域的DNA的突变几率的大小。

1、首先你写出正确的英文蛋白质名:insulin,hemoglobin

2、到HGNC网站: 输入以上单词进行查询

3、查询结果:inslin:的基因名字INS hemoglobin有很多对应,因为hemoglobin是有很多亚基的,比如你要研究alpha 1亚基,那基因名字就是HBA1喽

就这么简单了。

如果你想批量查询就去吧HGNC数据库下来,就ok了。


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原文地址: https://outofmemory.cn/sjk/10030578.html

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