rna分布在玉米叶肉细胞的那里

RNA在玉米叶肉细胞中的分布是有一定的规律的。研究表明，在叶肉细胞中，mRNA主要分布在细胞核以外的高密度区，而rRNA则集中在细胞核内以及叶肉细胞的周边。此外，还有一种叫做tRNA的RNA，它分布在细胞核和胞浆之间，构成了玉米叶肉细胞的核膜与细胞质中的双信使系统。这表明，DNA在玉米叶肉细胞中已经发挥了重要作用，无论是在高密度区域分布的mRNA，还是在细胞核内分布的rRNA，都在调节和维持着细胞状态的稳定性。因此，借助玉米叶肉细胞中RNA的调控和分布，生物学家们不仅可以深入了解玉米的生物学特性，也可以探究其他植物的基础生物学机制。

我查询了NCBI数据库，在核酸数据库（Genbank）中确实没有查询结果，但是其他数据库是有结果的，例如蛋白质数据库中。

我想你是知道的，胰高血糖素是胰高血糖素经过酶切的产物，也就是说都是“翻译后”的发生的事情。

回过头了，我们来说NCBI。NCBI的核酸序列都是生物学家通过测序获得的，要么是基因组序列，要么是转录组序列。所有序列都是以基因名为主要检索词

因此，如果你用基因名称GCG或glucogen检索就可以检索到你想要的结果。参考资料中是gene database的链接。

看一下这个链接

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可以选择红色方框里的数据库，主要用前面两个：genomic sequence 和 CDS sequence。

1、分别是基因组序列和CDS（mRNA）序列。这里选择基因组序列数据库

2、在红色方框里粘贴FASTA格式的序列

3、点击“submit”提交

4、点击blast result 中的 accession下的 LOC号，即红色方框的内

5、在以下页面中，即可下载序列（分别有CDS序列和genomic序列），还可以在 genome browser中查看该基因在基因组中染色体的位置等信息，还有基因结构的信息。该图中浅色部分是UTR，深色部分是CDS

6、用genome browser中查看该基因信息，点选track下的general中的DNA/GC content ，--->update image ，再放大图像即可看到以下结果。

问题不是很明确，是想进行序列比对与结构比对吗？序列比对用ncbi网站中的blast就可以分别进行核酸与蛋白的比对，蛋白结构比对，如果没有晶体结构，就需要先同源建模，再进行结构拟合就可以了！希望能帮到你，有问题欢迎追问！

一、真核生物mRNA的结构：

二、建库方式：

真核生物mRNA含有poly-A尾，因此最常用的富集真核生物mRNA的方法就是采用附着poly-T oligo的磁珠从total RNA 中抓取mRNA。建库示意图如下图所示：

1、提取总RNA：提取总RNA后需要对其进行质量检查，包括纯度、浓度和完整性（RIN）。如果总RNA起始量太低，不能保证有足够的mRNA用于建库。另外RNA容易降解，而采用附着poly-T oligo的磁珠捕获降解后的RNA会产生3'偏好性，因此建议RIN值大于等于7。

2、mRNA捕获：真核生物的成熟mRNA带有poly-A尾，因此可以采用附着poly-T oligo的磁珠从总RNA中捕获mRNA。

3、mRNA片段化：

4、cDNA第一链合成：以mRNA为模板合成cDNA。

5、cDNA第二链合成：以cDNA第一链为模板合成cDNA第二链。

6、双链cDNA末端修复：3'加A，5'修复。

7、加接头：

8、PCR富集mRNA文库。

9、上机测序。

三、生信分析：

1、数据拆分：利用bcl2fastq软件将bcl文件转换成fastq文件。

2、数据预处理：有些测序reads可能包含测序接头、引物序列、低质量碱基、N含量较高，因此通常需要对测序数据进行预处理，去除这些不合格的碱基或reads。常用的软件有fastp，cutadpater以及Trimmonmatic等。

3、质控分析：对预处理后的数据进行质控分析，通常采用fastqc。

4、参考基因组比对：将测序数据与参考基因组进行比对，常用的比对软件有hisat2，tophat2，STAR等。

5、转录本的组装和定量：常用的软件有cufflinks，stringtie等。

6、差异分析：分析不同处理条件下基因或转录本的表达是否有差异，穿能够与的软件有DEseq2，edger，ballgown等。

7、富集分析：对差异基因进行富集分析，统计学原理是基于超几何分布。

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