swiss-model不能建模说明这个全长基因不正确么

swiss-model的蛋白质结构模拟是基于目标序列与已知蛋白质结构的序列进行同源性比较得到的。你RACE所得到的结果虽然在blast里找到了同源基因，但此同源基因所表达的蛋白质结构并不一定是已知的，也就是说，swiss-model的数据库里并不一定有类似基因的蛋白质结构，也就不能模拟出你的目标基因结构了，这并不能说明你的基因全长有问题。

但是，swiss-model一般还是可以模拟出目标基因的部分结构的，也就是基因中同源性和其他物种都比较高的一部分，如果说无法建模，则说明不是你的基因特异性太高，就是全长确实有问题。

强烈建议你查看一下blast结果所得到的同源序列说明，看看其是否是一条表达基因。

the entry has been manually annotated and reviewed by UniProtKB curators or not, in other words, if the entry belongs to the Swiss-Prot section of UniProtKB (reviewed) or to the computer-annotated TrEMBL section (unreviewed)

总的而言有下列12种

0 = pairwise,显示具体匹配信息（缺省）

1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域，显示一致性

2 = query-anchored no identities,查询-比上区域，不显示一致性

3 = flat query-anchored, show identities,查询-比上区域的屏文形式，显示一致性

4 = flat query-anchored, no identities,查询-比上区域的屏文形式，不显示一致性

5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域，不显示一致性，无突然的结束

6 = flat query-anchored, no identities and blunt ends,查询-比上区域的屏文形式，不显示一致性

7 = XML Blast output,XML格式的输出

8 = tabular,TAB格式的输出

9 =tabular with comment lines,带注释行的TAB格式的输出

10 =ASN, text,文本方式的ASN格式输出

11 =ASN, binary [Integer] default = 0,二进制方式的ASN格式输出

但是如果你在网站上进行，一般就为2-5种，如0 = pairwise, 8 = tabular,7 = XML Blast output，看你在哪个站点进行了

swisstarget下载不了是bug导致。由于使用swisstarget数据库的人数过多，使swisstarget数据库的后台崩溃，导致了出现无法使用的bug，截止到2022年7月30日，官网已经紧急修复了此问题，可以正常使用了。

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