FreeSurfer-Introduction

【摘要】 FreeSurfer - Cortical surface and subcortical modelling 皮层表面和皮质下侍冲建模

Test your FreeSurfer Installation

详解

FS-FAST Preprocessing

Once the data have been arranged in the proper directory structure and naming convention, they are ready to be preprocessed. Preprocessing includes：

Fixing a bad skull strip

FsFastTutorialV6.0

mris_ca_train 从一组带注释的主题创建地图集、 mris_ca_label 对于单个主题，生成一个注释文件，其中每个皮质表面顶点都分配有一个神经解剖标签、 mris_sample_parc 采样

Linux Freesurfer脑数老改歼据分割 ：

命令行，经过试验，加入-T1会避免由于原歼敏图的灰度值范围不对导致的报错，也可以更干净地去除脑壳，阈值选20（加入-T1比不加去得更干净）,但可能会误剔除，需测试后再进行批处理 *** 作。

对比 ：两种方法效果基本一致，recon-all提取的输出细节更细腻一点

after -autorecon1 , -autorecon2 includes 白质分割、 皮下组织分割

格式不正确。

其理由如下：1、看看su文件格式是否为.skp，如果是，就有两雹辩种可能，一是由于系统还原破坏了数据。二是系统还原，SketchUp程序注册表出现问题。如果不是，说明系统中毒，病毒念宴更改了文件格式的后缀，请手动更仔肆银改。2、一种可能是你打开的是模型文件的同名备份文件，选择文件打开才行。

总之，重新装一遍SketchUp再说。可能文件坏掉了，还有就是版本问题，如果升级后8还是不行那就是坏掉了。

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