如何使用geo数据库mirna

如何使用geo数据库mirna,第1张

如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,RNA22,mirbase,PITA,microcosom等等

如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,RNA22,mirbase,PITA,microcosom等等

根据给出相关的文献,组织类型,检验的方法等数据可以检验数据库。
可以同时输出miRNA和gene,也可以只输入其中一种进行检索。输入的miRNA名称需要符合mirBase数据库中的miRNA名字的格式,对于gene,支持genesymbol和ensemblgeneID两种格式。


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原文地址: https://outofmemory.cn/yw/10249499.html

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