R ggplot和ggsignif箱线图添加显著性差异标识

R ggplot和ggsignif箱线图添加显著性差异标识,第1张

有时候我们会看到如上,觉得挺好,但是如何实现呢?没有做的的时候,觉得挺难,但是真要做才发现没有那么困难?
其实做这样的图,目前R比较常用的包有两个,分别为:ggsignif和ggpubr,两者的用法大体差不多,有一些细微从差别,但是结果几乎一样。这里我用的是ggsignif,下面将介绍ggsignif的用法。

两种安装方式:

一般根据数据是否符合正态分布,选择合适的统计方法:

ggsignif包主要函数为:geom_signif()和stat_signif(),常用geom_signif()。
常用参数如下:

test数据集两列,一列是基因表达量,一列是分组。

神奇小工具丨ggplot绘图显著性添加工具---ggsignif

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