1、VESTA
VASTA是一个三维可视化软件,能够搭建结构模型、调整晶体结构参数和显外观示,而且在学术、科学、教育及非商业应用中使用,但是最好在发表时引用下面这个参考文献:K. Momma and F. Izumi, “VESTA 3 for three-dimensional visualization of crystal, volumetric and morphology data,” J. Appl. Crystallogr., 44, 1272–1276 (2011)
2、MatCloud+
MatCloud+是一个云平台,就是说无需下载安装任何软件, 就可使用。 如果记不住域名,百度搜索MatCloud+关键词就可,登录之后就可以搭建晶体、小分子、高分子等体系,还可以同时搭建多个模型(之前的课题搭建过多个掺杂模型),功能比较强大,有详细使用教程,比较容易上手,楼主可以试试这个平台。
分子建模涵盖了用于建模或模仿分子行为的所有理论和计算方法,该方法已应用于计算化学、药物设计、计算生物学和材料科学等领域,研究从小型化学系统到组装大型生物分子和材料的分子系统,虽然最简单的计算可以手动执行,但为了对大小合理的系统进行分子建模,不可避免地需要用上计算机。那么Windows端有什么比较好用的分子建模软件呢?一起来看一下。
一、Windows端有什么比较好用的分子建模软件呢?
1、Chem3D。Chem3D是一个强大的桌面建模程序,我们可以用它生成小分子和生物大分子的3D模型,对模型执行各种计算和 *** 作来研究物质的属性和相互作用,3D建模、可视化、计算等丰富的功能,可以更好、更快地确定研究重点,提高生产力,迅速实现研究目标。
2、VESTA。VESTA也是Windows端比较好用的分子建模软件,这个软件是适用结构模型体积数据,比如说电子核密度和晶体形态的三维可视化的程序,并且还可以在同一个窗口中处理多个机构模型,体积数据以及晶体形态。
二、分子模型的作用是什么?
分子模型是分子空间结构的直观表现,包含键长键角,主要为空间构象,也可以旋转结合,建立不同的空间构型来观察分子的稳定性,分子既可以由同种原子构成,也可以由不同种类的原子构成,最简单的分子只含有一个原子,就像稀有气体的分子,非金属构成的分子大多是氮、氧等双原子分子, 化合物是由不同元素组成的分子,数量最多。不过随着分子概念的发展,化学家对无机分子的理解也逐渐加深。 例如,氯化钠是由钠离子和氯离子以离子键连接的无限结构,很难准确指出其分子中含有多少钠离子和氯离子,也无法确定分子量。
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