oracle pdb数据库怎么打开

PDB全称为Pluggable Database，即可插拔数据库。

打开PDB数据库的方法有两种：

方式1：

SQL> alter pluggable database PDBEPPS open;

Pluggable database altered

SQL> select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs;

CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE

---------- ---------- -------------------------------- ------------------------------ ----------

2 4071321146 E89E8DA2866E3157E043DE07A8C09238 PDB$SEED READ ONLY

3 1930201447 E89E9418B882350CE043DE07A8C092B6 PDBEPPS READ WRITE

方式2：

SQL> alter session set container=PDBEPPS;

Session altered

SQL> startup

Pluggable Database opened

PDB 是蛋白质复合物的数据库，一个pdb id 往往代表多个蛋白质形成的复合物，或者蛋白质与小分子形成的复合物。而uniprot是蛋白质数据库，一个id就代表一个蛋白质。

考虑到一个蛋白质可能与多个其他蛋白或者小分子组合，因此，不同的pdb中会包含相同的蛋白质，也就是说一个uniprot id会对应多个pdb id

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

1、UniProt数据库

蛋白组学常用数据库UniProt（全称UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的，其信息量丰富、资源广泛，是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

2、The Human Protein Atlas数据库

The Human Protein Atlas内含近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，并提供免费查询。

瑞典Knut&Alice Wallenberg基金会利用免疫组化技术，检查每一种蛋白质在人类48种正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员校对和标引，保证染色结果具有充分的代表性。

3、PhosphoSitePlus数据库

PhosphoSitePlus数据库是一个由CST和NIH联合开发的免费资源数据库，总结归纳了海量通过科学研究发现的蛋白修饰位点，包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等，并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白修饰位点。

该数据库是动态的、开放的、高度互动并持续更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理细胞/组织中的作用，同时它也是发现新的疾病标志物和药物靶点的有力工具。

性能及历史

蛋白质数据库（HPDB），建于2005年5月，动态展示生物大分子立体结构，鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离，可用于教学或科研。服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者。

分子结构特征描述采用汉语，同时提供英文原文以供考证。对于善于使用英文的读者，我们提倡直接访问RCSB PDB，一来可以减少网络拥挤，二来可以减少由于HPDB的翻译不妥带来的不便。

蛋白质数据库（HPDB）对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译（最新加入数据库的分子除外），内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库，因此HPDB支持中文查询。

蛋白质数据库（HPDB）虽然翻译了“分子结构说明”部分，但为了保证数据的可靠性和准确性，HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动，数据库保持RCSB PDB核实后的原始实验数据文件，并保持PDB文件格式和蛋白质分子编号。

以下关于PDB数据库描述正确的是：

APDB数据库是一级蛋白质数据库

BPDB数据库存储大分子的3D结构

CPDB数据库里既包含蛋白质的3D结构，也包含核酸的3D结构，以及二者的复合体结构

DPDB数据库里只包含实验方法解析的大分子3D结构

EPDB数据库是二级蛋白质数据库

FPDB数据库只储存蛋白质分子的3D结构

GPDB数据库里既包含实验方法解析的大分子3D结构，也包含计算机预测结构模型

H、X射线衍射法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库

正确答案：PDB数据库是一级蛋白质数据库；PDB数据库存储大分子的3D结构；PDB数据库里既包含蛋白质的3D结构，也包含核酸的3D结构，以及二者的复合体结构；PDB数据库里只包含实验方法解

建一个文件说明表,存放文件的基本信息,如名称,大小,说明,及编号等

建一个文件表,其中只需要文件编号和文件内容即可

因为文件表的数据会比较多,访问会比较慢

这样可以使查询时的速度更快当用户打开或者下载的时候,才需要查询文件表,其它的时候只需要查询文件说明表即可

以上就是关于oracle pdb数据库怎么打开全部的内容，包括:oracle pdb数据库怎么打开、为什么在uniprot中一个ID会对应到PDB数据库中的多个ID、国际著名的三大蛋白质数据库等相关内容解答，如果想了解更多相关内容，可以关注我们，你们的支持是我们更新的动力！