如何查询NCBI里基因信息的所有历史版本

如何查询NCBI里基因信息的所有历史版本,第1张

在NCBI里查询某个基因的信息时,我们经常能看到这样的注释:

网站会告诉你关于这个基因的信息最近的更新时间。那么我就在想,那之前的记录还可以查看吗?如果有的话,应该去哪儿查询呢?

这项技能非常的easy,NCBI官方有一个网页就是介绍如何查询sequence revision history:

>

因此,我建议首先从Swissprot上查询,下面以TPS为例:

1 搜索swissprot中的TPS基因

>

我们得到两个酵母相关基因,利用你的专业知识判断选择一个或两个。

2 点击进入P38426 (TPS3_YEAST),查看蛋白质序列是否你想要的。

3 进入NCBI的Blast服务页面,

>

在basic blast部分,你有两个选择:1)protein blast->搜索蛋白质序列;2)tblastN->搜索核酸序列。

4 进入程序搜索页面,将Swissprot的登录号P38426贴如输入框。

5 再下面就是如何使用Blast。

6 在Blast的结果中,你可以根据序列的相似性找你感兴趣的基因序列。

附图:一个blast的结果

要下载植物叶绿体基因组,你首先需要访问NCBI基因组数据库(>

NCBI主页,选gene/protein database,查newcastle F,选择该基因直接连接到其基因网页:

>

我查询了NCBI数据库,在核酸数据库(Genbank)中确实没有查询结果,但是其他数据库是有结果的,例如蛋白质数据库中。

我想你是知道的,胰高血糖素是胰高血糖素经过酶切的产物,也就是说都是“翻译后”的发生的事情。

回过头了,我们来说NCBI。NCBI的核酸序列都是生物学家通过测序获得的,要么是基因组序列,要么是转录组序列。所有序列都是以基因名为主要检索词

因此,如果你用基因名称GCG或glucogen检索就可以检索到你想要的结果。参考资料中是gene database的链接。

看一下这个链接

>

你好,我在百度上看过你对在ncbi上如何查询核苷酸序列的回答

直接在首页输入你的序列名称 物种种类 然后选择nucleotide 然后search 就行了 不懂再问

怎样查询t7启动子的核苷酸序列

这里有个查询方法

你可以看下

:wenkubaidu/linkurl=qT7m1rvOiU1Ea23s-PIrn0MiO48FpEkR1I_2KJYocrVb79u-m15edfXn96gFXCE1_Vh4f5imS1fsaMggxeRZnhBwd8QNdddveQCn3z_eFrS

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怎么用NCBI查询FeSOD的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢?

一般进入NCBI介面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo, 查询就可以汇出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超连结查询,或者把GENE改成protein,同样查询

所有限制酶识别的核苷酸序列均由6个核苷酸组成

不一定,

有的是四个,

但绝对都是“回文序列”,

这一点你们老师一定讲,

所以切割的都是偶数个,

而不一定是六个;

你们大学要是学的生物系,

到时候肯定也会细说。。。

如何使用已知核苷酸序列在DNA和RNA上得到未知的侧翼序列

反向PCR

:baikebaidu/view/896324htmfunc=retitle

热不对称交错PCR

:bbioo/bio101/2008/21817htm

这两种应该都可以

如何使用ncbi核苷酸blast

Blast(Basic

Local Alignment Search

Tool)是一套在蛋白质资料库或DNA资料库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程式能迅速与公开资料库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。

BLAST

采用一种区域性的演算法获得两个序列中具有相似性的序列。

Blast中常用的程式介绍:

1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列(一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白),再对每一条作一对一的蛋白序列比对。

3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。

4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反,它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。

5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白(每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列),这样每次比对会产生36种比对阵列。

如何排版核苷酸和氨基酸的序列

蛋白质的氨基酸序列就是蛋白质的组成分子----氨基酸的排列顺序核苷酸序列指编码这个蛋白质的mRNA上的碱基排序

naa中 脱氧核苷酸序列代表什么?

遗传资讯

dna连线酶能识别特定核苷酸序列吗

DNA连线酶只能识别特定碱基,与核苷酸序列关系不直接。

除限制性内切酶和聚合酶外,转录和翻译也需要从特定的序列开始,因此启动这个机制的那些酶应该也具有识别特定核苷酸序列的能力。

遗传资讯是指()A.有遗传效应的脱氧核苷酸序列B.脱氧核苷酸C.氨基酸序列D.核苷

A、遗传资讯的是指有遗传效应的脱氧核苷酸序列,A正确;

B、脱氧核苷酸是组成DNA的基本单位,不能代表遗传资讯,B错误;

C、遗传资讯储存在核酸上,C错误;

D、核苷酸是组成核酸的基本单位,不能代表遗传资讯,D错误.

故选:A.

一 美国国家生物技术信息中心NCBI(National Center for

Biotechnology Information)

NCBI是一个极具人性化的网站,网站的主页清晰的阐明了NCBI所做的工作及相关领域最新的热点内容,新闻等。为了方便使用者更加熟练使用网站资源,NCBI在主页清晰的标注了站点导航,非常便于初学者熟悉和掌握NCBI的站内资源。

另外,NCBI将其网站资源列于主页左侧,其中包括:SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature

databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at

NCBI, Software engineering, Education, FTP site, Contact

information等等。

二EBI(European

Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European

Bioinformatics Institute(EBI)是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一,位置座落于英国The Wellcome Trust

Genome Campus。EBI的任务就是确保分子生物与基因体的研究信息可以公开并且免费提供给科学社群,以促进科学进步。

EBI所提供的服务包括建立/维护数据库、提供分子生物相关信息服务、执行分子生物与计算分子生物研究;所服务的对象与研究人员扩及各产业,包括分子生物、基因体、医学与农业学术研究、农业、生物技术、化学与制药工业。

三DDBJ(DNA Data Bank of

Japan)日本核酸数据库

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)

设立在日本国家遗传研究所(NIG),于1986年开始DNA数据库的构建工作。从一开始,DDBJ就作为国际性DNA数据库之一,发挥着重要的作用。它

首先反映的是日本国内数据库的资源,并与NCBI,EBI进行频繁的国际性合作。DNA序列中蕴含了大量的数据资源,比起其它生物学数据,它在阐述进化方面的作用更为直接。因此,探求DNA数据库,不仅是在生命科学方面的研究,更是为人类的发展谋福利。

DDBJ是日本唯一的DNA数据库,它从研究者那里收集DNA 序列并且给数据提交者一个国际公认的编码。DDBJ

主要从日本研究者那里收集数据,当然,它也接受外国研究者的数据并给以编码。

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