Basic BLAST
根据需要选一个(见下面),点击进入就行了。如果你是要确定是哪种菌,就近第一个Blastn。序列粘贴或者导入,其中Choose Search Set中的Database你要选Others (nr etc)。然后点击Blast就行了。如果同源性有9999%以上的就说明是那个物种里的。
Blastn 核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列
Blastp 蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列
Blastx 核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索。
Tblastn 蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对
TBlastx 核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对
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