同源建模和蛋白数据库的区别

同源建模(Homology Modeling)和蛋白数据库(Protein Database)是生物信息学中两个重要的概念，虽然它们都与蛋白质有关，但是它们的意义和作用不同，下面进行详细的说明。

同源建模(Homology Modeling)是一种利用蛋白质序列相似性预测蛋白质三维结构的方法。通过比对已知结构的蛋白质和目标蛋白质的序列相似性，将已知的结构模板应用到目标蛋白质上进行模拟，最终得到目标蛋白质的三维结构。同源建模需要依赖一些已知的蛋白质结构数据库，例如PDB（Protein Data Bank）。同源建模可应用于一些新发现的蛋白质，或者是一些难以通过实验手段获得的蛋白质结构，对于研究蛋白质的结构与功能具有重要意义。

蛋白数据库(Protein Database)是指收集和管理各种蛋白质结构信息的数据库，包括各种蛋白质的三维结构、二级结构、拓扑结构、氨基酸序列和功能等多种信息。蛋白数据库是一个包含海量关于蛋白质的信息资源库，包含了全球各地研究人员的数据成果，为研究蛋白质的功能和结构提供了方便。

可以看出，同源建模和蛋白数据库的区别在于其关注的重点不同。同源建模着重于预测蛋白质的三维结构，依赖于已知的蛋白质结构信息，而蛋白数据库则是对多种蛋白质结构信息的集成和整理，为研究人员提供了海量的资源和数据分析工具，以及对于蛋白质结构和功能的解析和注释。两者紧密联系且相辅相成，均为研究蛋白质的结构与功能提供了重要的支持。

NCBI上可以查分子量，还有其它的方也可以查。我推荐几个吧：

Genecards: :>

SWISS-PROT是含有详细注释内容的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学中心（EBI）维护，目前已合并入 UniProt数据库，旨在帮助基因组和蛋白质组以及相关的分子生物学研究人员提供有关蛋白质氨基酸序列的最新信息。

SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列，并与其它30多个数据建立

了交叉引用，其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。SWISS-PROT数据库包含了EMBL核酸序列数据库中被经过仔细检查和准确注释了

的蛋白质序列，一般地，任何蛋白质序列数据的搜寻和比较都应从SWISS-PROT开始。

SWISS-PROT蛋白质序列数据由大量序列条目组成，每一个序列条目

有其自己的格式。为了标准化的目的，SWISS-PROT的格式与EMBL核酸序列数据库的格式尽可能类似。SWISS-PROT涉及已知蛋白质的序列、

引用文献信息、分类学信息、注释等，注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关

系、序列变异体和冲突等信息。利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的数据库。SWISS-PROT只接受直接测序

获得的蛋白质序列，序列提交可以在其Web页面上完成。

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