oracle pdb数据库怎么打开

PDB全称为Pluggable Database，即可插拔数据库。

打开PDB数据库的方法有两种：

方式1：

SQL> alter pluggable database PDBEPPS open;

Pluggable database altered

SQL> select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs;

CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE

---------- ---------- -------------------------------- ------------------------------ ----------

2 4071321146 E89E8DA2866E3157E043DE07A8C09238 PDB$SEED READ ONLY

3 1930201447 E89E9418B882350CE043DE07A8C092B6 PDBEPPS READ WRITE

方式2：

SQL> alter session set container=PDBEPPS;

Session altered

SQL> startup

Pluggable Database opened

蛋白质三级结构数据库是《生物信息学》里面的内容。

简单来说就是已知一段氨基酸序列的空间构象（三级结构），若另一蛋白质分子中含有这段氨基酸序列，就可以大致推断这个蛋白质的空间构象（三级结构），而由这些已知的氨基酸序列的三级结构构成的库就是相应的数据库_蛋白质三级结构数据库。

也就是说如果将一个未知的蛋白质分子的氨基酸序列进行分段，而每段氨基酸序列之前有人对其空间构象和功能进行了研究并有了结果，然后上传到数据库里，那么我们就可以在已知数据库里面进行搜索匹配（那个未知蛋白质要先做氨基酸测序），然后用能够匹配的序列的空间构象来推测我们要测的蛋白质的空间构象，进而分析这个未知蛋白质的功能。

这是数据库的一个作用，另一个作用是用来分析物种的亲缘关系，至于其他作用要去看《生物信息学》这本书。

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蛋白质数据库

1 PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库，包含超过142,000条蛋白质序列(至99年9月)，其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。所有序列数据都经过整理，超过99%的序列已按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PSD的注释中还包括对许多序列、结构、基因组和文献数据库的交叉索引，以及数据库内部条目之间的索引，这些内部索引帮助用户在包括复合物、酶－底物相互作用、活化和调控级联和具有共同特征的条目之间方便的检索。每季度都发行一次完整的数据库，每周可以得到更新部分。

PSD数据库有几个辅助数据库，如基于超家族的非冗余库等。PIR提供三类序列搜索服务：基于文本的交互式检索；标准的序列相似性搜索，包括BLAST、FASTA等；结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索，包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。

PIR和PSD的网址是：>

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