DIP有多个不同的释义,具体如下:
1、DIP:数字图像处理
数字图像处理(Digital Image Processing)是通过计算机对图像进行去除噪声、增强、复原、分割、提取特征等处理的方法和技术。数字图像处理的产生和迅速发展主要受三个因素的影响:
一是计算机的发展;二是数学的发展(特别是离散数学理论的创立和完善)三是广泛的农牧业、林业、环境、军事、工业和医学等方面的应用需求的增长。
2、DIP:软件设计原则
DIP是依赖倒转原则,依赖倒转原则的一种表述是:细节应当依赖于抽象,抽象不应当依赖于细节。另一种描述是:要针对接口编程,不要针对实现编程。
意思就是应当使用接口和抽象类而不是具体类进行变量的类型声明、参数的类型声明、方法的返回类型声明以及数据类型的转换等。要保证这一点,一个具体java类应当只实现java接口和抽象java类中声明过的方法,而不应当给出多余的方法。
3、DIP:蛋白相互作用数据库
DIP(Database of Interacting Protein),也叫蛋白互作数据库,是研究生物反应机制的重要工具。DIP 可以用基因的名字等关键词查询,使用上较方便。至2002 年6 月,已收录了约一万八千个蛋白质间的相互作用信息条目。
4、DIP:金属制品
DIP一种特殊合金材料,经过特殊热处理工艺及在工艺过程温度1000-1500范围调节,在表面可生成一层20微米厚的优质绝缘层,此材料可加工成销、管及各种形状,主要用于高温、绝缘环境下保护某些产品部位,像汽车工业中螺栓、螺帽的焊接。
5、DIP:英文单词
DIP,英语单词,动词、名词,作动词时意为“ 浸,蘸;(使)下降,下沉,减少;(把手、工具)伸入(袋子、容器);扒窃;动用(资金);浏览(书籍);(给牲畜)洗药浴;制作(蜡烛);给某人施洗礼;(道路、地面)向下倾斜;放下,下移。
参考资料来源:百度百科-DIP:英文单词
参考资料来源:百度百科-DIP:金属制品
参考资料来源:百度百科-DIP:软件设计原则
参考资料来源:百度百科-DIP:数字图像处理
参考资料来源:百度百科-DIP:蛋白相互作用数据库
一、查询基因并下载相关数据Step 1 直接在网站检索框输入检索内容,如“TP53”,输入完之后,就可以得到 TP53 这个基因在所有数据当中的情况。其中就包括这个基因在全基因组 CRISPR 当中的情况,基本的分析结构,基因突变和拷贝数变化情况等等。
Step 2 可以在扰动效应( Perturbation Effects ) 查看 TP53 在基因组 CRISPR 当中的重要性。gene effect 越越提示该基因可能与细胞的生长相关,得分0位不相关,而-1的得分对应于所有常见必需基因的中值。
Step 3 而在特征(Characterization)则可以观察 TP53 在不同的细胞系当中的各个组学的情况。如表达数据,拷贝数变异,甲基化等,点击某一个特征可以下载该基因在本特征中表达的数据情况。
Step 4 predictability可以预测两个特征之间的相关性。
二、查看和筛选细胞系
Step 1 Cell Line Selector 来选择目标细胞系。
Step 2在这里定义好之后,后续的分析都可以对目标细胞系进行特殊的可视化,如果没有,则点击 Creat custom list 来进行细胞系定义,并可以根据表头的信息进行筛选。默认的界面包括了细胞系名称以及细胞系所属组织。我们可以在右侧添加其他信息来进行筛选。例如我们想要筛选具有 MSI 的细胞。就可以添加一个细胞系的 MSI 特征的列。然后通过筛选功能,就可以得到 MSI 的细胞系是哪些了。
三、数据探索 两个特征相关性
Step 1 点击“ data explorer ”
Step 2选择X Y轴的项目,右边可以展示两者相关性。
Step 3 选择项目-名称-数据库即可开始plot图,可以下载表达数据。
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