几种常用Web数据库的比较

当前比较流行的Web数据库主要有：SQL Server、MySQL和Oracle。这3种数据库适应性强，性能优异，容易使用，在国内得到了广泛的应用 1．SQL Server 是微软公司从Sysbase获得基本部件的使用许可后开发出的一种关系型数据库。目前最新的版本是SQL Server 2000，但SQL Server 70仍在广泛使用。 由于均出自微软之手，使得SQL Server和Windows、IIS等产品有着天然的联系。事实上以Windows为核心的几乎所有微软的软件产品都采用了一致的开发策略，包括界面技术、面向对象技术、组件技术等，这样在微软的软件中很多都可以相互调用，而且配合得非常密切。因此如果用户使用的是Windows *** 作系统，那么IIS、 SQL Server就应该是最佳的选择。 2．MySQL 是当今Unix或Linux类服务器上广泛使用的Web数据库系统。它于1996年诞生于瑞典的TcX公司，支持大部分的 *** 作系统平台。MySQL的设计思想快捷、高效、实用。虽然它对ANSI SQL标准的支持并不完善，但支持所有常用的内容，完全可以胜任一般Web数据库的工作。由于它不支持事务处理，MySQL的速度比一些商业数据库快 2～3倍，并且MySQL还针对很多 *** 作平台做了优化，完全支持多CPU系统的多线程方式。 在编程方面，MySQL也提供了C、C++、Java、Perl、Python和TCL等API接口，而且有MyODBC接口，任何可以使用ODBC接口的语言都可以使用它。更重要的是，MySQL的源代码是公开的，可以免费使用，这就使得MySQL成为许多中小型网站、个人网站追捧的明星。 3．Oracle 是Oracle公司开发出的一种面向网络计算机并支持对象关系模型的数据库产品。它是以高级结构化查询语言为基础的大型关系数据库，是目前最 流行的客户/服务器体系机构的数据库之一。目前广泛使用的版本是Oracle 8i,它之所以备受用户喜爱是因为它具有以下突出的特点： （1）支持大型数据库、多用户和高性能的事务处理。Oracle支持最大数据库，其大小可达到几百千兆，可充分利用硬件设备；支持大量用户同时对数据库执行各种数据 *** 作，并使数据征用最小，保证数据一致性；系统维护具有很高的性能，Oracle每天可连续24小时工作， 正常的系统 *** 作（后备或个别系统故障）不会中断数据库的应用；可在数据库级或子数据库级上控制数据的可用性。 （2）Oracle 遵守数据库存取语言、 *** 作系统、用户接口、和网络通讯协议的工业标准，所以它是一个开放系统，保护了用户的投资。美国标准化和技术研究所（NIST）对Oracle Server进行过检验，完全与ANSI/ISO SQL89标准相兼容 （3）实施安全性控制和完整性控制。Oracle为限制系统对各监控数据库存取提供可靠的安全性，并为可接受的数据指定标准，保证数据的完整性。 （4）支持分布式数据库和分布式处理。Oracle为了充分利用计算机系统和网络，允许将处理分为数据库服务器和客户应用程序处理，所有共享的数据管理由数据库管理系统的计算机处理，而运行数据库应用的工作站集中于解释和显示数据。通过网络连接环境，Oracle将存放在多台计算机上的数据组合成一个逻辑数据库，可被全部网络用户存取。分布式系统像集中式数据库一样具有透明性和数据一致性。 上面介绍的3种数据库产品是目前最常用的3种大型关系数据库系统，它们虽然在体系结构和 *** 作方法上有许多相似的地方，但是在应用环境上还是各有侧重的。一个应用系统在选用数据库时，性能和价格时首先要考虑的两个因素，表1-1列出了这3种数据库在性能和价格上的对比情况，在使用时不同的系统应针对实际情况采用合适的方案。 从用户的技术水平以及国内软件应用的现状来看，SQL Sever应该是一个较好的选择，尤其是对初学者而言。

管理方法如下。

在UE侧固定Rxbeam，测量gNB侧不同的Txbeam，向基站发送SRS即可。

SRS采用全菜单驱动方式，用户可以同SRS 迅速地访问生物分子数据库和文献数据库，包括EMBL、EMBL_NEW、SWISS-PROT、PIR等一级数据库，还包括许多二级数据库，如蛋白质家族和结构域数据库PROSITE、限制酶数据库ReBase、PDB序列子集数据库NRL_3D、真核基因启动子数据库EPD、Ecoli 数据库ECD、酶名称和反应数据库ENZYME、生物计算文献数据库SEQANALREF等，还有与功能、疾病相关的数据库，总共有80个数据库。SRS在欧洲、亚洲、太平洋地区、南美洲等地方都有镜像站点，在中国的镜像站点建立在北京大学生物信息中心。除了查询和获取数据功能之外，SRS还带有许多嵌入式工具，如分子疏水性显示、相似序列搜索、多重序列比对等工具。

ipr表示的是iProclass：一个涉及蛋白质家族、功能与结构信息的综合数据库。数据库可以通过>

将PIR、SWISS-PROT和TrEMBL3个蛋白质数据库统一-起来组建而成，包含3个部分:

(1)

UniProt

Knowledgebase

(UniProtKB)

，这是蛋白质序列、功能、分类、交叉引用等蛋白质知识库，记录经过人工筛选和注释;

■

(2)

UniRef

(

UniProt

Non-redundant

Reference

)

数据库，将密切相关的蛋白质序列组合到一条记录中，以便提高搜索速度;目前，根据序列相似程度形成3个子库，即UniRef100、UniRef90和UniRef50;

■

(3)

UniParc

(UniProt

Archive)，是UniProt存档库

,

收录所有蛋白质序列。用户可以通过文本查询数据库，可以利用BLAST程序搜索数据库，也可以直接通过FTP下载数据。

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

1、UniProt数据库

蛋白组学常用数据库UniProt（全称UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的，其信息量丰富、资源广泛，是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

2、The Human Protein Atlas数据库

The Human Protein Atlas内含近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，并提供免费查询。

瑞典Knut&Alice Wallenberg基金会利用免疫组化技术，检查每一种蛋白质在人类48种正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员校对和标引，保证染色结果具有充分的代表性。

3、PhosphoSitePlus数据库

PhosphoSitePlus数据库是一个由CST和NIH联合开发的免费资源数据库，总结归纳了海量通过科学研究发现的蛋白修饰位点，包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等，并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白修饰位点。

该数据库是动态的、开放的、高度互动并持续更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理细胞/组织中的作用，同时它也是发现新的疾病标志物和药物靶点的有力工具。

性能及历史

蛋白质数据库（HPDB），建于2005年5月，动态展示生物大分子立体结构，鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离，可用于教学或科研。服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者。

分子结构特征描述采用汉语，同时提供英文原文以供考证。对于善于使用英文的读者，我们提倡直接访问RCSB PDB，一来可以减少网络拥挤，二来可以减少由于HPDB的翻译不妥带来的不便。

蛋白质数据库（HPDB）对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译（最新加入数据库的分子除外），内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库，因此HPDB支持中文查询。

蛋白质数据库（HPDB）虽然翻译了“分子结构说明”部分，但为了保证数据的可靠性和准确性，HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动，数据库保持RCSB PDB核实后的原始实验数据文件，并保持PDB文件格式和蛋白质分子编号。

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