ncbi，embl和什么并称三大数据库

DDBJ:DNA Data Base of Japan 是日本人建立的核酸数据库；

NCBI中的Genbank是美国建立的核酸数据库；

EMBL是欧洲建里的核酸数据库；

这三个数据库是连通的，数据共享。

GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区（CDS）特征的注释，还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。完整的GenBank数据库包括序列文件，索引文件以及其它有关文件。索引文件是根据数据库中作者、参考文献等建立的，用于数据库查询。GenPept是由GenBank中的核酸序列翻译而得到的蛋白质序列数据库，其数据格式为FastA。GenBank中最常用的是序列文件。序列文件的基本单位是序列条目，包括核苷酸碱基排列顺序和注释两部分。目前，许多生物信息资源中心通过计算机网络提供该数据库文件。下面，我们介绍序列文件的结构。GenBank序列文件由单个的序列条目组成。序列条目由字段组成，每个字段由关键字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次关键字或特性表说明符开始。每个序列条目以双斜杠“//”作结束标记。序列条目的格式非常重要，关键字从第一列开始，次关键字从第三列开始，特性表说明符从第五列开始。每个字段可以占一行，也可以占若干行。若一行中写不下时，继续行以空格开始。[链接12311-1]。序列条目的关键字包括LOCUS(代码)，DEFINITION(说明)，ACCESSION(编号)，NID符(核酸标识)，KEYWORDS(关键词)，SOURCE(数据来源)，REFERENCE(文献)，FEATURES(特性表)，BASECOUNT(碱基组成)及ORIGIN(碱基排列顺序)。先版的核酸序列数据库将引入新的关键词SV(序列版本号)，用“编号版本号”表示，并取代关键词NID。LOCUS(代码)：是该序列条目的标记，或者说标识符，蕴涵这个序列的功能。例如，图41中所示的HUMCYCLOX表示人的环氧化酶cyclooxygenase。该字段还包括其它相关内容，如序列长度、类型、种属来源以及录入日期等。说明字段是有关这一序列的简单描述，如本例为人环氧化酶-2的mRNA全序列。ACCESSION(编号)：具有唯一性和永久性，如本例中代码M90100用来表示上述人环氧化酶-2的mRNA序列，在文献中引用这个序列时，应该以此编号为准。KEYWORDS(关键词)字段：由该序列的提交者提供，包括该序列的基因产物以及其它相关信息，如本例中环氧化酶-2(cyclooxygenase-2)，前列腺素合成酶(prostaglandinsynthase)。SOURCE(数据来源)字段：说明该序列是从什么生物体、什么组织得到的，如本例中人脐带血(umbilicalvein)。次关键字ORGANISM(种属)指出该生物体的分类学地位，如本例人、真核生物等等(详见图41)。REFERENCE(文献)字段：说明该序列中的相关文献，包括AUTHORS(作者)，TITLE(题目)及JOURNAL(杂志名)等，以次关键词列出。该字段中还列出医学文献摘要数据库MEDLINE的代码。该代码实际上是个超文本链接，点击它可以直接调用上述文献摘要。一个序列可以有多篇文献，以不同序号表示，并给出该序列中的哪一部分与文献有关。FEATURES(特性表)：具有特定的格式，用来详细描述序列特性。特性表中带有‘/db-xref/’标志的字符可以连接到其它数据库，如本例中的分类数据库（taxon9606），以及蛋白质序列数据库（PID：g181254）。序列中各部分的位置都在表中标明，5’非编码区(1-97)，编码区(98-1912)，3’非编码区(1913-3387)，多聚腺苷酸重复区域(3367-3374)，等等。翻译所得信号肽以及最终蛋白质产物也都有所说明。当然，这个例子只是特性表的部分注释信息，但已经足以说明其详细程度。接下来是碱基含量字段，给出序列中的碱组成，如本例中1010个A，712个C，633个G，1032个T。ORIGIN行是序列的引导行，接下来便是碱基序列，以双斜杠行“//”结束。infomatics/Web/CharpterFour/43htm"target="_blank">）。UniProt包含3个部分：（1）UniProtKnowledgebase（UniProt），这是蛋白质序列、功能、分类、交叉引用等信息存取中心；（2）UniProtNon-redundantReference（UniRef）数据库，该数据库将密切相关的蛋白质序列组合到一条记录中，以便提高搜索速度；目前，根据序列相似程度形成3个子库，即UniRef100、UniRef90和UniRef50；（3）UniProtArchive（UniParc），是一个资源库，记录所有蛋白质序列的历史。用户可以通过文本查询数据库，可以利用BLAST程序搜索数据库，也可以直接通过FTP下载数据。蛋白质分析数据库（uniprot）：对uniprot蛋白数据库，包括其数据和序列格式，检索工具以及一些免费工具做出详细的介绍。简单的说，GenBank是核苷酸数据库，RefSeq是基因数据库，UniProt是蛋白质数据库。他们之间无疑有着很深的联系，但区别在于数据库系统，形式，和范围。希望能够帮到你！

如下：

1、试了先登入orcid，然后点ncbi下面的注册账号链接，就能看到orcid的图标，点链接就自动转入注册账号了。ORCID账号注册起来都很方便。只需要有个邮箱就可以注册，而且注册完成后在日后投稿时也能用上，目前很多期刊都要求作者关联自己的 ORCID 账号，现在注册也算未雨绸缪。

2、或者Microsoft账号注册，只要买过新电脑的（苹果电脑不算哈），应该都注册过，就是你的 Outlook 邮箱，直接用它登陆就好啦！注意从NCBI的主页进去，右上角就有一个sign up to NCBI。

从NCBI注册，别从PUBMED进去你先进NCBI主页，之后点一下MY NCBI，在Use name处填写你自己想取的用户名（相当于网名，在其下方输入密码（自己设定），然后点一下SIGN IN即可。

ncbi注册账户的用处：

NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。

除了建有GenBank核酸序列数据库（该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构）之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。

生物信息学（Bioinformatics）是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。

具体而言，生物信息学作为一门新的学科领域，它是把基因组DNA序列信息分析作为源头，在获得蛋白质编码区的信息后进行蛋白质空间结构模拟和预测，然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。基因组信息学,蛋白质空间结构模拟以及药物设计构成了生物信息学的3个重要组成部分。从生物信息学研究的具体内容上看，生物信息学应包括这3个主要部分：(1)新算法和统计学方法研究；(2)各类数据的分析和解释；(3)研制有效利用和管理数据新工具。

生物信息学是一门利用计算机技术研究生物系统之规律的学科。

用户可以通过NCBI（National Center for Biotechnology Information 美国国家生物技术信息中心信息中心，隶属于NLM－美国国家医学图书馆）的主页使用GenBank。GenBank的宗旨是鼓励科研团体对DNA序列的获取，从而促进数据库中DNA序列的丰富和更新，所以NCBI对GenBank的数据使用与发送没有任何限制。用户可从GenBank主页上下载Banklt（NCBI提供的>

一 美国国家生物技术信息中心NCBI(National Center for

Biotechnology Information)

NCBI是一个极具人性化的网站,网站的主页清晰的阐明了NCBI所做的工作及相关领域最新的热点内容，新闻等。为了方便使用者更加熟练使用网站资源，NCBI在主页清晰的标注了站点导航，非常便于初学者熟悉和掌握NCBI的站内资源。

另外，NCBI将其网站资源列于主页左侧，其中包括：SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature

databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at

NCBI, Software engineering, Education, FTP site, Contact

information等等。

二EBI(European

Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European

Bioinformatics Institute（EBI）是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，位置座落于英国The Wellcome Trust

Genome Campus。EBI的任务就是确保分子生物与基因体的研究信息可以公开并且免费提供给科学社群，以促进科学进步。

EBI所提供的服务包括建立/维护数据库、提供分子生物相关信息服务、执行分子生物与计算分子生物研究；所服务的对象与研究人员扩及各产业，包括分子生物、基因体、医学与农业学术研究、农业、生物技术、化学与制药工业。

三DDBJ(DNA　Data Bank of

Japan)日本核酸数据库

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)

设立在日本国家遗传研究所（NIG），于1986年开始DNA数据库的构建工作。从一开始，DDBJ就作为国际性DNA数据库之一，发挥着重要的作用。它

首先反映的是日本国内数据库的资源，并与NCBI,EBI进行频繁的国际性合作。DNA序列中蕴含了大量的数据资源，比起其它生物学数据，它在阐述进化方面的作用更为直接。因此，探求DNA数据库，不仅是在生命科学方面的研究，更是为人类的发展谋福利。

DDBJ是日本唯一的DNA数据库，它从研究者那里收集DNA 序列并且给数据提交者一个国际公认的编码。DDBJ

主要从日本研究者那里收集数据，当然，它也接受外国研究者的数据并给以编码。

GenBank 是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区（CDS）特征的注释，还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。

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