用Sante MRI Viewe
Sante MRI Viewer是一款核磁共振图像查看软件,也就是核磁共振看片软件,软件可以获取到核磁共振设备里的图像,并将其展示给您,当然了,作为专业化的软件它枚那么简单,它还有交叉参考线、覆盖层、同步框架视图、同步水平窗口、同步视野等诸多实用性的功能。
Sante MRI Viewer主要特性
1、功能强大的DICOM图像查看器专门用于MRI研究。
2、与所有制造商的图像兼容。
3、飞机之间的交叉参考线。
4、系列之间的同步框架视图。
5、系列之间的同步水平窗口。
6、系列之间的同步视野。
7、覆盖层支持。
8、插值(平滑)缩放和高级缩放工具(例如缩放动态,缩放窗口)。
9、图像方向(翻转,旋转)。
10、高级投资回报率选择工具(自由手,魔杖,滴眼镜,矩形,圆形,椭圆形,多边形)。
11、ROI统计分析(像素数,最小值,最大值,平均值,标准偏差,面积,体积)。
12、系列之间的同步框架视图。
13、系列之间的同步水平窗口。
14、系列之间的同步视野。
15、测量工具(距离,角度,面积,体积)。
16、DICOM网络服务支持(C-FIND SCU,C-MOVE SCU,C-STORE SCU,C-ECHO SCU / SCP)。
17、综合数据库。
18、集成匿名器。
19、将DICOM文件转换为纯文本图像(jpg,tiff,png)。
20、创建DICOM CD-ROM。
21、在线,区分大小写的帮助。
Sante MRI Viewer新功能介绍
1、双显示器支持。
2、数据库和网络表格的新布局比1366x768这样的小屏幕分辨率的作品更胜一筹。
3、增加了对结构化报告的支持。
4、在状态栏上添加了一个学习框架指示器。
5、新的菜单命令“帮助检查更新”允许用户检查更新的版本。
6、新的菜单命令允许用户在数据库中发送选定的系列。
7、新的菜单命令允许用户在C-STRORE SCP中发送选定的系列。
8、新的菜单命令允许用户从文件夹创建DICOM CD / DVD。
9、批量匿名处理器支持自动生成的患者姓名和ID。
10、将ROI导出到Word文档。
11、打开包含DICOM图像的zip文件。
12、速度优化。
一、名词解释:
1、生物信息学:生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础,应用
计算机技术,研究生物学数据的科学。
2、相似性(similarity):两个序列(核酸、蛋白质)间的相关性。
3、同源性(homology):生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4、同一性(identity):两个序列(核酸、蛋白质)间未发生变异序列的关系。
5、序列比对(alignment):为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性
,而将它们按照一定的规律排列。
6、生物数据库检索(database query,数据库查询):对序列、结构以及各种二
次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。
7、生物数据库搜索(database search):通过特定序列相似性比对算法,找出核
酸或蛋白质序列数据库中与待检序列具有一定程度相似性的序列。
二、简答题:
1、分子生物学的三大核心数据库是什么?它们各有何特点?
GenBank核酸序列数据库;SWISS-PROT蛋白质序列数据库;PDB生物大分子结构数
据库;
2、简述生物信息学的发生和发展。
20世纪50年代,生物信息学开始孕育;
20世纪60年代,生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来;
20世纪70年代,生物信息学的真正开端;
20世纪70年代到80年代初期,出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析
方法;
20世纪80年代以后,出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库;
20世纪90年代后,HGP促进生物信息学的迅速发展。
3、生物信息学的主要方法和技术是什么?
数学统计方法 ;动态规划方法 ;机器学习与模式识别技术;数据库技术及数据
挖掘 ;人工神经网络技术;专家系统;分子模型化技术;量子力学和分子力学
计算;生物分子的计算机模拟;因特网(Internet)技术
4、常见的DNA测序方法有哪些?各有何技术特点和优缺点?
Maxam-Gilbert DNA化学降解法:优点:可测完全未知序列及CG富含区;缺点: ***
作繁琐;
Sanger双脱氧链终止法:优点:简便,可测较长片段;缺点:需已知部分序列或
加接头;
焦磷酸测序:优点:廉价、高通量;缺点:一次测序片段短。
5、分子生物学数据库有哪些类型?各有何特点?
基因组数据库:基因组测序
核酸序列数据库:核酸序列测定
一次数据库:蛋白质序列数据库:蛋白质序列测定。生物大分子(蛋白质)三维结
构数据库:X-衍射和核磁共振
特点:数量少,容量大,更新快
二次数据库:上述四类数据库和文献资料为基础构建
特点:数量多,容量小,更新慢
6、简述NCBI Entrez系统的功能。
高级检索系统;查找核酸、蛋白、文献、结构、基因组序列、大分子三维结构、
突变数据、探针序列、单核苷酸多态性等数据。
7、简述NCBI BLAST的功能和种类。
序列相似性比对工具;
对核酸:普通blastn,对高度相似序列megablast;
对蛋白质:普通blastp,对保守域rpsblast;
对人工翻译序列:核酸翻译序列对蛋白质序列blastx,蛋白质对翻译序列tblastn
,核酸翻译序列对翻译序列tblastx;
其它:基因组blast,基因表达序列搜索GEO blast,序列两两比对……
8、举例说明生物信息学软件的应用。
9、生物芯片制作和分析过程中可以应用哪些生物信息学软件。
三、论述题:
1、什么是生物信息学?生物信息学有哪些主要应用领域?
生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础,应用计算机技术,研
究生物学数据的科学。
生物分子数据的收集与管理;数据库搜索及序列比较;基因组序列分析;基因表
达数据的分析与处理;蛋白质结构预测。
2、生物信息学在医药领域有什么应用?
辅助诊断(遗传病,HLA分型);
研究药物作用机制,辅助新药物开发和制造。
3、人类基因组计划中主要使用的那些生物信息学手段?它们对人类基因组计划发
挥了哪些重大作用?
单一测序结果判读;contig和chromosome拼接;识别基因区及其调控区;寻找基
因相互作用的时空关系;
4、试述蛋白质二级结构预测的主要策略和方法。
策略:
目标:判断每一段中心的残基是否处于a螺旋、b折叠、b转角(或其它状态)之一
的二级结构态,即三态。
a、理论分析法(从头计算法):通过理论计算(分子力学、分子动力学等)进行
结构预测。优点:不需要经验数据,由一级结构推测高级结构
缺点:天然和未折叠蛋白间能级差很小 (kcal/mol);蛋白质可能的构想空间庞大
,针对蛋白质折叠的计算量巨大;计算模型中力场参数不准确。
b、统计方法:对已知结构的蛋白质进行统计分析,建立序列到结构的映射模型,
进而根据映射模型对未知结构的蛋白质直接从氨基酸预测结构。
经验性方法:根据一定序列形成一定结构的倾向进行结构预测。通过对已知结构
的蛋白质进行统计分析,发现各种氨基酸形成不同二级结构的倾向,从而形成一
系列关于二级结构预测的规律。
结构规律提取方法:从蛋白质结构数据库中提取关于蛋白质结构形成的一般性
规律,指导建立未知结构的蛋白质模型。
同源模型化方法:通过同源序列分析或模式匹配,预测蛋白质的空间结构或结
构单元。
方法:
1、Chou-Fasman方法;(基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法,由Chou 和
Fasman在20世纪70年代提出来。通过统计分析,获得每个残基出现于特定二级结
构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。)2、
GOR方法;(是一种基于信息论和贝叶斯统计学的方法GOR将蛋白质序列当作一连
串的信息值来处理;GOR方法不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响,而
且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响)3、基于氨基酸疏水性的方法;4、最
邻近方法;5、人工神经网络方法;6、综合方法:7、利用进化信息预测蛋白质的
应该在软件中的时候把他保存为格式就可以了
如果不行 将拍片子的软件整体考进u盘 这样资料库也就一起进去了 回去可以打开
楼下对不起 这种反片的格式应该不是格式 我们影像上叫这种底片类型的叫反片
这种洗出来后如果想扫描到电脑上需要透扫仪器的
如果猜测 应该不是格式 但是因为是特殊仪器的软件 应该是固定的数据库文件
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