国际著名的三大蛋白质数据库

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

1、UniProt数据库

蛋白组学常用数据库UniProt（全称UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的，其信息量丰富、资源广泛，是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

2、The Human Protein Atlas数据库

The Human Protein Atlas内含近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，并提供免费查询。

瑞典Knut&Alice Wallenberg基金会利用免疫组化技术，检查每一种蛋白质在人类48种正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员校对和标引，保证染色结果具有充分的代表性。

3、PhosphoSitePlus数据库

PhosphoSitePlus数据库是一个由CST和NIH联合开发的免费资源数据库，总结归纳了海量通过科学研究发现的蛋白修饰位点，包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等，并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白修饰位点。

该数据库是动态的、开放的、高度互动并持续更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理细胞/组织中的作用，同时它也是发现新的疾病标志物和药物靶点的有力工具。

性能及历史

蛋白质数据库（HPDB），建于2005年5月，动态展示生物大分子立体结构，鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离，可用于教学或科研。服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者。

分子结构特征描述采用汉语，同时提供英文原文以供考证。对于善于使用英文的读者，我们提倡直接访问RCSB PDB，一来可以减少网络拥挤，二来可以减少由于HPDB的翻译不妥带来的不便。

蛋白质数据库（HPDB）对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译（最新加入数据库的分子除外），内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库，因此HPDB支持中文查询。

蛋白质数据库（HPDB）虽然翻译了“分子结构说明”部分，但为了保证数据的可靠性和准确性，HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动，数据库保持RCSB PDB核实后的原始实验数据文件，并保持PDB文件格式和蛋白质分子编号。

1、数据库（database，DB）

作用是数据库中的数据按一定的数学模型组织、描述和存储，有组织，可共享的数据的集合。具有较小的冗余，较高的数据独立性和易扩展性，并可为各种用户共享。

2、硬件

构成计算机系统的各种物理设备，包括存储所需的外部设备。作用是硬件的配置应满足整个数据库系统的需要。

3、软件

包括 *** 作系统、数据库管理系统及应用程序。数据库管理系统是数据库系统的核心软件，作用是在 *** 作系统的支持下工作，科学地组织和存储数据，高效获取和维护数据的系统软件。其主要功能包括数据定义功能、数据 *** 纵功能、数据库的运行管理和数据库的建立与维护。

4、人员

主要分类及其作用是系统分析员和数据库设计人员，负责应用系统的需求分析和规范说明，确定系统的硬件配置，并参与数据库系统的概要设计；应用程序员，负责编写使用数据库的应用程序，利用系统的接口或查询语言访问数据库；数据库管理员负责数据库的总体信息控制。

扩展资料：

数据库系统的模型

1、层次模型：用一颗“有向树”的数据结构来表示各类实体以及实体间的联系，树中每一个节点代表一个记录类型，树状结构表示实体型之间的联系。层次数据模型的提出，首先是为了模拟这种按层次组织起来的事物。层次数据库也是按记录来存取数据的。

2、网状模型：取消了层次模型的不能表示非数状结构的限制，两个或两个以上的结点都可以有多个双亲结点，则此时有向树变成了有向图，该有向图描述了网状模型。网状模型中以记录为数据的存储单位。记录包含若干数据项。

3、关系模型：基本假定是所有数据都表示为数学上的关系。关系数据模型以集合论中的关系概念为基础发展起来的。关系模型中无论是实体还是实体间的联系均由单一的结构类型关系来表示。

参考资料来源：百度百科-数据库系统

数据库系统一般由4个部分组成：

1、数据库是指长期存储在计算机内的，有组织，可共享的数据的集合。

2、硬件：构成计算机系统的各种物理设备，包括存储所需的外部设备。

3、软件：包括 *** 作系统、数据库管理系统及应用程序。

4、人员：主要有4类。第一类为系统分析员和数据库设计人员，系统分析员负责应用系统的需求分析和规范说明，和用户及数据库管理员一起确定系统的硬件配置，并参与数据库系统的概要设计。第二类为应用程序员，负责编写使用数据库的应用程序。第三类为最终用户，他们利用系统的接口或查询语言访问数据库。第四类为数据库管理员，负责数据库的总体信息控制。

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