蛋白质序列数据库的数据库分类

PIR数据库按照数据的性质和注释层次分四个不同部分，分别为PIR1、PIR2、PIR3和PIR4。PIR1中的序列已经验证，注释最为详尽；PIR2中包含尚未确定的冗余序列；PIR3中的序列尚未加以检验，也未加注释; 而PIR4中则包括了其它各种渠道获得的序列，既未验证，也无注释。除了PIR外，另一个重要的蛋白质序列数据库则是SwissProt。该数据库由瑞士日内瓦大学于1986年创建，目前由瑞士生物信息学研究所(Swiss Institute of Bioinformatics，简称SIB)和欧洲生物信息学研究所 EBI共同维护和管理。瑞士生物信息研究所下属的蛋白质分析专家系统(Expert Protein Analysis System,，简称ExPASy)的Web服务器除了开发和维护SwissProt数据库外，也是国际上蛋白质组和蛋白质分子模型研究的中心，为用户提供大量蛋白质信息资源。北京大学生物信息中心设有ExPASy的镜象。PIR和SwissProt是创建最早、使用最为广泛的两个蛋白质数据库。随着各种模式生物基因组计划的进展，DNA序列特别是EST序列大量进入核酸序列数据库。蛋白质序列数据库TrEMBL是从EMBL中的cDNA序列翻译得到的。TrEMBL数据库创建是于1996年[Bairoch, 2000]，意为“Translation of EMBL”。该数据库采用SwissProt数据库格式，包含EMBL数据库中所有编码序列的翻译。TrEMBL数据库分两部分，SP-TrEMBL和 REM-TrEMBL。SP-TrEMBL中的条目最终将归并到SwissProt数据库中。而Rem-TrEMBL则包括其它剩余序列，包括免疫球蛋白、T细胞受体、少于8个氨基酸残基的小肽、合成序列、专利序列等。与TrEMBL类似，GenPept是由GenBank翻译得到的蛋白质序列。由于TrEMBL和GenPept均是由核酸序列通过计算机程序翻译生成，这两个数据库中的序列错误率较大，均有较大的冗余度。另一个常用的蛋白质序列数据库是已知三维结构蛋白质的一级结构序列数据库NRL-3D[Namboodiri, 1990]。该数据库的序列是从三维结构数据库PDB中提取出来。

应用程序设计器配置应用程序与数据库间连接通数据库添加应用程序关系图查看、记录些数据库并连接引用应用程序作应用程序系统设计部包括设计关更信息请参见 应用程序关系图定义应用程序 应用程序间通信数据库连接应用程序数据库使用终结点现应用程序数据库使用终结点指定连接字符串连接同数据库两应用程序必相同连接字符串关更信息请参见 何:连接应用程序关系图应用程序 应用程序终结点概述说明:没选择数据源提供者显示选择数据源框便您选择数据源提供者否则显示连接属性框便您配置连接字符串虽取消两任务直接创建连接应确保执行请求连接代码前配置连接选择数据源提供者选择数据源框连接选择数据源提供者单击继续关更信息请参见 选择/更改数据源框配置连接字符串连接属性框配置连接字符串设置单击确定现条带箭连接线指示使用提供终结点通信向属性窗口数据库使用终结点连接字符串属性显示该连接字符串设置约束编辑器ConnectionStringsSection设置添加应用程序设置->目录->配置节点面应用程序定义关更信息请参见列主题: 添加/修改连接框(通用) 设置约束编辑器编辑连接字符串关系图选择数据库使用终结点关系图菜单指向实现选择定义连接字符串提示:右击数据库使用终结点选择定义连接字符串连接属性框编辑连接字符串单击确定连接字符串反映所做更改提示:通单击连接字符串属性省略号(…)按钮属性窗口编辑连接字符串旦实现应用程序应用程序配置文件编辑连接字符串关更信息请参见 何:实现应用程序关系图应用程序安全性旦实现或数据库使用终结点应用程序则数据库使用终结点配置任何连接字符串都现应用程序配置文件 connectionStrings 节默认情况些连接字符串未加密形式写入该文件关更信息请参见 实现应用程序注意事项请参见任务 何:应用程序关系图定义应用程序 演练:应用程序关系图定义应用程序参考 用于定义应用程序应用程序类型原型其资源 应用程序关系图定义通信路径

利用易语言编程环境创建一个“Windows窗口程序”。点击菜单“工具”->“支持库配置”项。

在打开的窗口中，找到并勾选“通用对象支持库

20版”，并点击“确定”以添加“超级列表框”组件。

接下来在“启动窗口”中绘制如图所示的界面，其中包括一个“外部数据库”和一个“超级列表框”（从扩展面板中可以找到）组件。

然后利用Excel创建一个名为“jiancexls”的Excel文件。其内容如图所示：

注：将该文件与易语言程序本身放置在同一目录下。

5、确保选中“启动窗口”，然后为其添加“创建完毕”事件。接着输入如图所示的易语言代码：

版本

2

支持库

iext

如果真

(外部数据库1打开

(“ODBC;DBQ=”

＋

取当前目录

()

＋

“\jiancexls;Driver={Microsoft

Excel

Driver

(xls)};DriverId=790;FIL=excel

80;MaxBufferSize=2048;MaxScanRows=8;PageTimeout=5;ReadOnly=0;SafeTransactions=0;Threads=3;UID=admin;UserCommitSync=Yes;”,

,

)

＝

假)

信息框

(“数据库连接失败！”,

#错误图标,

)

返回

()

如果真结束

查询语句

＝

“select

from

[Sheet1$]”

记录集

＝

外部数据库1查询

(查询语句)

如果真

(记录集

＝

0)

信息框

(“查询失败!”,

#错误图标,

)

返回

()

如果真结束

外部数据库1到首记录

(记录集)

局部_计次

＝

1

超级列表框1插入列

(,

“序号”,

80,

,

,

)

超级列表框1插入列

(,

“姓名”,

80,

,

,

)

超级列表框1插入列

(,

“性别”,

80,

,

,

)

超级列表框1插入列

(,

“年龄”,

80,

,

,

)

判断循环首

(外部数据库1尾记录后

(记录集)

＝

假)

局部_临时A

＝

外部数据库1读

(记录集,

1)

局部_临时B

＝

外部数据库1读

(记录集,

2)

局部_临时C

＝

到文本

(外部数据库1读

(记录集,

3))

索引

＝

超级列表框1插入表项

(,

,

,

,

,

)

超级列表框1置标题

(索引,

0,

到文本

(局部_计次))

超级列表框1置标题

(索引,

1,

局部_临时A)

超级列表框1置标题

(索引,

2,

局部_临时B)

超级列表框1置标题

(索引,

3,

局部_临时C)

外部数据库1到后一记录

(记录集)

局部_计次

＝

局部_计次

＋

1

判断循环尾

()

外部数据库1关闭记录集

()

可以使用Excel创建和编辑到外部数据源的连接，这些连接存储在工作簿或连接文件中。通过使用“工作簿连接”对话框，您可以轻松地管理这些连接，包括创建、编辑和删除它们。 了解数据连接 Excel2007 工作簿中的数据可以来自两个不同的位置。数据可能直接存储在工作簿中，或者也可能存储在文本文件、数据库或联机分析处理 (OLAP) 多维数据集等外部数据源中。外部数据源通过数据连接与工作簿建立连接，数据连接是一组描述如何查找、登录、查询和访问外部数据源的信息。 连接到外部数据源时，您还可以执行刷新 *** 作来检索更新后的数据。每次刷新数据时，您都会看到数据的最新版本，包括自上次刷新以来对数据进行的任何更改。 连接信息可以存储在工作簿或连接文件（例如 Office 数据连接 (ODC) 文件 (odc) 或通用数据连接 (UDC) 文件 (udcx)）中。连接文件对于以一致的方式共享连接以及方便数据源管理特别有用。 如果使用连接文件连接到数据源，则 Excel 会将连接信息从连接文件复制到 Excel 工作簿中。如果通过使用“连接属性”对话框进行更改，则您编辑的是存储在当前 Excel 工作簿中的数据连接信息，而不是可能用来创建该连接的原始数据连接文件，该文件由显示在“连接文件”属性中的文件名标识。一旦您编辑了连接信息（除了“连接名称”和“连接说明”属性），指向该连接文件的链接将被删除，“连接文件”属性也将被清除。 使用“工作簿连接”对话框管理连接 “工作簿连接”对话框可帮助您管理工作簿中的一个或多个到外部数据源的连接。您可以使用此对话框执行下列 *** 作： ·创建、编辑、刷新和删除工作簿中使用的连接。 ·验证外部数据的来源，这样做有若干原因，例如，连接可能是由其他用户定义的。 ·显示在当前工作簿中每个连接的使用位置。 ·诊断有关到外部数据的连接的错误消息。 ·将连接重定向到其他服务器或数据源，或者替换现有连接的连接文件。 ·显示“现有连接”对话框以创建新连接。 ·显示“连接属性”对话框，以便修改数据连接属性，编辑查询以及更改参数。 ·使创建连接文件以及与用户共享该文件变得轻松。 要管理当前工作簿中的连接，请执行下面的一项或多项 *** 作： 标识连接 在该对话框的顶部，工作簿中的所有连接都自动显示且带有以下信息：列注释名称 连接的名称，在“连接属性”对话框中定义。 说明 连接的可选说明，在“连接属性”对话框中定义。 上次刷新时间 上次成功刷新连接的日期和时间。如果为空，则说明连接从未刷新过。 添加连接 ·单击“添加”以显示“现有连接”对话框。 显示连接信息 ·选择一个连接，然后单击“属性”以显示“连接属性”对话框。 刷新外部数据 ·单击“刷新”旁边的箭头，然后执行下列 *** 作之一： ·要刷新特定的连接，请选择一个或多个连接，然后单击“刷新”。 要刷新工作簿中的所有连接，请清除所有连接，然后单击“全部刷新”。 要获取有关刷新 *** 作的状态信息，请选择一个或多个连接，然后单击“刷新状态”。 要停止当前的刷新 *** 作，请单击“取消刷新”。 删除一个或多个连接 ·选择要从工作簿中删除的一个或多个连接，然后单击“删除”。 注释  ·如果工作簿受保护或者一个使用该连接的对象（如数据透视表）受保护，则此按钮将被禁用。 删除连接将仅删除连接，而不会删除工作簿中的任何对象或数据。 要点   删除连接将断开到数据源的连接，并且可能会造成意外结果，例如不同的公式结果和其他 Excel 功能可能产生的问题。 显示工作簿中一个或多个连接的位置 ·选择一个或多个连接，然后在“此工作簿中使用连接的位置”下单击链接“单击此处以查看所选连接的使用位置”。 将显示以下信息。列注释工作表 使用连接的工作表。 名称 Excel 查询名称。 位置 对单元格、区域或对象的引用。 值 单元格的值，对于单元格区域，该值为空。 公式 单元格或单元格区域的公式。 该对话框的顶部选择其他连接将清除当前信息的显示。

外部数据源（EXTERNAL DATASOURCE）

外部数据源是SQL Server 2022引入的新功能，为PolyBase 查询创建外部数据源，执行数据虚拟化和数据加载或者使用 BULK INSERT 或 OPENROWSET 大容量加载 *** 作。

外部数据源可以是Oracle、Hadoop、Azure BLOB、AWS S3。

创建外部数据源时需指定凭证来通过指定凭证的身份验证连接数据源

外部表（EXTERNAL TABLE）

外部表是SQL Server 2016引入的新功能。 通过指定外部数据源和文件路径可以实现像查询数据库表一样的 *** 作访问到Azure BLOB、Hadoop（RCfile、分隔符、ORC格式数据）、关系型数据库（Oracle\MySQL）、NoSQL（mongodb）、外部文件、AWS S3。

CREATE EXTERNAL FILE FORMAT命令创建用于定义存储在 Hadoop、Azure Blob 存储或 Azure Data Lake Store 的外部数据或用于与外部流相关的输入和输出流的外部文件格式对象。 创建外部文件格式是创建外部表的先决条件。 通过创建外部文件格式，可指定外部表引用的数据的实际布局。

若要创建外部表，请参阅 CREATE EXTERNAL TABLE (Transact-SQL)。

支持以下文件格式：

带分隔符的文本

Hive RCFile - 不适用于 Azure Synapse Analytics。

Hive ORC - 不适用于 Azure Synapse Analytics。

Parquet

二维数据可视化支持在使用外部数据源创建场景，通过地图的方式展示您数据属性的状态，方便您查看并管理数据。

前提条件

已根据外部数据源内容，创建完成数据库。

创建二维数据可视化场景

登录物联网平台控制台，单击数据分析 > 实验室。

在实验室功能模板中，定位到空间数据可视化，并单击查看详情。

在空间数据可视化页面二维数据可视化页签下，单击“+”图标创建场景。

在d出对话框中，选择外部平台，单击下一步。

根据参数说明设置场景参数，并单击确定。



表 1 参数说明

参数 说明

场景名称 设置您的场景项目名称，支持中文字和英文字符，不超过12个字符。

数据源信息 您在物联网平台数据分析 > 数据源中创建的外部数据库，详情请参见外部数据源。

数据表信息 选择您数据库下的表。

选择经纬度 根据您的实际需求，从数据表下的字段中选择当经度和纬度的字段。

坐标系 当前支持两种坐标系。

02国测局：中国国测局地理坐标系（GCJ-02）。

84原始：世界标准地理坐标（WGS-84）。

系统进入新建的二维数据可视化场景中，可查看数据分布。



（可选）如果当前地图样式不符合需求，也可以在地图右下角单击“”图标切换地图样式。

配置d框和图标

将地图放大（zoom级别大于16时），显示详细的数据点。

zoom级别小于16时，聚合显示该区域的数据点，需通过滚动鼠标或单击聚合显示的数据点，放大地图。

单击数据点图标，查看数据点信息d框。您可以自定义显示内容和图标。

说明 如果该地理位置同时有多个数据点，单击数据点图标看到数据点列表，单击查看，进入具体数据点d窗。

单击具体数据点气泡图标，由d框方式显示数据点的详细信息。您可以自定义显示内容和图标。



单击d窗配置，在d出对话框中勾选需要展示的数据点属性。

说明 目前仅支持展示布尔、枚举、数值、文本类型的属性，即该数据点其他类型的属性是不可选的状态。



单击确定使d框配置实时生效。

单击图标配置，在d出对话框中自定义数据点气泡图标的形状和数值。

说明 图标配置设置完成后，将应用于此数据表的所有数据点。



表 2 参数说明

参数 说明

图标形状 选择要展示的图标的形状。

图标数值 有如下两种设置方式。

不显示：属性点气泡图标下不显示数值。

某个数值类型的数据点属性：选中后，数据点气泡图标下会显示该属性的数值。

单击确定使图标配置实时生效。

场景发布后，数据点气泡图标直接以配置好的样式显示，点击数据点气泡图标可d出已配置好的对话框。

查看场景效果

根据您创建场景时设置的经纬度，地图中的数据点会有两种显示情况。

如果该地理位置仅有一个数据点，显示单个数据点d框。

您可以单击数据点气泡图标，在d框中查看已配置好的该数据点的信息。



如果该地理位置有多个数据点，显示聚合d框。

您可以单击数据点气泡图标，查看此处的数据点列表。单击某数据点右侧的查看，d出该数据点的具体信息d框。



更多可视化工具

二维数据可视化服务提供诸多工具，排列在地图上方，来协助您更好的管理数据点和配置场景。



工具 说明

value下拉框 可从下拉框中选择想要在地图中显示的数据字段。

“”图标 通过设置参数，可筛查和过滤数据字段。筛查与过滤参数设置说明如下：

筛查标题设置：输入筛查标题。

筛查字段：从下拉框中选择需要筛查的字段。

热力图 通过热力图，查看数据点的分布以及数据点属性功能显示。详情请参见热力图。

*** 作 说明

编辑 编辑场景信息，参数说明请参见本文上方场景参数说明。

预览 单击进行全屏预览。按Esc键退出全屏。

分享 您可以将链接分享给其他人。支持的两种分享方式：

授权登录访问：通过授权手机号码分享场景，适合单独使用二维数据可视化服务的场景。

免登录访问：生成一个无需登录就能访问的URL，用户通过该URL直接访问已编辑好的二维数据可视化场景，适合需要将二维数据可视化做嵌入集成的用户或企业。

具体 *** 作请参见分享场景。

Windows Vista 和 Windows Server 2008 以及更高版本

以下过程通过使用具有高级安全 Microsoft 管理控制台 (MMC) 管理单元的 Windows 防火墙来配置该 Windows 防火墙。从 Windows Vista 和 Windows Server 2003 开始提供此管理单元。高级安全 Windows 防火墙仅配置当前配置文件。有关高级安全 Windows 防火墙的详细信息，请参阅配置 Windows 防火墙以允许 SQL Server 访问。

打开 Windows 防火墙的端口以进行 TCP 访问

在“开始”菜单上，单击“运行”，键入 WFmsc，然后单击“确定”。

在“高级安全 Windows 防火墙”的左窗格中，右键单击“入站规则”，然后在 *** 作窗格中单击“新建规则”。

在“规则类型”对话框中，选择“端口”，然后单击“下一步”。

在“协议和端口”对话框中，选择 TCP。选择“特定本地端口”，然后键入数据库引擎实例的端口号，例如默认实例的端口号 1433。单击“下一步”。

在“ *** 作”对话框中，选择“允许连接”，然后单击“下一步”。

在“配置文件”对话框中，选择在您想要连接到数据库引擎时描述计算机连接环境的任何配置文件，然后单击“下一步”。

在“名称”对话框中，输入此规则的名称和说明，再单击“完成”。

在使用动态端口时打开对 SQL Server 的访问

在“开始”菜单上，单击“运行”，键入 WFmsc，然后单击“确定”。

在“高级安全 Windows 防火墙”的左窗格中，右键单击“入站规则”，然后在 *** 作窗格中单击“新建规则”。

在“规则类型”对话框中，选择“程序”，然后单击“下一步”。

在“程序”对话框中，选择“此程序路径”。单击“浏览”，导航到要通过防火墙访问的 SQL Server 实例，再单击“打开”。默认情况下，SQL Server 位于 C:\Program Files\Microsoft SQL Server\MSSQL10_50MSSQLSERVER\MSSQL\Binn\Sqlservrexe。单击“下一步”。

在“ *** 作”对话框中，选择“允许连接”，然后单击“下一步”。

在“配置文件”对话框中，选择在您想要连接到数据库引擎时描述计算机连接环境的任何配置文件，然后单击“下一步”。

在“名称”对话框中，输入此规则的名称和说明，再单击“完成”。

网络查询解决方案：

Step 1: 在服务器图标上单击右键，选择property，然后选connection，把allow remote connection选上，这一步的目的是让数据库允许远程连接。

Step 2: 在数据库服务器图标上，展开目录，找到Security下的Logins子目录树，设置SA账户的属性，改password，在status栏里，login选上enable。这一步的目的是，允许远程客户端使用sa用户邓肯，sa是system administrator的缩写，拥有数据库最高管理权限，默认状态下是禁用的。

Step3：在数据库服务器图标上右键，打开Facets选项把RemoteDacEnabled的value改成true。这一步的目的是允许建立远程专用管理员连接，此种连接拥有最高权限，即使无法建立标准连接，也可以建立DAC连接。

Step4：开启服务，打开SQL Server Configuration Tool，打开网络配置，选择TCP/IP协议，点开属性，IP地址填数据库所在服务器的IP地址，如果是本地服务器，填127001。

以上就是关于蛋白质序列数据库的数据库分类全部的内容，包括:蛋白质序列数据库的数据库分类、如何与外部数据库实现连接、如何用易语言 *** 控Excel里面数据等相关内容解答，如果想了解更多相关内容，可以关注我们，你们的支持是我们更新的动力！