SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列,并与其它30多个数据建立
了交叉引用,其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。SWISS-PROT数据库包含了EMBL核酸序列数据库中被经过仔细检查和准确注释了
的蛋白质序列,一般地,任何蛋白质序列数据的搜寻和比较都应从SWISS-PROT开始。
SWISS-PROT蛋白质序列数据由大量序列条目组成,每一个序列条目
有其自己的格式。为了标准化的目的,SWISS-PROT的格式与EMBL核酸序列数据库的格式尽可能类似。SWISS-PROT涉及已知蛋白质的序列、
引用文献信息、分类学信息、注释等,注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关
系、序列变异体和冲突等信息。利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的数据库。SWISS-PROT只接受直接测序
获得的蛋白质序列,序列提交可以在其Web页面上完成。
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