如何把excel转成vcf的方法

在 Excel 中经常录入好数据以后都需要转成VCF格式，或许有的朋友还不会怎么转换成VCF，具体该怎么做呢?接下来是我为大家带来的如何把excel转成vcf的 方法 ，供大家参考。

如何把excel转成vcf的方法：

Excel转VCF步骤1：首先将EXCEL的里面的格式通讯录做成Outlook Experss所识别的.txt文档格式，并导入Outlook Experss电话簿中。将Excel表中内容调整如下：

Excel转VCF步骤2：将表中内容复制到txt文档中

Excel转VCF步骤3：再将txt文档内容复制到Word中

Excel转VCF步骤4：将Outlook Express所识别的格式导出，以制作其所识别的txt格式(Outlook Express所在位置如下图)

Excel转VCF步骤5：自建一条记录，并将其导出成txt格式文本

Excel转VCF步骤6：导出步聚，选择“文本文件(以逗号分隔)”，导出

Excel转VCF步骤7：选择txt文档格式保存

Excel转VCF步骤8：复制所导出文件中的分隔符号“，”

Excel转VCF步骤9：使用Word中的批量替代功能，将内容转成所需格式和字符

Excel转VCF步骤10：将Word中的通讯录内容，复制到txt文档中，并保存!(注意：txt文档首行，为导入时的识别字段，勿乱改!)

Excel转VCF步骤11：将outlook express通讯簿的内容清空

Excel转VCF步骤12：打开通讯簿“文件”-“导入”-“ 其它 通讯簿”

Excel转VCF步骤13：选择“文本文件(以逗号分隔)”选项导入所保存的txt文档

Excel转VCF步骤14：导入中

Excel转VCF步骤15：导入成功后关闭outlook express

Excel转VCF步骤16：再将outlook express的电话簿导入到outlook 2007的联系人中。并从此中导出.vcf格式文件打开outlook2007，并打开导入和导出向导，并选择“从另一程序或文件导入”按下图选择

Excel转VCF步骤17：选择“Outlook Express...”项，并一直选择“下一步”

Excel转VCF步骤18：直至选择“是”

Excel转VCF步骤19：等待导入中

Excel转VCF步骤20：成功导入后图片

Excel转VCF步骤21：转换名片发送的形式导成vcf格式在联系人内容中，CTR+A全选所有数据，单击右键，并选“作为名片发送”

Excel转VCF步骤22：效果如下：

Excel转VCF步骤23：将附件全选复制：

VCF是Variant Call Format的简称，该格式文件是专门用于存储基因序列突变信息的一种文本文件，包括单碱基突变SNV、单核苷酸多态性SNP、InDel、拷贝数变异CNV和结构变异SV等，文件可以采取editplus或pilotedit(建议)打开查看，其二进制存储格式是BCF。vcf文件后续可以用于多种分析，包括但不限于：进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分析等。vcf文件格式如下：

VCF文件开头是整体的注释信息，以##作为起始，其后接FILTER、INFO、FORMAT等，其中##FILTER开头的行是vcf主体record中第七列缩写词的说明、##INFO开头的行注释vcf主体record中第8列的缩写字母、##FORMAT开头的行注释第九列的缩写字母。

在header之后，vcf主体的每一行是一条record，固定列有9列，以及在之后的第十列，它们分别是：

第一列：#CHROM，染色体号

第二列：POS，在染色体上的位置

第三列：ID，突变名称，一般只有人类才有dbSNP编号，以rs开头

第四列：REF，参考基因组碱基类型，必须大写

第五列：ALT，变异碱基类型，大写，多个以逗号分隔，‘.'表示缺失

第六列：QUAL，变异检测质量值，越高越可靠

第七列：FILTER，标记过滤结果的列：通过质控过滤标准的标记为‘PASS’，后续可用其他工具进行挑选过滤

第八列：INFO，附加信息列，附加信息的注释在header的##INFO中

第九列：FORMAT，后面信息的说明列

第十列开始为样品信息：GT=genotype、AD=碱基支持数量、DP=测序深度总和、PL=归一化后基因型的可能性、GQ=PL判读的基因型的质量值，其中当第二小的值小于99时，有必要怀疑基因型的可靠性。

vcf文件基本由bam文件生成，当得到排序并建立索引的bam文件后，可以使用多种工具例如bcftools、gatk、freebayes、lumpy、delly、varscan2等处理得到。

处理vcf格式文件的软件有许多种，包括：bcftools、vcftools、gatk、python_pyvcf、plink等。

———以上属个人理解与记录

表格文件如何转成VCF文件方法如下：

第一，直接在Excel中点“文件”-->另存为，“保存类型”选择“CSV(逗号分隔)(*.csv)”，写好文件名然后点“确定”。

第二，将文件导入到Outlook中。

第三，进入Outlook地址簿中，点击“文件”-->导出-->名片，默认的扩展名就是VCF，任起一个文件名即可

第四，下载安装使用pc套件，进行同步，设置从电脑导向手机。

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