它与 一 种主要文件类型相关联,但经常以 SpeedGrade Color Mask File 格式出现。 MASK 文件主要归类为 Settings Files。
可以在 Windows 和 Mac上查看 MASK 文件扩展名。 主要是桌面平台哪喊和含缓贺某些移动平台支持这些文件。 这些文件的普及性为 低谈派 ,这意味着它们并不常见。
(1)首先,利用con命令选择出原始dem数据中的nodata部分并给其赋值(可赋任意值,本文中这里赋为-1),具体命令如下:con(Isnull(dem),-1,dem)。该命令所运行的结果作为nibble命令的input文件。(2)将原始的dem数据作为mask文件。悄斗当然,你也可以利用isnull命令选择出来的nodata部拿码分进行setnull得消运哪到mask文件。关键是要确保无数据部分的类型是nodata。
(3)准备好了input文件和mask文件,我们就可以利用nibble命令来处理了,具体命令如下:nibble(input,mask)
首先了解一下MASK文件在FMRI中,MASK也是一副脑图,如果用看图软件(如MRIcron,REST
Viewer等)打开一副MASK,就会发现,这幅图上面的数值,只有0或者1。MASK脑图通常的作用是去掉我们不感兴趣的区域。我分一下几个步骤介绍。
(1)如何做MASK
得到MASK的方式有很多,比如我们做完统计检验,可以得到一张T图,卡完阈值后,我们可能只对某一个特定的cluster感兴趣,这样我们就可以做一个mask,这个mask只包括我们特定感兴趣的cluster。或者是,我们对某一个AAL脑区感兴趣,想把这个脑区做成MASK。
以上两种情况,在RESTplus的Viewer里面,都可以根据自己的抢矿,单独保存某一个指定的cluster(选中cluster后,点击save
cluster按钮即可)。存下来会得到两个文件,有一个是binary的,即,脑图如穗只包括0或1。
注:假如我们的cluster是从其他软件得到的,要自己把cluster文件做渣衡卜成只包拦源含0或1的文件,使用RESTplus里面的image
calculator,载入该cluster的文件,标号为i1,在公式的位置输入,i1./i1即可生成该脑图的binary文件。也就是说,我们用该脑图自己除以自己,有值的位置就会变成1,原来没有值的位置仍然是0.
(2)MASK重采样。
当我们把MASK用于脑图文件时,没有重采样是常见错误。因为我们做完的MASK的维度或voxel
size,很有可能和我们脑图的维度或voxel size是不吻合的。这样在使用的时候就会提醒矩阵不匹配一类的错误。
重采样使用的工具是RESTplus里的,Reslice Image工具。
(3)应用MASK
得到我们所需要的MASK后,要将MASK用于我们的脑图中。可以使用Image
calculator,载入MASK文件,然后载入脑图文件,使用公式i1.*i2即可。
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