因子载荷矩阵热力图怎么看

因子载荷矩阵热力图怎么看,第1张

1、用于表示地图中点的密度的热图。它使人们能够独立于缩放因子感知点的密度。现今热力图在网页分析、业务数据分析等其他领域也有较为广泛的应用。
2、热力图是指将特定区域中的数据点进行叠加计算,通过颜色渐变反应数据点密度,颜色越深则数据密度越大。热力图可以反映出不同区域的各种信息,通常适用于数据量比较多且在一定地域范围内相对密集的业务场景,比如展示某个商圈的人流分布、物流企业在某区域的网点数量分布情况。

参考学习资料:

按照教程拿到数据查看数据情况:

教程提到:

原文作者是用的RPM标化的数据并进行了初步的过滤。
先用作者的数据进行PCA和热图查看分组是否合理。
拿到数据后先看了下初步结果,发现组内差异就比较明显

回去看看这12个样本的简介:

意思是说作者将肝脏暴露在毒物TAA的作用下24,48小时后,分别纯化收取野生型的肝脏细胞和癌旁的肝脏细胞然后进行的RNA-seq。 由上图可以看到肿瘤组3个样本异质性比较大,对照组也不太整齐,TAA暴露组24,48小时干预后的结果比对照有所增加,其中48小时干预组增加更明显。

下面是化PCA图和热图:

虽然从PCA图上看分组没有太明显的异常,但是从热图上还是可以看出是可以分开成2个矩阵进行比较的结果。还是挺有意思的,一般来说干预样品需要4-6个重复,这个实验只设计了2个重复,但是重复性还都挺好的,也是蛮厉害了。

相关性热图是用来展示数据之间的关系的一种图表。如果想要了解数据之间的关系,就需要看原始数据。比如,如果我们想知道一个人的身高和体重之间的关系,就需要先收集这个人的身高和体重数据,然后用相关性热图来展示它们之间的关系。但如果只看相关性热图而不看原始数据,就无法准确地了解这两个数据之间的关系。

生信热图相关系数情况:

绝对值在08 以上:强相关

绝对值在05-08:中等程度相关

绝对值在03-05: 相关程度一般

绝对值在03 以下:弱或者不相关


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