这是一个比您上面提供的版本快得多的版本,并且在没有权重的情况下也使用简化的公式来获得更快的结果。
def gini(x, w=None): # The rest of the pre requires numpy arrays. x = np.asarray(x) if w is not None: w = np.asarray(w) sorted_indices = np.argsort(x) sorted_x = x[sorted_indices] sorted_w = w[sorted_indices] # Force float dtype to avoid overflows cumw = np.cumsum(sorted_w, dtype=float) cumxw = np.cumsum(sorted_x * sorted_w, dtype=float) return (np.sum(cumxw[1:] * cumw[:-1] - cumxw[:-1] * cumw[1:]) / (cumxw[-1] * cumw[-1])) else: sorted_x = np.sort(x) n = len(x) cumx = np.cumsum(sorted_x, dtype=float) # The above formula, with all weights equal to 1 simplifies to: return (n + 1 - 2 * np.sum(cumx) / cumx[-1]) / n
这是一些测试代码以检查我们是否(大致)获得相同的结果:
>>> x = np.random.rand(1000000)>>> w = np.random.rand(1000000)>>> gini_max_ghenis(x, w)0.33376310938610521>>> gini(x, w)0.33376310938610382
但是速度却大不相同:
%timeit gini(x, w)203 ms ± 3.68 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)%timeit gini_max_ghenis(x, w)55.6 s ± 3.35 s per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
如果从函数中删除pandas ops,它已经快得多了:
%timeit gini_max_ghenis_no_pandas_ops(x, w)1.62 s ± 75 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
如果您想获得最后的性能下降,可以使用numba或cython,但这只会获得百分之几的收益,因为大部分时间都花在了排序上。
%timeit ind = np.argsort(x); sx = x[ind]; sw = w[ind]180 ms ± 4.82 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
编辑 :gini_max_ghenis是Max Ghenis的答案中使用的代码
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