NCBI是指美国国立生物技术信息中心,建立关于分子生物学,生物化学,和遗传学知识的存储和分析的自动系统,实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的,先进方法的研究,加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用,全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。
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高性能服务器集群
生物信息高性能计算集群,节点处理器主频24GHz,物理核心总数736个,内存总容量3200GB;具备集群基础软件环境、应用开发环境、生物信息软件环境。
高性能服务器
每秒15000亿次,160核CPU,640G内存,30T硬盘存储。感兴趣的话点击此处,了解一下蛋白质数据库介绍
蛋白质数据库
1 PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,包含超过142,000条蛋白质序列(至99年9月),其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。所有序列数据都经过整理,超过99%的序列已按蛋白质家族分类,一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PSD的注释中还包括对许多序列、结构、基因组和文献数据库的交叉索引,以及数据库内部条目之间的索引,这些内部索引帮助用户在包括复合物、酶-底物相互作用、活化和调控级联和具有共同特征的条目之间方便的检索。每季度都发行一次完整的数据库,每周可以得到更新部分。
PSD数据库有几个辅助数据库,如基于超家族的非冗余库等。PIR提供三类序列搜索服务:基于文本的交互式检索;标准的序列相似性搜索,包括BLAST、FASTA等;结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索,包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。
PIR和PSD的网址是:>
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