参加培训班——最快速的方法。有些生物信息公司会针对高校教师和医师开生信培训班，我导师带着我上过几次，有TCGA、Oncomine和R的。缺点是价格贵，一次一天两三千，优点是上手快，而且会有后续服务，比如课上完后你在qq群里提问，一般公司技术人员都会给你解决。我放几张上完培训班后发的资料，是课上PPT转的PDF。另外再推荐一本中文教材，可以做补充用。优点是浅显易懂，缺点是不够深入且作者态度傲娇，但书还可以，《R语言与Bioconductor-生物信息学应用》，随着大数据时代的到来，各种生物类公共数据库井喷，其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库。TCGA由NCI牵头，作为美国攻克癌计划的一个大项目，投入了巨大的人力和物力，系统提供了癌症多组学测序和芯片数据，包括Gene expression, DNA methylation, Copy NumberVariation, Mutation等结果，同时也附有相应各测序样本的完整临床资料。TCGA为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,这为挖掘有意义的基因组变化和发现影响肿瘤起始、发展、分化、转移等生物学机制提供了海量数据基础。然而传统的基础医学和转化医学研究者缺乏信息学基础来处理大规模癌症数据,因而在面对这些极其有价值的基因组数据时,往往心有余而力不足。作为医学信息领域研究者,我们需要将信息学和统计学知识运用到癌症基因组学数据分析的研究当中,作为连接大数据与基础医学研究者之间的一个纽带,帮助研究者去更好地挖掘探索这些数据。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/可以查询基因蛋白序列。还能查询部分文献。分子生物学最重要的一个网站，没有它，很多事情就会变得很麻烦，如同源基因的比对、查询。
下面是介绍：http://www.biosino.org/pages/ncbi-1.htm
NCBI(美国国立生物技术信息中心)简介
》》》NCBI 资源介绍
介绍
理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表，出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。
国立中心的建立
后来的参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性，发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心（NCBI）的立法。NCBI是在NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。NLM是因为它在创立和维护生物信息学数据库方面的经验被选择的，而且这可以建立一个内部的关于计算分子生物学的研究计划。NCBI的任务是发展新的信息学技术来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程的理解。它的使命包括四项任务：
建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统
实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究
加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。
全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。
NCBI通过下面的计划来实现它的四项目的：
基本研究
NCBI有一个多学科的研究小组包括计算机科学家，分子生物学家，数学家，生物化学家，实验物理学家，和结构生物学家，集中于计算分子生物学的基本的和应用的研究。这些研究者不仅仅在基础科学上做出重要贡献，而且往往成为应用研究活动产生新方法的源泉。他们一起用数学和计算的方法研究在分子水平上的基本的生物医学问题。这些问题包括基因的组织，序列的分析，和结构的预测。目前研究计划的一些代表是：检测和分析基因组织，重复序列形式，蛋白domain和结构单元，建立人类基因组的基因图谱，HIV感染的动力学数学模型，数据库搜索中的序列错误影响的分析，开发新的数据库搜索和多重序列对齐算法，建立非冗余序列数据库，序列相似性的统计显著性评估的数学模型，和文本检索的矢量模型。另外，NCBI研究者还坚持推动与NIH内部其他研究所及许多科学院和政府的研究实验室的合作。
数据库和软件
在1992年10月，NCBI承担起对GenBank DNA序列数据库的责任。NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库。同美国专利和商标局的安排使得专利的序列信息也被整合。
GenBank是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。这三个组织每天交换数据。
GenBank以指数形式增长，核酸碱基数目大概每14个月就翻一个倍。最近，GenBank拥有来自47,000个物种的30亿个碱基。
孟德尔人类遗传（OMIM），三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB），唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图谱，分类学浏览器，同国立癌症研究所合作的癌症基因组剖析计划（CGAP）。
Entrez是NCBI的为用户提供整合的访问序列，定位，分类，和结构数据的搜索和检索系统。Entrez同时也提供序列和染色体图谱的图形视图。Entrez是一个用以整合NCBI数据库中信息的搜寻和检索工具。这些数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。Entrez的一个强大和独特的特点是检索相关的序列，结构，和参考文献的能力。杂志文献通过PubMed获得，PubMed是一个网络搜索界面，可以提供对在MEDLINE上的九百万杂志引用的访问，包含了链接到参与的出版商网络站点的全文文章。
BLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。BLAST能够在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。NCBI提供的附加的软件工具有：开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，和序列提交工具，Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以从WWW或FTP来获得。NCBI还有E-mail服务器，提供用文本搜索或序列相似搜索访问数据库一种可选方法。
教育和训练
NCBI通过赞助会议，研讨会，和系列演讲来培养在应用于分子生物学和遗传学的计算机领域的科学交流。一个科学访问学者项目已经成立，来培养同外部科学家的合作。作为NIH内部的部分研究项目，也提供博士后工作位置。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/About/index.html
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关于Database的一般介绍
Human Genome人类基因组数据介绍
其他基因组数据介绍
工具概述
其他各项介绍
NCBI癌症基因组研究介绍
NCBI－Coffee Break
NCBI－基因和疾病
如今乳腺癌发病率很高。我在一所初中工作。女性教职工大概有100名左右。乳腺癌有4名，都在45岁以上得的。具体什么类型不是很清楚，但都做了手术，相继做了化疗。手术最晚的有5年了。目前4人都很好，定期复查，都说没啥事。这样看来乳腺癌不可怕，只要不是很晚的那种晚期，基本都能治愈。
祝普天下所有女性 健康 顺遂！快乐永远！
评价癌症治疗效果常常用到“5年生存率”，是指生存时间超过5年的病人所占比例，包括已复发的病人和未复发的病人，若是没有复发就可以看作“临床治愈”。完全治愈的病人也非常多，但以目前的医疗手段没有办法提前预测哪些人是真的治愈、不会复发。
近些年乳腺癌早期检出率不断增高，加之医疗技术的发展，尤其新药研发、上市，我们国家乳腺癌5年生存率总体水平在70%左右，而京、津、沪等一些大城市乳腺癌5年生存率接近90%！与欧美发达国家不差上下，其中许多病人是无瘤状态度过了5年，也就有可能再跨过10年、20年……
乳腺癌治疗后会不会复发？预后怎么样？与很多因素有关，最主要的是肿瘤大小、淋巴结转移状态和病理学性质等3种因素。
01、肿瘤大小乳腺癌结构紊乱、细胞之间连接松散，癌细胞容易脱落游离，通过血液、或淋巴液向远处转移。发生转移的几率与肿瘤大小呈正向相关，肿瘤越大、转移的可能性越大，病人预后也就越差。
肿瘤大小也是TNM分期的3个依据因素之一，而分期早晚是乳腺癌预后最主要的决定因素。
02、淋巴结转移情况淋巴结转移状态是TNM分期又一依据，淋巴结阳性预后要差，而淋巴结转移数目多、或距离原发灶远，预后要更差一些。
乳腺癌是一种全身性疾病，预后还有很多因素影响。资料显示，大约1/3淋巴结阴性的乳腺癌病人也可能发生远处转移，比如骨转移，导致治疗失败。
03、病理学性质癌细胞未突破导管基底膜时为非浸润性癌，预后明显好于浸润性癌。乳腺非浸润癌有导管内癌和小叶原位癌，小叶原位癌发展缓慢、预后要好于导管原位癌。
治疗乳腺癌需要对其进行基因分型，也是判断预后的重要依据。根据雌激素（ER )、孕激素（PR )、Her-2以及Ki-67等4种因素把乳腺癌分4型，即LuminalA、LuminalB、Her-2阳性和三阴型，同样条件下乳腺癌的预后，LuminalA LuminalB Her-2阳性 三阴型。
我们国家乳腺癌发病率居女性恶性肿瘤的第一位，死亡率居第五位，是预后相对较好的疾病。遇见乳腺癌没法逃避，唯有科学抗癌，以分期、基因分型等情况选择最适宜的治疗方案，才有可能获得最佳的生存时间、生存质量，若没有任何抗肿瘤措施，乳腺癌的自然病程大概只有2-3年。我是 @刘永毅医生 ，感谢您的阅读！
乳腺癌的治愈率需要看乳腺癌的分期来决定。如果是很早期的乳腺癌，可以治疗效果很好。比如乳腺原位癌，10年生存率可以达到95%以上。当然还要看乳腺癌的类型，有一些早期或者中期的乳腺癌经过手术根治配合放化疗，还有内分泌治疗以及靶向药物治疗等综合治疗，也有可能达到治愈的效果。也就是超过5年没有复发，在临床上叫做临床治愈。当然并不是以后就一定不会复发，只是再复发的几率可能会降低很多，甚至比正常人得乳腺癌的几率还要更低一点。乳腺癌也是一种全身性的疾病，只能够边治疗边看。如果发现乳腺癌一定要早日治疗，包括手术和放化疗等综合治疗，这样可以提高治愈率。
“治愈”这两个字，其实在大众心目中和在医学上，有着明显的差异；大众理解的治愈指的是“使恢复 健康 ”，而医学上的临床治愈或癌症治愈率，一般指的是“五年生存率”。所以这区别非常大。
那么，乳腺癌的治愈率高吗？
一、科普一下：什么是癌症治愈率？
癌症的治愈、治愈率，与大众理解的完全不是一个概念。
在医学上，治愈率一般指的是五年的生存率。
五年生存率指的是肿瘤经过各种综合性的治疗以后，患者五年以上的比例是多数。
由于多数的肿瘤出现复发、转移一般是发生在治疗后的3年之内，极少的会发生在五年之后，所以我们通常认为如果肿瘤治疗后5年不再复发，那么再次复发的几率就非常小了。
所以通常用五年生存率来表示各种肿瘤的疗效情况。
那么，这个治愈率概念与大众理解的可能是完全不一样的。
大众理解的治愈，那可能就是完全治好了，而不是三年、五年或者多少年不出问题。
二、乳腺癌，治愈率高吗？
很多人认为，乳腺癌与其它恶性肿瘤一样，一旦确诊了就等于无药可救，就等于被判了死刑，等死就行了。
其实，这是一个错误的认识。
就乳腺癌而言，一期乳腺癌和原位癌如导管原位癌、小叶原位癌等，其5年生存率超过95%。
也就是说，只要乳腺癌能够做到早预防、早发现、早诊断、早治疗，其预后效果还是十分理想的。
由于乳腺癌比较理想的治愈率和治疗效果，有的学者甚至提出将乳腺癌慢病管理的思路，也就是说把乳腺癌与高血压、糖尿病一样看作慢性病来对待，坚持按时服药定期体检即可。
三、乳腺癌治愈率、治疗效果与哪些因素有关？
既然乳腺癌的治愈率如此之高，是不是乳腺癌发生后不需要担心？
其实并不是的，乳腺癌高的治愈率是建立在早发现、早诊断、早治疗的基础上；但如果发现时间晚，类型、大小等不理想，那么还是比较凶险的。
一般来讲，乳腺癌的预后效果与肿瘤大小、肿瘤位置、肿瘤分期、肿瘤类型，以及患者的身体情况等，有着密切的关系。
乳腺癌的治愈率即5年生存率，指患者存活时间 5年的人数比例，治愈的标准是乳腺癌患者存活时间 5年且无复发和转移。结合分期具体治愈率如下：
1、Ⅰ期：即早期，治愈率相对较高，5年生存率 90%；
2、Ⅱ期：即中期，5年生存率为80%-85%；
3、Ⅲ期：即局部晚期，5年生存率为50%-60%；
4、Ⅳ期：即晚期，5年生存率降至20%左右。
近年来随着乳腺癌治疗手段的不断提高，每期治愈率均有所提高。
乳腺癌这种疾病的治愈率也是很高的，对于早期确诊的乳腺癌，及时的进行治疗，5年的生存率达到90%以上，那么治愈率也非常高，那么也有一些病人确诊的时候已经处于进展期或者是晚期，可以根据病情的需要选择新辅助治疗，或者是术前的放射治疗，静脉化疗，以及选择姑息性的治疗，主要能够减轻肿瘤负荷，降低临床分期，在一定程度上也能够提高病人的生活质量，乳腺癌的治疗方法有很多种，具体也是根据病情来决定的，不同的病理分型预后生存时间等等，都有明显的差异，所以说每个病人都有不同，但是相比较其他部位的肿瘤，预后还是比较好的。
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一。在我国占全身各种恶性肿瘤的7%，呈逐年上升趋势。近年来，由于国家大力推行妇女“二癌筛查”工作，以及乳腺微创技术的广泛开展。乳腺癌的早查早治得以落实，导致乳腺癌的治愈率大幅度上升，其中京、津、沪一些大城市乳腺癌5年生存率接近90%！与欧美发达国家比较也是不差上下了。下面就从以下几方面和大伙聊下乳腺癌的有关知识。
什么原因导致了乳腺癌的发生？
据科学研究证实，以下是乳腺癌的风险因素：
这些因素是难以改变的致癌风险因素。但以下一些风险因素是可以通过行为改变来降低致癌风险的：
如何早期发现乳腺癌？乳腺癌与其他身体癌症疗效好的原因，就是有早期表现，所以容易早期发现乳腺癌。
乳腺癌的早期表现是病侧乳腺出现无痛、单发的小肿块。一旦发现乳腺包块，就应该找专科医生进一步查体格检查，然后再行超声检查进一步确诊，必要时，还可以行磁共振检查以进一步了解乳腺癌的侵犯范围以及癌细胞是否发生了转移，并确定治疗的方式。
国家推行的妇女“二癌筛查”，已经证实是早期发现乳腺癌非常有效的措施。
该如何预防乳腺癌？其实从病因中，也就告诉了我们该如何预防乳腺癌，哪就是：
总之，乳腺癌治愈率的高低主要取决于是否是早发现早治疗。而明确上述乳腺癌风险因素，做好乳腺癌风险因素预防，及时进行乳腺癌筛查，是早期发现乳腺癌的关键。
早期治疗，基本上可以治愈。
发现乳腺癌细胞增殖和转移“帮凶”-葡萄糖代谢与癌症扩散
肿瘤细胞的扩散速度可谓“惊人”，但是他们在能量供给方面，没有选择与正常细胞一样的有氧代谢，而是选择了低效能的糖酵解？这是为什么呢？是为了逃避人体自身的免疫系统识别吗？
近日，国际顶级期刊《Nature》（自然）发表了一个重量级的研究结果，对上述问题进行了解答。 Baylor医学院的Bert O’Malley研究团队首次发现6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶-4（PFKFB4）可以修饰蛋白质，作用于转录激活蛋白SRC-3，使其转录活性升高，进而成为乳腺癌细胞增殖和转移的帮凶。
这个研究首先是从SRC-3的研究开始的。O’Malley研究团队在几年前就发现了这一蛋白质，并将其命名为类固醇受体共激活因子-3（SRC-3，基因名为NCOA3）。SRC-3是一种基因表达调控因子，在癌症的蛋白转录中具有重要作用，并且在多种癌细胞中存在过量表达。磷酸化的SRC-3转录活性会进一步提升，已经成为多种癌症的生物标志物。
那么， 是哪种激酶影响SRC-3的转录活性呢？ 由于对SRC-3的研究处于前沿阶段，科研人员只能采用最笨的方法-“大海捞针”。他们利用RNA干扰技术（RNAi），筛选了636个人类激酶与SRC-3的相互作用结果，其中有10种激酶对SRC-3有调节作用，但是影响最大的一种激酶却是PFKFB4。
进一步的筛选发现，代谢激酶PFKFB4是SRC-3活性的最有影响的正调控剂，结合癌症细胞生长测定结果，PFKFB4也是调节细胞增殖的最主要激酶。降低PFKFB4表达水平可以使癌症细胞系中的SRC-3活性降低，通过腺病毒异位表达PFKFB4能够增强SRC-3的活性。一个有趣的现象是，SRC-3蛋白水平在PFKFB4异位表达后增加，但SRC-3信使RNA水平不受影响。
那么， 抑制PFKFB4或SRC-3真的能够影响体内乳腺癌的生长吗？
科研人员构建了一种MDA-MB-231细胞，能稳定表达非靶向的SRC-3。与对照小鼠比较， PFKFB4或SRC-3 不表达，可以显著降低肿瘤的生长和体积。通过生物发光成像技术，每周观察切除原发性肿瘤的小鼠，结果显示能够表达SRC-3的小鼠肿瘤发生了深度肺转移，而抑制SRC-3或PFKFB4表达小鼠体内，肺损伤均显著减少。病例分析结果显示不表达SRC-3或PFKFB4的小鼠肺中仅识别出几个微转移病灶，四周后没有观察到 健康 问题。
研究人员还给不表达SRC-3的小鼠补充正常的SRC-3，结果显示小鼠的肿瘤生长也恢复了正常。他们还设计了一种不能被PFKFB4激酶磷酸化的SRC-3，用被改造的SRC-3替换正常的SRC-3，也能够阻止癌症细胞的转移。
这次研究的另一重大发现是对PFKFB4功能的认识。在以前的研究中，科研人员并不认为它是一种蛋白激酶。本研究颠覆了以往的认知，发现PFKFB4不仅可以作用于蛋白质，还是一种果糖激酶，在糖酵解过程中起到关键作用。PFKFB4是葡萄糖代谢的重要调节因子，并指导大分子生物合成所需的代谢途径以维持癌细胞中的快速增殖。
研究人员通过分析癌症基因组图谱数据库（TCGA）的数据，发现在所有乳腺癌的亚型中，都存在PFKFB4过表达。证明PFKFB4-SRC-3通路是推动乳腺肿瘤发生的分子动力，导致其进入侵袭性转移性疾病。也就是说靶向PFKFB4-SRC-3通路可能在乳腺肿瘤中具有治疗价值，尤其依赖于糖酵解的乳腺癌。
您好，我是齐冬梅院长，一位中医肿瘤科的老中医，能有幸回答您这个问题，希望对您有所帮助。
乳腺癌发生在女性身上较多的一种癌症，根据数据现实结果有百分之九十九的乳腺癌患者都是女性，只有百分之一的乳腺癌是属于男性的，所以乳腺癌对于女性来说是危害极大的一种癌症，特别是到了一定年龄的女性，更加要注意乳腺部位是否出现异常的变化，很多时候乳腺癌病发的时候身体都会出信号提醒我们，但是人们却没有注意自己的身体变化，导致病情拖延时间一久病情就变得更加严重难以治疗，癌症就是尽早发现尽早治疗治愈的可能性才会更大。
乳腺癌目前治愈率已经逐渐在上升，乳腺癌能不能治愈主要还是看发现的早晚，乳腺癌如果在早期发现，治愈的可能性很高，只要及时将癌细胞切除掉，再加上术后的辅助治疗加以恢复，患者基本上就是可以完全治愈的，但是癌症最可怕的就是很难在早期发现，很多时候人们并不觉得自己的身体有什么问题，甚至平时还很 健康 的感觉，但是一旦有事到医院检查，一查就是患了癌症晚期，就像是自己突然患了癌症晚期一样，其实并不是这样的，癌症病发是很缓慢的，一个阶段性的疾病在时间的流逝下才会慢慢体现出来，而且很多时候癌症早期的症状还难以发现，甚至是体检检查都看不出来，所以才会有那么尽管年年做体检却查出癌症的时候还是晚期的病例。
乳腺癌最不容易治愈的就是在乳腺癌晚期的时候，由于此时癌细胞已经出现了扩散和转移，导致全身出现癌细胞的扩散，很难完全清除癌细胞，只能帮助患者进行有效控制癌细胞的进一步扩散，稳定患者的病情，帮助患者减轻痛苦提高生活治疗，患者可以采用中医治疗的方式帮助患者有效缓解症状和疼痛，中医三位一体疗法采用内服与外用的治疗方法帮助患者有效缓解和消除症状体征，同时提高患者全身免疫力，最终实现人与瘤和平共处，延长患者生存时间，提高患者生活质量。
相信在未来医学技术不断地发达，我们国家癌症的治愈率会越来越高，让人们不再感受到癌症的恐惧。我是齐冬梅院长，和癌症打了一辈子交道，大家有什么关于癌症的问题可以在评论区进行留言或者直接私信，我会尽力为大家一一回复。
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