CCLE数据库概要(第一节)

CCLE数据库概要(第一节),第1张

CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia),是由Broad Institute 研究所牵头的一项肿瘤基因组学研究项目,涵盖了三十多种组织来源上千种细胞系基因表达情况、突变、拷贝数、甲基化等,是研究肿瘤的利器。

二话不说,先上网址,赶紧注册使用吧。

网址: https://portals.broadinstitute.org/ccle/

首页很简洁,首先我们点击“About”,我们可以看到CCLE数据的基本信息,目前涵盖细胞系为1457,基因84434,特异性数据集136488,突变数据集1159663,分布信息集118661636,甲基化信息集411948577。点击“Open”,可以看到这1457个细胞系的占比。

点击空白处,可以SAVE图标,则可以加载如下页面,我们还可以通过该页面绘制表格。

点击柱形图中对应注释,则可以在饼图里取消该类,如我要取消NA,点击右侧NA的白色方框,则饼图中NA则去除了。

今天就对CCLE数据简单介绍下,接下来我们将会介绍如何利用CCLE绘制基因表达谱,咱们下次GO On。

这个简单了。Oracle的工具PL/SQL你应该会用吧?先建好你的新库,再用它对所有表建对应的视图(View),两个库用DBLink连接。这样你可以对视图进行所有可以对表的 *** 作。

修改答复:

建DBLink语句:

create database link PM

connect to user1 identified by "password1"

authenticated by user2 identified by "password2"

using 'PM'

建视图语句:

create or replace view TableTestView as

select

*

from TableTest@PM(PM为你登陆时的DataBase)

with read only(表示只读 *** 作,不写的话为可读写)

这两步可以在Command命令行执行,做完这两步后,在你的Views里可以看到你做对应表的视图了.包括表结构及所有数据.另外,以后表里每更新数据后,你的视图也会自动更新.

建议:自己动手做一下,不要光想着别人给你现成的代码!


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原文地址: https://outofmemory.cn/sjk/6658729.html

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